Co studentům nabízí Ústav ZF - Mendeleum Kolektiv pracovníků Mendelea

Laboratoř MOLEKULÁRNÍ GENETIKY Laboratoř IN VITRO TECHNICKÝ IZOLÁT Laboratoř APLIKOVANÉ VIROLOGIE

Laboratoř MOLEKULÁRNÍ GENETIKY Termockler pro Real Time - PCR termocyklery Kalibrační křivka pro kvantifikaci neznámé DNA

Genetický analyzátor - Transkripční profil - Sekvenace

Identifikace odrůd a klonů na základě jejich DNA profilů Termocyklery, Florometr Mikropipety Analyzátor suspenzí (buňky, zákaly – velikost, počet) Horizontální elektroforéza Identifikace odrůd a klonů na základě jejich DNA profilů Analýzy příbuznosti mezi odrůdami Studium epigenetických změn v souvislosti se stresem; studium exprese genů Identifikace a kvantifikace cílových sekvencí (GMO, viry popř. další choroby rostlin)

Hlubokomrazicí box -80°C Termokomora Centrifuga Box pro práci s RNA Fastprep, Vakuová odparka

Ozdravování rostlin in vitro (chemoterapie, termoterapie) Laboratoř IN VITRO Ozdravování rostlin in vitro (chemoterapie, termoterapie) Množení certifikovaných podnoží ovocných dřevin in vitro (GF 677, GF 305) Převody rostlin do nesterilních podmínek Kontakt: Ing. Břetislav Křižan Ph.D. Bretislav.Krizan@seznam.cz Kalusové kultury na třepačce Váhy Profimyčka

Preparace meristému česneku Česnek před odběrem meristému Regenerace rostlin z nodálních segmentů Foto B. Křižan Celkový pohled do kultivační místnosti Česnek regenerovaný z meristému

Regenerace GF 305-podnož broskvoní Multiplikační médium Zakořeňovací médium Multiplikace - Aronia melanocarpa Regenerace révy vinné z kalusových kultur

TECHNICKÝ IZOLÁT Laboratoř APLIKOVANÉ VIROLOGIE Účelem technického izolátu v Lednici je: Získávání a produkce certifikovaného viruprostého rozmnožovacího materiálu révy vinné a teplomilných peckovin pro prostorové izoláty v celé ČR Udržování zdravých matečných rostlin V laboratoři aplikované virologie se proto provádí testování rostlin na viry metodou ELISA

Pro technický izolát se provádí molekulární detekce virů a fytoplazem na révě a teplomilných peckovinách Analýza fytoplazmy metodou PCR Stolbur na révě Foto V. Holleinová Svinutka na révě Foto V. Holleinová Analýza svinutky metodou RT-PCR

Laboratoř ELISA Promývačka Spektrofotometr Digestoř Homogenizér Pozitivní vzorky na mikrotitrační desce

Technický izolát - Lednice Foto M. Adam a V. Holleinová

Seznámit se s prací v těchto laboratořích a naučit se ji můžete, když: budete studovat navazující magisterské studium: Program: N-ZI Zahradnické inženýrství Obor: Řízení zahradnických technologií Modul: Zahradnické biotechnologie

Řízení zahradnických technologií I.ročník Povinné předměty Garant Počet hodin Zimní semestr Letní semestr Zkouška Počet kreditů   př. cv. RLZ Řízení lidských zdrojů Prof. Tomšík 24 2 zk 4  Šlechtění rostlin a biotechnologie Doc. Pidra  4 Jazyk 1.sem. obecný Dr. Brešová 0  Kolokvium (ročníková práce) Doc. Salaš 72 3 2  Právo a podnikání Doc. Janků Management zahradnických provozů cvičení dle modulů Jazyk 2.sem. odborný  0 Praxe odborná (4 týdny)  6 Celkem 96 168 4 7

MOŽNOSTI VÝBĚRU Modul zahradnických biotechnologií Modul: jakost rostlinných potravinových zdrojů Modul: vinohradnictví a vinařství Modul zahradnických biotechnologií http://www.zf.mendelu.cz/cz/studium/studijni_plany

Modul zahradnických biotechnologií 1. ročník Povinně volitelné předměty Garant Počet hodin Zimní semestr Letní semestr Zkouška Počet kreditů   př. cv. Biotechnologie odpadů Doc. Zemánek 24 2 zk 4  Molekulární genetika eukaryot Doc. Pidra, Dr. Baránek 12 1 5  Základy funkční genomiky Doc. Pidra  4 Pokročilé biometrické metody Dr. Vachůn  3 Molekulární metody ve šlechtění rostlin 36 3  5 Aplikované biotechnologie Dr. Baránek Vinařská mikrobiologie Doc. Kyseláková Bioinformatika Dr. Vachůn , Dr. Baránek Celkem 132 6 5 8

Udržitelný rozvoj zemědělské krajiny Doc. Salašová - Doc. Kučera 24 12 II.ročník Povinné předměty Garant Počet hodin Zimní semestr Letní semestr Zkouška Počet kreditů   př. cv. Udržitelný rozvoj zemědělské krajiny Doc. Salašová - Doc. Kučera 24 12 2 1 zk 4  Obchod a logistika PEF, polovina externisté Kolokvium (ročníková práce) Doc. Salaš 36 3 2  Marketing zahradnictví a potravinářství PEF  5 Alternativní produkce v zahradnictví ZF Diplomová práce 20  Celkem 96 132 4 8

Modul zahradnických biotechnologií 2. ročník Povinně volitelné předměty Garant Počet hodin Zimní semestr Letní semestr Zkouška Počet kreditů   př. cv. cv Aplikované techniky in vitro v zahradnictví Prof. Hradilík, Dr. Křižan 24 48 1 2 zk 5  Symptomatologie a aplikovaná virologie Ing. Holleinová, Ing. Bláhová 3  Analytické laboratoře Dr. Balík, Ing. Kumšta  2 Metody analýzy potravin Prof. Goliáš 72 120 5 6 3

Molekulární genetika eukaryot Přednášky: Základy genetiky eukaryot, regulace genové exprese, molekulární mechanizmy přenosu signálů Cvičení: - Izolace DNA z rostlinných pletiv - Izolace DNA z lidské bukální sliznice - Analýza rostlinné DNA pomocí RAPD - Analýza lidské DNA (fingerprinting pomocí standardního kitu) Ukázka RAPD profilu

Základy funkční genomiky Struktura a organizace jaderného genomu - typy sekvencí a jejich uspořádání v genomu, submukroskopická struktura genomu a její souvislost s funkcí, mechanizmy změn velikosti a struktury genomu, metody studia velikosti a struktury genomu. Funkce genomu Mimojaderné genofory - struktura a funkce mitochondriového a chloroplastového genoforu, interakce jaderného a mimojaderných genomů. Variabilita a nestabilita genomu Metody studia genomu: sekvenační strategie, genové knihovny, reverzní genetika, analýzy proteomu a metabolomu Evoluce genomu; komparativní genomika prokaryot a eukaryot; souvislost makroevoluce a molekulární evoluce.

Pokročilé biometrické metody Předmět navazuje na základní znalosti získané v předmětu "Biometrika" případně "Statistika" na bakalářském stupni. V rámci předmětu Pokročilé biometrické metody budou studenti seznámeni se základy pokročilých vícerozměrných metod. V předmětu se studenti seznámí s praktickou aplikací širokého spektra vícerozměrných metod (vícerozměrná regrese, shluková analýza a další) v biologických vědních disciplínách.

Molekulární metody ve šlechtění rostlin Přínos molekulárních metod pro šlechtění rostlin, oblasti možných aplikací molekulárních metod, návaznost na klasické šlechtitelské programy. Cvičení: základní principy fungování PCR Real-time PCR ; základy měření výtěžku amplifikace a kvantifikace cílového templátu DNA využití DNA markerů při hodnocení genetické diverzity a identifikaci odrůd principy a rozdíly při praktických aplikacích nejčastěji používaných metod – RAPD, SSR a AFLP

Aplikované biotechnologie Cílem předmětu je na teoretické úrovni představit studentům nejpoužívanější praktické aplikace biotechnologických metod spolu s výraznými novými trendy v biotechnologiích, a to i mimo obor zahradnictví. V rámci cvičení se pak posluchači prostřednictvím praktických úloh seznámí s moderními přístroji využívanými v biotechnologických laboratořích. Program cvičení: Sekvencování neznámého DNA templátu a jeho identifikace na základě porovnání získané sekvence s veřejnými databázemi (4 hod.) In silico návrhy podmínek pro PCR a Real Time PCR na vybrané úseky DNA (4 hod.) Sledování exprese vybraných genů révy vinné pomocí Real Time PCR (4 hod.).

Bioinformatika Vědní obor na pomezí biologie a informatiky. Důraz je kladen na oblast databází z obecného hlediska a z hlediska molekulárně genetických databází. Využití dostupných on-line databází. analýzy získaných dat interpretaci modelových biologických procesů

Aplikované techniky in vitro v zahradnictví Mikropropagace zahradnických druhů rostlin spadajících do rodů (Prunus, Pyrus, Vaccinium, Rubus, Vitis, Actinidia, Rododendron, Syringa, Allium, a dalších). Multiplikace, zakořeňování, otužování, převody do nesterilních podmínek, mikroroubování (Prunus, Vitis), afinita. Ozdravování rostlin, termoterapie (Prunus, Vitis), chemoterapie, izolace meristému (Allium), kultivace meristémů Kalusové a suspenzní kultury, iniciace kalogeneze. V rámci cvičení je plánována odborná exkurse (Itálie) na pracoviště Vivai Piante Battistini s roční produkcí více než 5 mil. rostlin ovocných druhů.

Symptomatologie a aplikovaná virologie Cílem - rozšíření všeobecných znalostí ze zahradnické fytopatologie - praktické poznatky se zaměřením na symptomatiku, determinaci původců chorob a příčin poruch rostlin Praktická cvičení budou zaměřena na polní diagnostiku patogenů a diagnostiku na biologických indikátorech. Laboratorní cvičení budou orientována hlavně na detekci virů a fytoplazem pomocí imunoenzymatických metod (ELISA) a molekulárních metod (RT-PCR, Real-time RT-PCR). Posluchači budou seznámeni s technickým izolátem v Lednici a v rámci exkurze navštíví i další technické a prostorové izoláty a diagnostická pracoviště v ČR.

Pro studium těchto předmětů byla pro Vás na Mendeleu vybudována nová laboratoř s moderním vybavením.

Centrifuga, termocykler, orbitální třepačka Učebna

Kultivační komora Fotokomora, Horizontální elekroforézy, Analytická váha Mikrobiologický bezpečnostní box

Minimální počet studentů pro otevření modulu je 6. Cvičení bude probíhat v již zmiňované laboratoři maximálně po 12 studentech. Tento počet studentů umožňuje individuální přístup a Vám vše si vlastnoručně vyzkoušet.

Vaše možné budoucí uplatnění v praxi SRS–Státní rostlinolékařská správa ÚKZÚZ–Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský Firmy uplatňující In vitro množení Šlechtitelské stanice Semenářské firmy Manažeři prodeje - vybavení a spotřebního materiálu biotechnologických laboratoří Diagnostické a analytické laboratoře Výzkumné ústavy Česká zemědělská a potravinářská inspekce Práce v oboru fytopatologie

a v případě zájmu Vás rádi provedeme Děkuji za pozornost. Těšíme se na Vaše dotazy a v případě zájmu Vás rádi provedeme našimi laboratořemi.