Microarrays and chips M .Jurajda.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Odběr a uchování biologického materiálu pro stanovení mRNA
Advertisements

Transkriptom.
Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller
Microarray Martin Erdös.
Expresní DNA microarray
Technologické aspekty čipových technologií Boris Tichý LÉKAŘSKÁ FAKULTA MASARYKOVY UNIVERSITY Interní hematoonkologická klinika LF MU a FN Brno.
Mikročipy ..
Delavnica za konfiguriranje dostopovnih točk RAČUNALNIŠKA OMREŽJA
Jan Coufal, Julie Šmejkalová, Jiří Tobíšek
Obvod a obsah kruhu Prezentaci Mgr. Jan Kašpara (ZŠ Hejnice) upravila a doplnila Mgr. Eva Kaucká e.
Opakování na 4. písemnou práci
rtinzartos Napište slova, která obsahují uvedená písmena.
Cvičení Úloha 1: Rozhodněte zda posloupnost znaků v poli délky n tvoří palindrom (slovo, které je stejné při čtení zprava i zleva). Př.: [a,l,e,l,a]
Slovní úlohy pro „autaře“
Emise a absorpce světla
NÁZEV ŠKOLY: Základní škola Hostouň, okres Domažlice,
Střední odborná škola a Střední odborné učiliště, Hradec Králové, Vocelova 1338, příspěvková organizace Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/
Dynamická pevnost a životnost Přednášky
Základy elektrotechniky
NÁZEV: VY_32_INOVACE_08_12_M9_Hanak TÉMA: Jehlan OBSAH: Objem
Seminář JČMF Matematika a fyzika ve škole
4.2 Deformace pevného kontinua 4.3 Hydrostatika
Tělesa –Pravidelný šestiboký hranol
NÁZEV ŠKOLY: Základní škola Hostouň, okres Domažlice,
Číselné soustavy a kódy
Jasnosti hvězd Lekce 10 Miroslav Jagelka.
Název prezentace (DUMu): Jednoduché úročení – řešené příklady
Konstrukce překladačů
Vysoká škola technická a ekonomická v Českých Budějovicích Ústav technicko-technologický Logistika zemního plynu v České republice Autor diplomové práce:
Rovinný úhel a jeho orientace
Ohmův zákon Praktické ověření.
SUPRASEGMENTÁLNÍ SLOŽKY FONOLOGICKÉHO SYSTÉMU
T - testy Párový t - test Existuje podezření, že u daného typu auta se přední pneumatiky nesjíždějí stejně. H0: střední hodnota sjetí vpravo (m1) = střední.
Střední odborná škola a Střední odborné učiliště, Hradec Králové, Vocelova 1338, příspěvková organizace Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/
FINANČNÍ ŘÍZENÍ V NNO – ÚČETNICTVÍ
Veterinární asanace Veterinárními asanačními činnostmi jsou
Infokanál obce Vigantice
CESTOVNÍ POJIŠTĚNÍ NA BC PRO ROK 2017
Název prezentace (DUMu) Stylistika: Slohové postupy a útvary
Název prezentace (DUMu): Trvalky kvetoucí na jaře A
Klima na Zemi a sluneční aktivita
Kdo jsem – domácí mazlíčci 
AUTOR: Mgr. Marcela Lazáková NÁZEV ŠKOLY:
Statistická indukce v praxi
Pedagogická psychologie PEPS B
CHCEME O TOM MLUVIT Dotační program Jihomoravského kraje Výzva: Preventivní programy realizované školami a školskými zařízeními v roce 2015.
NÁZEV: VY_32_INOVACE_08_01_M9_Hanak TÉMA: Soustavy lineárních rovnic
Anotace: prezentace slouží k procvičování vyjmenovaných slov po B
František Křižík 1847 – 1941 ČECH TECHNIK, PRŮMYSLNÍK, VYNÁLEZCE
Výukový materiál zpracován v rámci projektu
Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Číslo materiálu VY_32_INOVACE_22-14
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Konzervování a restaurování kamene
KOUŘENÍ RODINNÁ VÝCHOVA Mgr. Renata Šimková.
Název školy Základní škola a Mateřská škola Tatenice Číslo projektu
Tomáš Podermański, Top 10 Features that make IPv6 'greater' than IPv4 Proč IPv6 Top 10 Features that make IPv6 'greater' than IPv4.
Studená válka.
Výukový materiál zpracovaný v rámci projektu
Ing. Marcela Strakošová
VZNIK ČESKOSLOVENSKA.
MAPA SVĚTA AFRIKA.
Dvacáté století – vznik Československa
Zakavkazsko.
Osvobození československa (1.)
Magnetické pole.
Moderní metody analýzy genomu Čipové technologie I
Zpracování dat Lenka Radová
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
Geneticky podmíněné nemoci
Techniky molekulární biologie a genetiky
Transkript prezentace:

Microarrays and chips M .Jurajda

High throughput techniques Snaha zvýšit množství zpracovaného materiálu a získaných dat za kratší čas. Větší nároky na přístrojové vybavení. Větší nároky na bioinformatickou podporu při zpracování dat.

High throughput techniques Arrays SAGE High-throughput sequencing

Co je microarray Skleněná nebo plastová destička/membrána s maticí mikroskopických bodů, které obsahují DNA sondy

K čemu je microarray dobrá? Technologie microarrays umožňuje analyzovat během jednoho experimentu až desetitisíce genů. Přináší ohromnou časovou úsporu a úsporu analyzovaného vzorku. Umožňuje automatizovat proces analýzy DNA

Nevýhody DNA microarrays Vyžadují obvykle nákladné přístrojové vybavení. Samotné arrays jsou poměrně nákladné, ale při přepočtu na analýzu jednoho genu je tato zpravidla levnější než při použití klasických postupů. Výsledky získané paralelním studiem několika tisíc genů vyžadují speciální postupy při statistickém zpracování.

Pracovní postup „spotování“ arraye – specializovaná firma Izolace analyzované DNA/RNA/cDNA Označení studované NA pomocí např. chemiluminiscenční značky. Hybridizace s array. Analýza v readeru Statistické zpracování (clusterová analýza)

Praktické použití DNA arrays Expression profiling Genotyping, SNP detection Comparative genomic hybridization

Podobné technologie Agilent Technology, Lab-on-a-Chip

Tissue microarrays

http://www.superarray.com http://www.home.agilent.com http://www.affymetrix.com http://en.wikipedia.org/wiki/Tissue_microarray