Microarrays and chips M .Jurajda
High throughput techniques Snaha zvýšit množství zpracovaného materiálu a získaných dat za kratší čas. Větší nároky na přístrojové vybavení. Větší nároky na bioinformatickou podporu při zpracování dat.
High throughput techniques Arrays SAGE High-throughput sequencing
Co je microarray Skleněná nebo plastová destička/membrána s maticí mikroskopických bodů, které obsahují DNA sondy
K čemu je microarray dobrá? Technologie microarrays umožňuje analyzovat během jednoho experimentu až desetitisíce genů. Přináší ohromnou časovou úsporu a úsporu analyzovaného vzorku. Umožňuje automatizovat proces analýzy DNA
Nevýhody DNA microarrays Vyžadují obvykle nákladné přístrojové vybavení. Samotné arrays jsou poměrně nákladné, ale při přepočtu na analýzu jednoho genu je tato zpravidla levnější než při použití klasických postupů. Výsledky získané paralelním studiem několika tisíc genů vyžadují speciální postupy při statistickém zpracování.
Pracovní postup „spotování“ arraye – specializovaná firma Izolace analyzované DNA/RNA/cDNA Označení studované NA pomocí např. chemiluminiscenční značky. Hybridizace s array. Analýza v readeru Statistické zpracování (clusterová analýza)
Praktické použití DNA arrays Expression profiling Genotyping, SNP detection Comparative genomic hybridization
Podobné technologie Agilent Technology, Lab-on-a-Chip
Tissue microarrays
http://www.superarray.com http://www.home.agilent.com http://www.affymetrix.com http://en.wikipedia.org/wiki/Tissue_microarray