Ústavní schůzka Pondělí 6. ledna 2014

Výčet nejdůležitějších událostí, co mne napadly 1.Nové vedení SoS, audit SoS, noví zaměstnanci, struktura aj. – změny v přístupu k ústavům, atd. 2. Nové vedení AVČR (předsedou zůstává Jiří Drahoš, ale mění se Akademická i Vědecká rada atd.) 3. Rozpočet AVČR – více méně stejný jako v 2013, PaÚ si díky výborné produkci lehce polepší 4. Změny v areálu, vestibul, nová cesta, závory, jezírka (M+M), fotky a cover stránky v PaÚ 5. Velké hodnocení v 2015, o to víc publikovat v Folia Parasitologica si vedou skvěle, mají nejvyšší IF v historii (2.515), hodně submisí atd., posílejte tam!

Our institute was successful in obtaining funding – at least most from BC, and not only from Czech sources, but also from highly competitive international sources, such as f.e. Libor Grubhoffer et al.– European grant Jula Lukeš et al. - GAČR grant Bohouš Sak et al. - GAČR grant Gemma Alama et al. - GAČR grant (post-doc) several lab – funding for post-docs from EU Nejdůležitější – pokud máme peníze, můžeme dělat vědu… Proto prosím – stále žádejte a pište a publikujte, pokud možno co nejpestřeji…

ALE Není to tak dobré, jak to vypadá! 2014 – 3!!! GAČRy (Sak, Lukeš, Gema Alama Bermejo) 2013 – 4 GAČRy (Hajdušek, Šíma, Kopáček, Oborník) 2012 – 11 GAČRů 2011 – 6 GAČRů ROZPOČET ÚSTAVU 2013 Celkem 121 mil, z toho režie 47 mil (39%)!! 2012 Celkem 114 mil, z toho režie 46 mil (40%) 2011 Celkem 97 mil, z toho režie 53 mil (55%)

Papers with IF > 888 Papers with IF Chapters63 Monographs50 Suma IF408,38399,48 VĚDECKÁ PRODUKCE - SROVNÁNÍ

Papers with IF > 4 (> 8) 2013 ( ) 2012 ( ) Lukeš lab 15 (3)14 (7) Oborník lab 4 (2)6 (3) Zíková lab 00 Asahina-Jindrová lab 1 (1)0 Horák lab 2 (1)- Grubhoffer/Rudenko lab 2 (1)1 Kopáček lab 11 Kopecký lab 21 Kotsyfakis lab 4 (1)6 Hajdušek/Šíma lab 0- Holzer lab 12 (1) Kváč lab 10 Scholz lab 21 Hypša/Štefka lab 2 (1)0 Pomajbíková lab 0- Nebesářová lab 03

Relativized according to number of authors from individual labs. Relative IF 2013 ( ) 2012 ( ) Lukeš lab 97,9112,7 Oborník lab 15,742,9 Zíková lab 0,03,33,3 Asahina-Jindrová lab 8,50,0 Horák lab 10,1- Grubhoffer/Rudenko lab 24,74,5 Kopáček lab 6,74,7 Kopecký lab 21,512,4 Kotsyfakis lab 29,347,0 Hajdušek/Šíma lab 0,0- Holzer lab 22,228,0 Kváč lab 45,627,5 Scholz lab 70,876,6 Hypša/Štefka lab 48,75,2 Pomajbíková lab 1,84- Nebesářová lab 18,022,8

Flegontov P., Votýpka J., Skalický T., Logacheva M.D., Penin A.A., Tanifuji G., Onodera N.T., Kondrashov A.S., Volf P., Archibald J.M., Lukeš J. 2013: Paratrypanosoma Is a Novel Early-Branching Trypanosomatid. CURRENT BIOLOGY 23: 1787–1793. IF = 9,494. Husník F., Nikoh N., Koga R., Ross L., Duncan R. P., Fujie M., Tanaka M., Satoh N., Bachtrog D., Wilson A. C. C., von Dohlen C. D., Fukatsu T., McCutcheon J. P. 2013: Horizontal gene transfer from diverse bacteria to an insect genome enables a tripartite nested mealybug symbiosis. CELL 153(7): 1567–1578. IF = 31,957 Janouškovec J., Horák A., Barott K.L., Rohwer F.L., Keeling P.J. 2013: Environmental distribution of coral- associated relatives of apicomplexan parasites. ISME JOURNAL 7: 444–447. IF = 8,951 Janouškovec J., Sobotka R., Lai D.-H., Flegontov P., Koník P., Komenda J., Ali S., Prášil O., Pain A., Oborník M., Lukeš J., Keeling P.J. 2013: Split photosystem protein, linear-mapping topology and growth of structural complexity in the plastid genome of Chromera velia. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 30: 2447– IF = 10,353 Kořený L., Oborník M., Lukeš J. 2013: Make it, take it or leave it: Heme metabolism of parasites. PLOS PATHOGENS 9: e IF = 8,136 Ma D., Mizurini D.M., Assumpçăo T.C.F., Li Y., Qi Y., Kotsyfakis M., Ribeiro J.M.C., Monteiro R.Q., Francischetti I.M.B. 2013: Desmolaris, a novel Factor XIa anticoagulant from the salivary gland of the vampire bat (Desmodus rotundus) inhibits inflammation and thrombosis. BLOOD 122: 4094–4106. IF = 9,060 Preston S.G., Majtán J., Kouremenou C., Rysnik O., Burger L.F., Cabezas-Cruz A., Guzman M.C., Nunn M.A., Paesen G.C., Nuttall P A., Austyn J.M Novel immunomodulators from hard ticks selectively reprogramme human dendritic cell responses. PLOS PATHOGENS 9(6): e IF = 8,136 Ward J.D., Bojanala N., Bernal T., Ashrafi K., Asahina M., Yamamoto K.R. 2013: Sumoylated NHR-25/NR5A regulates cell fate during C. elegans vulval development. PLOS GENETICS 9: e IF = 8,517 ČLÁNKY S IF NAD 8

2013 – nejlepší články podle Vědecké rady molecular biology 1a Janouškovec J., Sobotka R., Lai D.-H., Flegontov P., Koník P., Komenda J., Ali S., Prášil O., Pain A., Oborník M., Lukeš J., Keeling P.J. 2013: Split photosystem protein, linear-mapping topology and growth of structural complexityin the plastid genome of Chromera velia. Mol. Biol. Evol. 30: 2447–2462. IF=10,33 1b Kořený L., Oborník M., Lukeš J. Make it, take it or leave it: Heme metabolism of parasites. PLoS Pathogens 9: e IF = 8,136 1c Hashimi H., McDonald L., Stříbrná E., Lukeš J. 2013: Trypanosome Letm1 proteinis essential for mitochondrial potassium homeostasis. J. Biol. Chem. 288: 26914– IF = 4,651 organismal parasitology 2a Flegontov P., Votýpka J., Skalický T., Logacheva M.D., Penin A.A., Tanifuji G., Onodera N.T., Kondrashov A.S., Volf P., Archibald J.M., Lukeš J. 2013: Paratrypanosoma Is a novel early-branching trypanosomatid. Current Biology 23: 1787–1793. IF= 9,494 2b Jirků Miloslav, Kvičerová J., Modrý D., Hypša V. 2013: Evolutionary plasticity in coccidia – Striking morphological similarity of unrelated coccidia (Apicomplexa) from related hosts: Eimeria spp. from African and Asian pangolins (Mammalia: Pholidota). Protist 164: 470–481. IF = 4,140 2c Bartošová P., Fiala I., Cinková M., Jirků Miloslav, Caffara M., Fioravanti M.L., Atkinson S.D., Bartholomew J.L., Holzer A.S. 2013: Sphaerospora sensu stricto: Taxonomy, diversity and evolution of a unique lineage of myxosporeans (Myxozoa). Mol. Phyl. Evol. 68: 93–105. IF = 4,066 ticks and tick born diseases 3a Schwarz A., von Reumont B.M., Erhart J., Chagas A.C., Ribeiro J.M., Kotsyfakis M. (2013): De novo Ixodes ricinus salivary gland transcriptome analysis using two next-generation sequencing methodologies. FASEB J. IF = 5,704 3b Sojka D., Franta Z., Horn M., Caffrey C.R., Mareš M., Kopáček P. 2013: New insights into the machinery of blood digestion by ficka. Trends Parasitol. 29: 276–285. IF = 5,513 3c Palus M., Vojtiskova M, Salat J., Kopecky J., Grubhoffer L., Lipoldova M., Demant P., Ruzek D. 2013: Mice with different susceptibility to tick-borne encephalitis virus infection show selective neutralizing antibody response and inflammatory reaction in the central nervous system. J. Neuroinflam. 10: 77. IF = 4,351

But ! general comparison of Czech research with Western Europe and USA – still not good enough… We need to double our production in order to close the gap with the best EU countries, not necessarily more papers, but higher impact and more respected = cited papers On top of that – CAS/AVCR has to produce at least double than the best Czech universities

Nové laboratoře Aleš Horák (Ogar) Ondřej Hajdůšek a Radek Šíma Katka Pomajbíková Od února 2014 přibude poslední – Zdeněk Paris (Parda) Cena AVČR pro mladé vědce – Dan Sojka (Sojkič) Wichterleho praemium – Roman Kuchta (Krtek) Post-doc z centrálních zdrojů AV – Ashlie Hartigan Odchod laboratoří – na fakultu Vašek Hypša (Vacátko) Honza Kopecký Martin Kostka (část laboratoře Astrid Holzer)

DŮLÉŽITÁ AKCE V LETECH 2014 A 2015 Přístavba celého patra na zvěřinci Pro letošní rok investice ve výši 25 milionů, příští rok totéž Nároky na stěhování laboratoří z chovů, na Tomáše a spol. Při udržení jejich fungování apod.

2NP-původní návrh

1NP soucasne

SOCIAL FUND ( SOCIAL FUND (použití prostředků) Příspěvek na stravování (úvazek 3/8) Půjčky na pořízení bytu a jeho vybavení Finanční pomoc v mimořádných situacích Významná životní výročí Kursy angličtiny (4 × 60 minut/týdně)