Makrozoobentos a klasifikace toků Jarkovský J. 2,3, Kubošová K. 2,3, Zahrádková S. 1, Brabec K. 1, Kokeš J. 4, Klapka R. 2,3 1) Ústav botaniky a zoologie,

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
VÝPOČET OC.
Advertisements

Vytváření podmínek pro podporu populací vranky obecné (Cottus gobio) v EVL Krkonoše Přednášející : Jiří KŘESINA.
Analýza experimentu pro robustní návrh
Sedm základních nástrojů managementu jakosti
Hodnocení způsobilosti měřících systémů
Audit administrativních činností
Hodnocení práce Hodnocení práce je nástrojem zajišťujícím, aby požadavky, náročnost, složitost a podmínky práce se odrazily v diferenciaci odměny pracovníka.
Biologická diverzita a Indexy biodiverzity
VÍCEKRITERIÁLNÍ ROZHODOVÁNÍ I.
Bakalářský seminář Úvod BP Závěr BP.
Testování hypotéz (ordinální data)
Tloušťková struktura porostu
Shlukovací algoritmy založené na vzorkování
Shluková analýza.
Příprava datového souboru pro vizualizaci a srovnání species abundance models.
Rozšíření dotazu a vývoj tématu v IR Jiří Dvorský Jan Martinovič Václav Snášel.
Novohradské statistické dny Poznámky k problematice určování počtu shluků Hana Řezanková Vysoká škola ekonomická v Praze.
Hodnocení, realizace a kontrolní etapa. Hodnotí se tři skupiny kriterií: A)Prospěšnost – žádoucnost 1. Jak navržená strategie pomáhá dosažení cílů? 2.
Vyhledávání podobností v datech s využitím singulárního rozkladu
VŠB - TU Ostrava, Fakulta Elektrotechniky a Informatiky Rozvoj RCM v elektroenergetice Ing. Jan Gala.
Systém rizikové analýzy při statickém návrhu podzemního díla Jan Pruška.
Podnikové informační systémy C7 – Data Mining a získávání znalostí České vysoké učení technické v Praze Fakulta strojní ústav Řízení a ekonomiky podniku.
DÚ I.1 Analýza podílu plošných a difúzních zdrojů na celkovém znečištění vod VÚV T.G.M, v.v.i, pobočka Ostrava, Ing. Martin Durčák.
Shluková analýza.
Umístění maloobchodní sítě - maloobchodních provozoven
STATISTIKA přednáška 1 Martin Sebera, FSpS MU, Sázíte-li ve Sportce, je to hazard. Sázíte-li se, že vám v kartách přijdou tři postupky po sobě,
Biostatistika 6. přednáška
Biostatistika 7. přednáška
Test dobré shody Fisherův přesný test McNemar test
Metody výběru variant Používají se pro výběr v případě více variant řešení stejného problému Lze vybírat dle jednoho nebo více kritérií V případě více.
Martin Komenda, Jan Švancara, Jiří Jarkovský, Ladislav Dušek Co lze vidět nad projektem OPTIMED: Validační analýza.
Analýza vstupních jazykových kompetencí studentů ZČU v Plzni Projekt INOVA CZ.1.07/2.2.00/
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Jarkovský, L. Dušek, M. Cvanová III. Kontingenční tabulky v Excelu.
1 MUDIM Mgr. Petr Šimeček. 2 Nevíte, co dělat s daty?
Úvod do ekologie.
RYCHLOST PROUDU A LARVY PAKOMÁRŮ: DVĚ ŘEKY A DVA EFEKTY Vít Syrovátka & Karel Brabec Ústav botaniky a zoologie Masarykova Univerzita GOCE-CT
Základy zpracování geologických dat
1 Tazatelé a dotazovací situace Jan Hartl. 2 CO a JAK?
© Institut biostatistiky a analýz INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ ANALÝZA A KLASIFIKACE DAT prof. Ing. Jiří Holčík, CSc.
8. Kontingenční tabulky a χ2 test
Vícerozměrné statistické metody
Normální rozdělení a ověření normality dat
Biostatistika 8. přednáška
Výzkum veřejného mínění a jeho realizace
Srovnání výpočetních modelů desky vyztužené trámem Libor Kasl Alois Materna Katedra stavební mechaniky FAST VŠB – TU Ostrava.
Základy pedagogické metodologie
Základní ekologické pojmy
Návrh a implementace algoritmů pro údržbu,
STATISTICKÝ ROZCESTNÍK aneb CO S DATY Martin Sebera.
Základy testování hypotéz
Vícerozměrné statistické metody Vícerozměrné statistické rozdělení a testy, operace s vektory a maticemi Jiří Jarkovský, Simona Littnerová.
© Institut biostatistiky a analýz INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ ANALÝZA A KLASIFIKACE DAT prof. Ing. Jiří Holčík, CSc.
Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i. | Podbabská 30/ 2582, Praha 6 | Pobočka Brno | Mojmírovo.
Ústav lékařské informatiky, 2. LF UK 2008 STATISTIKA II.
Prostorové analýzy Vymezení a rozdělení. Definice prostorových analýz Geoinformace Geodata (prostorová data) Prostorové analýzy jsou souborem technik.
Ukládání dat biodiverzity a jejich vizualizace
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J
Model rozložení sněhové pokrývky v povodí vodárenské nádrže Šance
Statistické testování – základní pojmy
VÍCEKRITERIÁLNÍ ROZHODOVÁNÍ I.
4. cvičení
Racionalizace logistických procesů ve vybrané společnosti
Multifaktorová analýza
Spojitá a kategoriální data Základní popisné statistiky
ANALÝZA VNITROPONIKOVÉHO KOMUNIKAČNÍHO SYSTÉMU VE VYBRANÉM PODNIKU
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J
Pravděpodobnost a matematická statistika I.
Obnova veřejné zeleně Libčice nad Vltavou
7. Kontingenční tabulky a χ2 test
Základy popisné statistiky
Transkript prezentace:

Makrozoobentos a klasifikace toků Jarkovský J. 2,3, Kubošová K. 2,3, Zahrádková S. 1, Brabec K. 1, Kokeš J. 4, Klapka R. 2,3 1) Ústav botaniky a zoologie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita 2) Centrum biostatistiky a analýza, Masarykova univerzita 3) Centrum pro environmentální chemii a ekotoxikologii, Masarykova univerzita 4) Výzkumný ústav vodohospodářský

Cíle práce Vytvoření klasifikace lokalit vodních toků ČR založených na společenstvech makrozoobentosu Aplikace metod data-miningu a expertního názoru na dostupná data –Lepší výsledek díky kombinovanému přístupu Kritéria pro vhodnou klasifikaci –Maximální homogenita společenstev ve shlucích –Maximální predikovatelnost abiotickými charakteristikami –Maximální souhlas s dosavadním stavem hydrobiologického poznání

Vstupní data 300 referenčních lokalit pokrývajících většinu říčních biotopů v ČR

Postup analýzy Analýza byla vytvořena pro tři sady taxonů –Taxony s výskytem na více než 10 lokalitách –EPT taxony –Taxony s významnou vazbou na abiotické charakteristiky prostředí Doplněno o dvě TWINSPAN klasifikace

Srovnání vztahů různých přístupů ke klasifikaci 12 vstupních souborů pro klasifikaci – různé pohledy na společenstva B B A A B C E F E F F C

Abiotické charakteristiky lokalit Dostupné parametry: nadmořská výška, plocha povodí, vzdálenost od pramene, Strahler, geogr. souřadnice, šířka a hloubka toku, sklon, vodivost, tvrdost atd. Bohužel není dostupná využitelná informace o geologii Většina variability lokalit je nesena nadmořskou výškou a plochou povodí (nebo Strahlerovým pořadím toků) Ostatní parametry jsou navzájem silně redundantní a nepřispívají k vysvětlení variability dat Existence vazby mezi taxony a podmínkami prostředí

Výběr indikačních taxonů Taxony s nejvyšší vazbou na nad. výšku, spád toku, velikost povodí a Strahler Celkem 103 taxonů s významnou vazbou alespoň na jeden z parametrů pomocí metody náhodných lesů Důležitost vazby

Selekce optimálního řešení 1. krok – eliminace statisticky a expertně nesmyslných řešení –Nejlepší řešení: Shlukování na základě transformovaných abundancí indikačních taxonů 2. krok – nalezení optimálního rozdělení do počtu shluků –Vnitřní homogenita –Klasifikovatelnost abiotickými charakteristikami ???

Hledání optimálního shlukování Silhouette metoda – hledání vícerozměrně nejvíce homogenního počtu shluků Kumulativní „silueta“ shlukování Optimální z hlediska statistiky, zcela nevhodné z hlediska hydrobiologického Průnik statistického a expertního přístupu Další rozbor

Hledání optimálního počtu shluků Expertní rozdělení na 20 shluků „Silueta“ daného počtu shlukování Počet shluků Nízký počet shluků lze snadno oddělit Nejsou výrazné rozdíly v různých řešeních počtu shluků Expertní a statistické řešení nejsou v rozporu

Zpětná klasifikace pomocí abiotických parametrů Určitá míra misklasifikace při zpětném zařazení pomocí abiotických dat Nicméně většina misklasifikací je v příbuzných shlucích Využitelnost klasifikace v pravděpodobnostních modelech

Popis vytvořené klasifikace I Ukázka abiotického popisu dat

Popis vytvořené klasifikace II - ukázka Shluk 1 Vazba taxonu Shluk 20

Srovnání s výsledky TWINSPAN „Silueta“ pro 20 shluků„Silueta“ pro 35 shluků Největší souvislost TWINSPAN klasifikace s vybranou klasifikací na Bray- Curtis vzdálenostech TWINSPAN Hiearch. Klastr.

Závěry a shrnutí Při tvorbě klasifikací je s úspěchem možno využít podpory moderních statistických a data-miningových metod Pro vytvoření validní klasifikace je nezbytná spolupráce statistického a expertního pohledu Pro využití při hodnocení ekologického stavu se nejlépe jeví klasifikace využívající matice Bray-Curtisových vzdáleností společenstev pro 20 shluků Využití a potvrzení závěrů je předmětem další analýzy

Poděkování Práce byla podporována následujícími projekty: MŠMT INCHEMBIOL MŠMT