Nástroje pro zpracování a grafickou úpravu sekvenčních dat

Slides:

Advertisements

Podobné prezentace

Advertisements

Molekulární základy dědičnosti

Od DNA k proteinu.

DISTANCE MATRIXCONTACT MAP 1AUG PDB -> CM. Kontakty – proč jsou zajímavé ? CM -> PDB ?

ONE TWO THREE FOUR FIVE SIX SEVEN EIGHT NINE TEN KLIKNĚTE NA ČÍSLA VE SPRÁVNÉM POŘADÍ.

Nástroje pro zpracování a grafickou úpravu sekvenčních dat Jaro 2015.

Název školy: Základní škola a mateřská škola Domažlice, Msgre B. Staška 232, příspěvková organizace Autor: Mgr. Jindřiška Šmídová Název : VY_32_INOVACE_10_Counting.

Název školy Plavská škola Autor Mgr. Jana Kneřová Název VY_32_INOVACE_20_MA_Řešíme_slovní_ úlohy Téma Číslo projektu Anotace Ma 2 – Násobení a dělení čísly.

Název školy: ZŠ A MŠ ÚDOLÍ DESNÉ, DRUŽSTEVNÍ 125, RAPOTÍN Název projektu: Ve svazkové škole aktivně - interaktivně Číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/

MÁTE VE SVÝCH DATECH NEJVĚTŠÍ BOHATSTVÍ. Stávající datový sklad Pasivní homologace adresy Identifikátory subjektu IČ, jméno, příjmení, domácnost (první.

Dotkněte se inovací CZ.1.07/1.3.00/ Společenské vědy Legislativní proces v ČR.

NÁZEV ŠKOLY: Masarykova základní škola a mateřská škola Melč, okres Opava, příspěvková organizace ČÍSLO PROJEKTU:CZ.1.07/1.4.00/ AUTOR:Mgr. Vladimír.

Statistika je věda a postup jak rozvíjet lidské znalosti použitím empirických dat. Statistika.

Základní škola Čelákovice

Databáze © Mgr. Petr Loskot

Zeměpis – 9.ročník Správní členění ČR VY_32_INOVACE_

Technické vybavení počítače - Počítač PC

Výukový materiál zpracovaný v rámci projektu "EU peníze školám"

Otázky a úkoly VY_32_INOVACE_4_2_19_20 Tiskárny Jaké druhy tiskáren známe? 2. Jaké jsou základní barvy, které kupujeme do inkoustové tiskárny?

VY_32_Inovace_4.3.4 Násobení a dělení 4 Matematika 3. ročník

V_ _ _ _ _ _ _ _E SVÁTKY JARA

Číslicová technika.

Jak vyřeším maxi-čtvereček?

Ruština pro začátečníky

ÚŘEDNÍ DEN 11. listopad 2015.

Atomy a molekuly (suplovaná hodina)

ANGLICKÝ JAZYK – 7. ROČNÍK

ČÍSLOVKY Mgr. Michal Oblouk.

STŘEDNÍ ŠKOLA PEDAGOGICKÁ, HOTELNICTVÍ A SLUŽEB

VY_32_INOVACE_1_2_7 Ing. Jan Voříšek

Název školy: ZŠ Bor, okres Tachov, příspěvková organizace

Autor: Mgr. Ivana Tesařová

Genetický kód – translace

Molekulární genetika Tok genetické informace:

NÁZEV ŠKOLY: Základní škola Karla Klíče Hostinné

Metabolismus aminokyselin.

Přírodovědný seminář – chemie 9. ročník

Autor: Mgr. Lenka Königová Reg.číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/

Střední odborná škola a Střední odborné učiliště, Hradec Králové, Vocelova 1338, příspěvková organizace Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/

VY_32_INOVACE_ Regulace

Jméno autora Mgr. Stanislava Junková Datum vytvoření prosinec 2012

Název školy:. Základní škola Netvořice. Autor:. Olga Marková. Název:

Grafické seznamy a diagramy

2. Praktické postupy zpracování experimentálních dat

Střední odborná škola a Střední odborné učiliště, Hradec Králové, Vocelova 1338, příspěvková organizace Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/

Signalizace integriny

Evropa poloha Jan Dušek.

Obchodní akademie, Střední odborná škola a Jazyková škola s právem státní jazykové zkoušky, Hradec Králové Autor: Mgr. Radka Černá Název materiálu: VY_32_INOVACE_5_ANGLICKY_JAZYK_GRAMATIKA_17Množství.

Číslo projektu Číslo materiálu název školy Autor TEmatický celek

Název školy: ZŠ Bor, okres Tachov, příspěvková organizace Autor: Mgr

Název školy: Základní škola a mateřská škola Domažlice , Msgre B

2. Praktické postupy zpracování experimentálních dat

Název školy: Základní škola a mateřská škola Domažlice , Msgre B

NÁZEV ŠKOLY: Základní škola Josefa Bublíka, Bánov

ZÁKLADNÍ ŠKOLA SLOVAN, KROMĚŘÍŽ, PŘÍSPĚVKOVÁ ORGANIZACE

Translace (druhý krok genové exprese)

GENETICKÝ KÓD, GENY, GENOM

Opakování učiva pro 9. ročník

Mechanika VY_32_INOVACE_05-08 Ročník: VII. r. Vzdělávací oblast:

Název školy: Základní škola a Mateřská škola Kladno, Norská 2633

Hádanky s doplňovačkou

Genetický kód Jakmile vznikne funkční mRNA, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu. Pravidla, kterými se řídí prostřednictvím.

Třetí návštěva „Domečku“

NÁZEV ŠKOLY: Základní škola Karla Klíče Hostinné

Plzeňsko a Chodsko VY_12_INOVACE_Rů_II_14

Název projektu: ICT ve výuce

Narozeniny VY_32_INOVACE_2B_09 Číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/

Translation 05/07 Jessica ráda chodí do divadel, že? Jessica likes going to theatres, doesn‘t she? Ten koncert nevypadá zajímavě, že? The concert doesn‘t.

Přesný analogový generátor několika tisíc různých barevných světel

Opakování učiva pro 9. ročník

Transkript prezentace:

Nástroje pro zpracování a grafickou úpravu sekvenčních dat Aplikovaná bioinformatika, Jaro 2014

Vyznačte v sekvenci všechny tryptofany, tyrosiny a cysteiny. ColorSeq http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_color.html Vyznačte v sekvenci všechny tryptofany, tyrosiny a cysteiny.

Protein Colourer http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/proteincol/ProteinColourer.pl LENKAPEPAMARTINWALTERGITAADAMAGATAAGNESALANCECILCEDRIKDALIDADANAEMILIEERIKEVAFILIPGERHARDHERMINAKARELKATERINAMARLENAMARKETAVALDEMARAVLASTIMILA Obarvěte si sekvenci...

Filter Protein/DNA http://www.bioinformatics.org/sms2/filter_protein.html http://www.bioinformatics.org/sms2/filter_dna.html

Three to One http://www.bioinformatics.org/sms2/three_to_one.html

One to Three http://www.bioinformatics.org/sms2/one_to_three.html

Three- / one-letter code http://molbiol.ru/eng/scripts/01_17.html

Reverse Transcription and Translation Tool http://www.attotron.com/cybertory/analysis/trans.htm GGGGACCGCCGCACCGUUAUCAGCCGUCAUAUCGACUACCGGAGGGCGAGACAGACGAUCGGUGUUAGCUACUUACAUGGCGUUCGAGAGUUGCUACGCGGUAGGCUUGACUCCAACUACAACGGAACGUGAAUCUCAUUUUGGGUUUUAGAUAUUGGGGUCGAAUCCAGCGAAAGCAUUAUUAAGGGGCUCCGUAACCUGGAUGGAACAUUGAGGUCUUUCAGUUCAACGAAUCCUGGAUAGGGCGCAACUCCCACUACACCAACUUUAACCUCACAUUACCCUGUUCUUAUUGCGCAA Pohrajte si s RNA...

Reverse Translate http://www.bioinformatics.org/sms2/rev_trans.html LENKAPEPAMARTINWALTERGITAADAMAGATAAGNESALANCECILCEDRIKDALIDADANAEMILIEERIKEVAFILIPGERHARDHERMINAKARELKATERINAMARLENAMARKETAVALDEMARAVLASTIMILA Přeložte si protein...

PepDraw Kolik aminokyselin program zvládne? http://www.tulane.edu/~biochem/WW/PepDraw/index.html Kolik aminokyselin program zvládne?

POLYVIEW http://polyview.cchmc.org/

POLYVIEW http://polyview.cchmc.org/

TOPO2 http://www.sacs.ucsf.edu/TOPO2/

MyDomains http://prosite.expasy.org/mydomains

PLLSASIVSAPVVTSETYVDIPGLYLDVAKAGIRDGKLQVILNVPTPYATGNNFPGIYFAIATNQGVVADGCFTYSSKVPESTGRMPFTLVATIDVGSGVTFVKGQWKSVRGSAMHIDSYASLSAIWGTAAPSSQGSGNQGAETGGTGAGNIGGGGERDGTFNLPPHIKFGVTALTHAANDQTIDIYIDDDPKPAATFKGAGAQDQNLGTKVLDSGNGRVRVIVMANGRPSRLGSRQVDIFKKSYFGIIGSEDGADDDYNDGIVFLNWPLG 271 aa, 1-129 TNF like domain, 157-271 Lectin domain, 189-191 vazebné místo, 256-258 vazebné místo

Vytvořte „doménové schéma“ proteinu.

BoxShade http://embnet.vital-it.ch/software/BOX_form.html

ESPript 3 http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/

ESPript 3 http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/

ESPript 3 http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/