Jula Lukeš jun. (Rangun) -

Prezentace na téma: "Jula Lukeš jun. (Rangun) -"— Transkript prezentace:

1 Jula Lukeš jun. (Rangun) - https://www.vimtravelers.com/
Novoroční setkání PaU 3. ledna 2018 Jula Lukeš jun. (Rangun) -

2 We were successful with funding !!!
New - starting 2018 (11): GAČR 9x: Standardní: A. Faltýnková, L. Grubhoffer, A. Horák, M. Kolísko, P. Kopáček, M. Kváč, J. Lukeš, M. Oborník, A. Zíková MŠMT (OPVVV – Centrum excelence) – společný projekt: M. Kolísko, P. Kopáček, M. Kotsyfakis, J. Lukeš, M. Oborník, Z. Paris, A. Zíková MSM AV ČR – J. Perner Extending into 2018 (35): FJEP – M. Kolísko FP7 (Antidote) – P. Kopáček GAČR 14x – I. Fiala, O. Hajdušek, H. Hashimi, J. Lukeš, D. Modrý, M. Oborník (2x), R. Rego, B. Sak, T. Scholz, D. Sojka, M. Soldánová, R. Šíma, A. Zíková HFSP – K. Jirků Horizon 2020 – A. Holzer INTERREG – D. Růžek MOORE Foundation (Diplonemid II) – J. Lukeš MSM AV ČR (2x) – J. Černý, A. B. Torrijos MŠMT (ERC CZ) – J. Lukeš MŠMT (Czech BioImaging) – J. Nebesářová MŠMT (OPVVV Czech BioImaging) – J. Nebesářová MŠMT (Inter Action) – M. Kváč MŠMT (Inter Action) – P. Sojková MZČR (AZV) – D. Růžek Postdok AVČR (2x) – J. Černý, M. Palus TAČR (Centra kompetence) – J. Nebesářová TAČR Gamma (4x) – A. Holzer, K. Jirků, P. Kopáček, R. Rego Terminated in 2017 (12): GAČR 8x – L. Grubhoffer, P. Kopáček, M. Kváč, J. Lukeš, M. Oborník, Z. Paris, T. Scholz, V. Urbanová MŠMT (ERC CZ) – A. Zíková Postdok AVČR – S. Georgieva TAČR Gamma – R. Šíma VFGIS (Galapágy) – J. Štefka

3 GAČR ROZPOČET ÚSTAVU 2017 2018 – 9x 2017 – 10x 2016 – 3x 2015 – 7x
Nejvýznamnější položky hrazené z režie ústavu: energie … 3 mil. zdravotní prohlídky … 95 tis. přístupy do databází, předplatné … tis. konfokální mikroskop … 140 tis. spolufinancování mezd z GAČRů … tis. autoprovoz … 198 tis. vrácené overheady … tis. IT služby (mail, firewall, servery) … 138 tis. vybavení kuchyňky, hostovských pokojů, židle do zas. místnosti PARU II, apod. … 150 tis. ROZPOČET ÚSTAVU 2017 Celkem 131 mil. Kč, z toho: investiční dotace 1,5 mil. Kč neinvestiční dotace 37,5 mil. Kč overheady z projektů 9 mil. Kč zakázky 1,5 mil. Kč účelové dotace (granty) 78 mil. Kč FÚUP z minulých let 3,5 mil. Kč Celkové osobní náklady 77 mil. Granty, účelové dotace…

4 ústav PAÚ finanční účtárna v letech 2014–2017
Sekretariát Přehled počtu dokladů ústav PAÚ finanční účtárna v letech 2014–2017 Roky 2014 2015 2016 2017 Účetní doklady 3247 3317 3446 3746 Navýšení od předchozího roku 70 129 300 Počty nástupů + výstupů + OON každoročně více než 200 (v roce 2017: 46 nástupů, 27 výstupů a cca 150 OON)! Náklady a výnosy účtovány na celkem 143 úkolů, z toho 49 projektů, 13 hospodářských zakázek a 81 režijních úkolů! Prostě suma sumarum děvčata dole docela kmitají, tak na ně buďte hodní Paní uklízečky mají také nárůst práce (víc labů, větší prostory), tak na ně buďte hodní Let’s thank the PaU staff (but also THS, some are here) for being friendly, patient with us and increasingly efficient

5 VĚDECKÁ PRODUKCE - SROVNÁNÍ
2017 2016 2015 2014 2013 2012 Papers with  IF > 8 6 7 12 4 8 Papers with IF 145 165 148 116 117 120 Chapters 18 3 Monographs 1 5 Suma IF 488,1 530,3 564,3 327,5 408,4 399,5 IF/papers 3,4 3,2 3,8 2,8 3,5 3,3 Díky zejména helmintologům (ale nejen jim) je letošek nejsilnější na kapitoly v knihách + je tady jeden Michalisův patent: P : Composition comprising miRNAs for use as medicament

6 Relative papers with IF*
2017 ( ) Relative papers with IF* Relative IF* Papers with IF# IF# Cabezas-Cruz lab 13,0 57,1 16 69,1 Grubhoffer/Rudenko lab 6,4 23,3 10 38,3 Hajdušek lab 2,0 7,1 4 14,4 Holzer lab 8,2 22,4 11 30,8 Horák lab 1,3 4,2 2 Jirků-Pomajbíková lab 0,5 1,5 5,4 Kolísko lab 5,0 17,4 5 Kopáček lab 8,1 19,1 Kotsyfakis lab 5,9 8,9 Kváč + Modrý labs 20,6 44,1 23 50,9 Lukeš lab 19,5 79,7 22 89,9 Nebesářová lab 5,8 29,2 13 55,9 Oborník lab 6,5 17,2 7 Paris lab 1,0 40,1 1 Růžek lab 12,6 49,6 18 71,1 Scholz lab 39,3 66,4 40 67,5 Štefka lab 2,5 9,5 3 10,9 Zíková lab 5,5 10,4 * Relativized according to number of authors from individual labs; # I find the right-most number somewhat more important, because we don´t want to punish collaboration (too much)

7 Relativized according to number of authors from individual labs
Relative IF 2015 4.1.16 2014 2.1.15 2013 2012 7.1.13 Cabezas-Cruz lab 57,1 - Grubhoffer/Rudenko 23,3 23,0 13,1 51,0 24,7 4,5 Hajdušek lab 7,1 6,9 5,5 4,1 0,0 Holzer lab 22,4 37,6 27,0 19,6 22,2 28,0 Horák lab 4,2 8,7 32,7 10,1 Jirků-Pomajbíková lab 1,5 6,6 4,4 1,8 Kolísko lab 17,4 Kopáček lab 8,1 38,8 19,1 5,0 6,7 4,7 Kotsyfakis lab 5,9 33,3 19,5 29,3 47,0 Kváč + Modrý labs 44,1 96,3 36,5 38,2 45,6 27,5 Lukeš lab 79,7 105,0 149,7 39,9 97,9 112,7 Nebesářová lab 29,2 23,6 10,9 7,6 18,0 22,8 Oborník lab 17,2 9,4 54,0 4,9 15,7 42,9 Paris lab 40,1 4,8 3,5 Růžek lab 49,6 47,2 46,4 46,7 21,5 12,4 Scholz lab 66,4 56,1 96,9 58,6 70,8 76,6 Štefka lab 9,5 23,7 20,2 15,8 48,7 5,2 Zíková lab 11,8 10,3 3,3 Relativized according to number of authors from individual labs

8 Papers with IF > 4 + IF > 8 2017 2.1.2018 2016 3.1.2017 2015
2014 Cabezas-Cruz lab 11 - Grubhoffer/Rudenko lab 7 2 1 2 + 1 Hajdušek lab 1 + 1 Holzer lab 4 Horák lab 1 + 3 Kolísko lab Kopáček lab 3 5 + 2 Kotsyfakis lab 5 4 + 1 Kváč + Modrý lab 3 + 1 1 + 1 Lukeš lab 8 + 1 11 + 3 14 + 9 Nebesářová lab 4 + 2 Oborník lab 3 + 5 Paris lab 0 + 1 Pomajbíková lab Růžek lab 6 + 1 6 Scholz lab Štefka lab Zíková lab

9 Papers with IF > 8 Hehenberger E., Tikhonenkov D.V., Kolísko M., del Campo J., Esaulov A.S., Mylnikov A.P., Keeling P.J : Novel predators reshape holozoan phylogeny and reveal the presence of a two-component signaling system in the ancestor of animals. Current Biology 27: 1–8. IF=8.851 Kuchta R., Oros M., Ferguson J., Scholz T : Diphyllobothrium nihonkaiense tapeworm larvae in salmon from North America. Emerging Infectious Diseases 23: 351–353. IF=8.222 Rubio M.A.T., Gaston K.W., McKenney K.M., Fleming I.M.C., Paris Z., Limbach P.A., Alfonzo J.D. 2017: Editing and methylation at a single site by functionally interdependent activities. Nature 542: 494–497. IF=40.137 Salát J., Mihalca A.D., Mihaiu M., Modrý D., Růžek D. 2017: Tick-borne encephalitis in sheep, Romania. Emerging Infectious Diseases 23: 2065–2067. IF=8.222 Skalický T., Dobáková E., Wheeler R., Tesařová M., Flegontov P., Jirsová D., Votýpka J., Yurchenko V., Ayala F., Lukeš J : Extensive flagellar remodeling during the complex life cycle of Paratrypanosoma, an early-branching trypanosomatid. Proc Natl Acad Sci USA 144: 1757–1762. IF=9.661 Sytnyk M., Jakešová M., Litviňuková M., Mashkov O., Kriegner D., Stangl J., Nebesářová J., Fecher F.W., Schöfberger W., Sariciftci N.S., Schindl R., Heiss W., Głowacki E.D. 2017: Cellular interfaces with hydrogen-bonded organic semiconductor hierarchical nanocrystals. Nature Communications 8: 91. IF=12.124

10 Cover 2017 Waeschenbach A., Brabec J., Scholz T., Littlewood D.T.J., Kuchta R. 2017: The catholic taste of broad tapeworms – multiple routes to human infection. International Journal for Parasitology 47: 831–843. 1x 2017, 3x 2016 vs 5x 2015 – we need more covers!

11 Popularizace cca 350 příspěvků
Hlavní letošní témata: Americký losos a tasemnice Podvodné vyšetřování přítomnosti parazitů v lidském těle Zubři, pratuři a divocí koně a jejich vliv na českou přírodu (a losi) Gordon and Betty Moore Foundation

12 Papers that will come out in 2018
práce nad IF 8, již vyšlé v 2018: Strassert J.F.H.,  Karnkowska A., Hehenberger E., del Campo J.,  Kolísko M., Okamoto N.,  Burki F.,  Janouškovec J.,  Poirier C.,  Leonard G., Hallam S.J., Richards T.A., Worden A.Z., Santoro A.E., Keeling P.J. Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates. ISME Journal 9,664 dohromady už máme sumu IF pro rok práce nad IF 8, co vyjdou 2018 : Gerasimov E.S., Gasparyan A.A., Kaurov I., Tichý B., Logacheva M.D., Kolesnikov A.A., Lukeš J. , Yurchenko V., Zimmer S.L., Flegontov P. Trypanosomatid mitochondrial RNA editing: dramatically complex transcript repertoires revealed with a dedicated mapping tool. Nucleic Acids Research 10,162 Grybchuk D., Akopyants N.S., Kostygov A.Y., Konovalovas A., Lye L.-F., Dobson D.E., Zangger H., Fasel N., Butenko A., Frolov A.O., Votýpka J., d'Avila-Levy C.N., Kulich P., Moravcová J., Plevka P., Rogozin I.B., Serva S., Lukeš J., Beverley S.M., Yurchenko V. Viral discovery and diversity in trypanosomatids with a focus on relatives of the human parasite Leishmania. Proc. Natl Acad. Sci USA 9,661 Husník F., McCutcheon J.P. Functional horizontal gene transfer from bacteria to eukaryotes Nature Reviews Microbiology 26,819 Montgomery M, Gahura O, Leisley AGW, Zíková A, Walker JEW. Trypanosoma brucei F1 ATPase has elaborated structure with canonical catalytic sites. Proc. Natl Acad. Sci USA 9,661 dohromady už práce, co vyjdou v roce 2018, mají sumu 110

13 Some additional good stuff
Marie Jalovecká získala Evropský doktorát za výzkum babesií Libor Grubhoffer byl jmenován ředitelem Biologického centra AV ČR Alejandro Cabezas-Cruz získal Odile Bain Memorial Award 2017 Československá virologická konference 16. a

14 Some additional good stuff
Atestace – většina, včetně mladých PI dovedla pěkně odůvodnit svůj výzkum před komisí GAČR – 8 z 9 GAČRů za BC na rok 2018 má domov na PaU OPVVV – centrum excelence – zásadní velký a dlouhodobý funding 6ti laborek! Podpora pro excelentní týmy od roku 2017 na 5 let – ročně 3 mil. Kč Pozitivní atmosféra na BC, zlepšení spolupráce THS s ústavy Občasný patent a schopnost získávat smluvní a aplikovaný výzkum Bude nový konfokál a elektroňáci se stále dovybavují Třeba i to, že celý můj plat je teď už komplet z grantů, takže se přesouvá do ústavních odměn

15 Lidové noviny poukazují na vědecký výkon BC v parazitologii

16 Wagner C. S. , Jonkers K. 2017: Open countries have strong science
Wagner C.S., Jonkers K. 2017: Open countries have strong science. Nature 550: 32–33.

17 Srovnání ústavů v rámci BC

18 Srovnání ústavů v rámci BC – slide od Vládi Koštála
Počet publikací roste s délkou vědecké kariéry nejrychleji na PAÚ (zejména díky Moravcovi, Scholzovi, Lukešovi a Modrému ....)

19 NÁVRH ROZPOČTU SOCIÁLNÍHO FONDU PAÚ na rok 2018
tis. Kč Počáteční stav k 100* Příjmy SF v roce 2018 Tvorba fondu 2% z hrubých mezd 1 070 Celkem stav + tvorba fondu 1 170 Použití SF v roce 2018 Příspěvek na stravování 2018 230 Rekreace, zájezdy 262 Kultura, tělovýchova 590 Dary k životnímu jubileu 15 Vánoční večírek 50 Příspěvek na dětskou skupinu 23 Celkem použití v roce 2018 * Přesná částka počátečního stavu k nebyla k datu zpracování prezentace ještě známa. od roku 2018 aktualizován vnitřní předpis PAÚ pro čerpání SF (předpis je dostupný pro všechny zaměstnance PAÚ na společném disku (J:); čerpání SF od do ; osobní limit pro rok 2018 zůstává nezměněn: 5 000,- Kč + náhrada nevyčerpaného příspěvku na stravování v roce 2016; mění se však pravidla pro stanovení výše osobního limitu v návaznosti na výši sjednaného úvazku na PAÚ.

20 Some not so good stuff Přijde mi, že je večer míň světel v oknech (o vánocích ani nemluvě) než dříve a že v některých laboratořích nejsou téměř nikdy! Ty laborky, co mají PhD studenty, co nesvítí, na to prostě dojedou…opakuji se, ale – dělejte s tím něco! Nabírejme lidi, které věda baví a zůstat občas přes čas je pro ně samozřejmost Rozšiřuje se tzv. „home office“ – bohužel/bohudík to považuji za nešvar a obracím se na PIs, aby ji povolovali jen, když to podle nich bude supernezbytné a odůvodněné (jak to dělají oni osobně je plně v jejich kompetenci) Stále není tolik (velmi) silných pejprů, jako bychom chtěli mít… Platy státních zaměstnanců letos rostly, ale na AVČR jako v.v.i. se to nevztahuje, sorry…Ovšem platy na PaU se sumárně solidně zvýšily díky grantům a nárůstu různých odměn + budu se zabývat výší platů klíčových technických pracovníků a snažit se je zvýšit

21 Takže jak nás posunout? Jak už bylo uvedeno, klesl 2. rok sumární IF a tím i celková vědecká produkce ústavu a v oněch kritériích, v nichž stále na BC vedeme, budeme za 2017 opět o trochu slabší… Máme nejlepší infrastrukturu co kdy, nejlepší funding co kdy, nejlepší podpůrný personál co kdy, nejlepší komunikaci se zahraničím co kdy… Naše grantová úspěšnost se odvíjí od dosavadní kvalitní produkce, ale časem bychom dojeli… Takže pojďme společnými silami v 2018 trend z posledních dvou let zvrátit! To je hlavně na věd. pracovnících a PhD studentech. Obracím se na PIs, aby napsali každý v 2018 alespoň jeden kvalitní review článek, aby více diskutovali a promýšleli svůj výzkum, pracovali o trochu víc než dosud, aby si kladli si ještě trochu zajímavější otázky a hledali cesty jak na ně rychle a hlavně chytře odpovídat…

22 What expects us in 2018… ANOTHER YEAR IN A DREAM JOB
JOY FROM DOING INTERESTING SCIENCE … = BIG DISCOVERIES ARE AWAITING US !!! (jak se dozvíte z flesh talků v následujících chvílích…) Thanks to Monika V and Petra R for help with this presentation