Laboratoř flow-cytometrie ŠS Hladké Životice

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
TEORIE ROZHODOVÁNÍ A TEORIE HER
Advertisements

Ústav experimentální botaniky Akademie věd ČR, v. v. i. Setkání ředitelů fakultních škol PřF UP Mgr. Jan Bartoš, Ph.D.
VII. Řešení úloh v testech Scio z matematiky
Aktuální informace o vyšetřování c-erb-2 genu v referenční laboratoři a návrh změny v indikačních kritériích Hajdúch M., Petráková K., Kolář Z., Trojanec.
Nové modulové výukové a inovativní programy - zvýšení kvality ve vzdělávání Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem.
Vzorce na umocnění.
Sterilní trávy (to jako že zrovna nekvetou)
Střední škola Oselce Škola: SŠ Oselce, Oselce 1, Nepomuk, Projekt: Registrační číslo: CZ.1.07/1.5.00/ Název: Modernizace.
Rekonstrukce a sanace historických staveb h-x diagram
Distribuční úlohy LP.
ZŠ a MŠ Olšovec, příspěvková organizace Vzdělávací materiál, šablona – Inovace a zkvalitnění výuky směřující k rozvoji matematické gramotnosti žáků základní.
výpočet pH kyselin a zásad
Násobíme . 4 = = . 4 = = . 4 = = . 2 = 9 .
Zdroje včelí pastvy.
Jetel luční Trifolium pratense.
Procenta Výpočet počtu procent
Téma: SČÍTÁNÍ A ODČÍTÁNÍ CELÝCH ČÍSEL 2
Nové modulové výukové a inovativní programy - zvýšení kvality ve vzdělávání Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem.
PÍCNINY.
Autor: Vít Lazecký Datum vytvoření:
Objemové tabulky Zjišťování objemu nadměrných stromů
Zábavná matematika.
Dělení se zbytkem 6 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
Dělení se zbytkem 5 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
Letokruhy Projekt žáků Střední lesnické školy a střední odborné školy sociální ve Šluknově.
Základní škola Karviná – Nové Město tř. Družby 1383
Nejmenší společný násobek
Procvičování vzorce.
Dělení se zbytkem 8 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
Zásady pozorování a vyjednávání Soustředění – zaznamenat (podívat se) – udržet (zobrazit) v povědomí – představit si – (opakovat, pokud se nezdaří /doma/)
Krajina a životní prostředí
Cvičná hodnotící prezentace Hodnocení vybraného projektu 1.
Vybrané čeledi jednoděložných rostlin II.
LOUKY, PASTVINY A POLE Filip Bordovský.
FRÉZOVÁNÍ DĚLÍCÍM ZPŮSOBEM
Téma: ABSOLUTNÍ HODNOTA CELÝCH ČÍSEL 2
Střední odborná škola a Střední odborné učiliště Horky nad Jizerou 35 Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Předmět: Odborný výcvik Ročník:
Analýza a třídění chromozomů Pavlína Kovářová
VÝBĚR - z populace rostlin se vyberou ty rostliny, které mají nějakou zajímavou vlastnost. Umělým výběrem tak člověk vybral např. z planých druhů travin.
Procenta SOŠ Josefa Sousedíka Vsetín Zlínský kraj Anotace
Téma: Dělení desetinných čísel 2 Vytvořila: Mgr. Martina Bašová VY_32_Inovace2/_095.
Slovní úlohy řešené soustavou rovnic
Škola:. Základní škola Kladruby
MĚŘENÍ VÝSLEDKU HOSPODAŘENÍ
Poznávání trav Katedra pícninářství a trávníkářství.
Aplikace průtokové cytometrie ve šlechtění rostlin
Polní plodiny Filip Bordovský.
Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod:
Základní škola Jakuba Jana Ryby Rožmitál pod Třemšínem Efektivní výuka pro rozvoj potenciálu žáka projekt v rámci Operačního programu VZDĚLÁVÁNÍ PRO KONKURENCESCHOPNOST.
DIGITÁLNÍ UČEBNÍ MATERIÁL zpracovaný v rámci projektu
Mgr. Lubomír Šára: Kulturní rostliny a traviny
Mgr. Věra Vasiljevičová
Číslo projektuCZ.1.07/1.5.00/ Název školyGymnázium, Soběslav, Dr. Edvarda Beneše 449/II Kód materiáluVY_32_INOVACE_21_17 Název materiáluŠlechtitelství.
Jednovýběrový a párový t - test
NÁZEV ŠKOLY: ZŠ Kopřivnice, Štramberská 189, příspěvková organizace
Název školy: ZŠ a MŠ Verneřice Autor výukového materiálu: Lenka Lehká
Ekosystém louka I. název: VY_32_INOVACE_18_Ekosystem_louka I
6. cvičení Selekce.
Užitkové rostliny, které se pěstují na polích nazýváme polní plodiny.
Hospodářské rostliny Základní škola a Mateřská škola Kateřinice, okres Vsetín projekt č. CZ.1.07/1.4.00/ Č. DUMu: VY_32_INOVACE_08_10_Ekosystémy.
Společenstva polí Rostliny
Základní škola a Mateřská škola Libáň, okres Jičín
Lipnicovité.
Sada:Přírodopis,2. stupeň Autor: Mgr. Zbyněk Němec Anotace: PÍCNINY
Název školy Plavská škola Autor Mgr. Jana Kneřová Název
Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Kódování materiálu
EKOSYSTÉM POLE je uměle vytvořený člověkem
Stanovení stupně ploidie a Stanovení hořkých semen
Transkript prezentace:

Laboratoř flow-cytometrie ŠS Hladké Životice Založení laboratoře v roce: 1998, definitivní podoba od roku 1999 Flow-cytometr Partec, model PA Ve ŠS se využívá pro určení relativního obsahu 2C DNA a k určení počtu chromozómů a stanovení stupně ploidie nebo určení typu apomixie hlavně u : mezidruhových a mezirodových hybridů jílků a kostřav (Festulolium) jetele lučního a jeho hybridů jílku vytrvalého, mnohokvětého a jednoletého kostřavy luční a rákosovité, kostřavy červené a ovčí lipnice luční, roční a obecné psinečku výběžkatého, tenkého a dalších druhů (ovsíku, srhy) Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Formou služeb laboratoř určovala relat. obsah DNA a počet chromozomů nebo úroveň ploidie u dalších druhů a plodin salát (Lactuca sp.) Kat. botaniky UP Olomouc trávy a jetele, žito, svazenku a další pícniny pro ÚKZUS Svitavy a ÚKZUP Sp. Vlachy, Osevu PRO Zubří, Agrogen Brno, Uni ŠS Větrov, Targo Červený dvůr a další firmy astry a jejich polyploidy pro MZLU Lednice řepky - kalusy a rostliny z prašníkových kultur VÚRV Ruzyně a Agritec Šumperk sóju a hrách pro Agritec různé druhy rostlin z And (Oxalis, ) pro ITZ ČZU Praha léčivky, orchideje, bonzaje a další druhy Za poslední 4 roky bylo změřeno kolem 40 tis. vzorků, za loňský rok bylo změřeno 14 tis. Vzorků, je-li cytometr provozuschopný, dvě laborantky pracují neustále. Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Laboratoř flow-cytometrie ŠS Hladké Životice Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

odstání se vzorek měří na cytometru. Protokol: Vzorek asi 25 mg listového nebo jiného pletiva se jemně naseká žiletkou v 180ml roztoku extrakčního pufru OTTO I, určeného k izolaci jader, získaná suspenze je doplněna 800ml roztoku OTTO II, obsahující DAPI. Vzorek se filtruje přes nylonový filtr 40m a po krátkém odstání se vzorek měří na cytometru. Pro jednotlivé druhy se používají jejich standarty - vybrané genotypy se známým relativním i absolutním obsahem DNA (DAPI, PI), které se udržují vegetativně klonováním. Na tyto standarty se pak měření vztahuje a počítá rel. obsah DNA nebo počet chromozomů. Při měření se používá nejčastěji směsný vzorek - vlastní vzorek a standarta současně. Pro některé účely se používá směs více vzorků dohromady (různé ploidie) nebo „ bulků“, kdy vzorek tvoří směs 10-20 jedinců (u odrůd). Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Měření obsahu DNA v Olomouci UEB, 12.11.2001 - PAS - PI Naše kontrola Obsah DNA (pg) Jetel luční 4n 1,8701 Smělek 5,0198 Jílek vytrvalý 2n 5,4296 Ovsík žlutavý Rožnovský 5,5323 Kostřava luční 6,4088 Psineček tenký Golf 6,8995 Psárka luční 13,1389 Kostřava červená Ferota 14,1130 Kostřava rákosová Kora 16,9005 jako standard byl použit hrách - 9,09 pg DNA Lipnice luční Slezanka 8,6455 pro Slezanku bylo použito jako standard žito - 16,19 pg DNA Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

JV 14 chrom. Hannibal FL 42 chrom. Hykor LL Slezanka 60 chrom KČ 42 chrom. Ferota Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Obsah DNA u jílků, kostřav a jejich hybridů měřených na PI a DAPI Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

jílek mnohokvětý 2n=4x =28, změřený na jílek vytrvalý 2n=2x=14 Příklad výpočtu počtu chromozómů: jílek mnohokvětý 2n=4x =28, změřený na jílek vytrvalý 2n=2x=14 počet chrom. = ( hodnota píku vzorku / hodnota píku standardu ) x počet chrom standartu 28.84 = 195.95 / 95.12 x 14 Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Směsný vzorek Festulolium, 7 genotypů s různým obsahem DNA Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Závislost (linearita) rel Závislost (linearita) rel. obsahu DNA a ploidie u jílků ( Lm, Lp) , kostřav (Fp, Fa) a jejich hybridů Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz

Referenční genotypy některých trav a jetelů pro flow-cytometrii Šlechtitelská Stanice Hladké Životice s.r.o. Fulnecká 95, 742 47 Hladké Životice; www.pbhz.cz