Laboratoř potravinářské mikrobiologie (Rokoska)

Slides:

Advertisements

Podobné prezentace

Ilustrace podkladů pro prezentaci

Advertisements

Ing. Martin Vyvážil, Ing. Vladan Prachař

TROMBOFILNÍ MUTACE A RIZIKOVÉ FAKTORY U MLADÝCH DÍVEK ČESKÉ POPULACE UŽÍVAJÍCÍCH HORMONÁLNÍ ANTIKONCEPCI MUDr. Zdenka Vlčková GHC GENETICS, s.r.o. –

Zpracování informací a znalostí Booleovský model vyhledávání dokumentů a jeho rozšiřování Doc. RNDr. Jan Rauch, CSc. Katedra informačního a znalostního.

Možnosti analýzy perfuze mozku pomocí DECT

Konzultační dny 2005 EXTERNÍ HODNOCENÍ KVALITY HYBRID CAPTURE II Jana Šmahelová.

Zadání bakalářské práce Optimalizace výrobního zařízení z pohledu ergonomie.

9 CELÁ ČÍSLA

DÚ 2.1 Mikrobiální kontaminace povrchových vod v povodí Odry

Kvantitativní RT-PCR Praha

Dynamické rozvozní úlohy

Projekt Inkluze – nová cesta vzdělávání OP Vzdělávání pro konkurenceschopnost registrační číslo projektu CZ.1.07/1.2.02/ Závěrečná konference 16.

Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.

Stanovení počtu vybraných indikátorových mikroorganismů v potravinách pomocí automatizované metody TEMPO® Mikrobiologie potravin, IV. ročník Ústav hygieny.

Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,

Nové metody zkoušení a zátěžové testy kosmetických prostředků

Powered by Ing. Miroslav Kleňha tel:

Virusneutralizace v diagnostice chřipkové infekce Martina Havlíčková.

Výsledky výzkumu ve vzdělávacích institucích doc. Ing. Josef Vaculík, CSc. Ing. Petr Urbanec Univerzita Pardubice.

Analýza kontaminace půd těžkými kovy

Mechanické vlastnosti celulózových vláken

1 Národní informační středisko pro podporu jakosti.

IONIZAČNÍ POTENCIÁLY A FÁZOVÉ PŘECHODY KLASTRŮ ARGONU

Cvičná hodnotící prezentace Hodnocení vybraného projektu 1.

Test akutní toxicity na rybách

Real-time PCR - princip

FEM model pohybu vlhkostního pole ve dřevě - rychlost navlhání dřeva

Mikrobiální znečištění povrchových a odpadních vod

Mikrobiologie vody... výskyt, význam, detekce bakterií ve vodách

Laboratorní model „Kulička na ploše“ 1. Analytická identifikace modelu „Kulička na ploše“ 2. Program „Flash MX 2004“ Výhody/Nevýhody Program „kulnapl.swf“

Stravitelnost organické hmoty a metody jejího stanovení

Petr Horník školitel: doc. Ing. Antonín Potěšil, CSc.

Katedra biologických a biochemických věd FCHT, Univerzita Pardubice

ZKUŠEBNICTVÍ A KONTROLA JAKOSTI 01. Experimentální zkoušení KDE? V laboratoři In-situ (na stavbách) CO? Modely konstrukčních částí Menší konstrukční části.

VŠB Technická univerzita Ostrava

Antimikrobiální látky

Metodika poradenství podpory zdraví a prevence nemocí

F.I.S.H. hotovo.

1 Řízení implementace IS a SS* Šablony. 2 Vzorové postupy.

MLPA MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION

Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller

Vyšetřovací metody v bakteriologii

PCR Polymerase Chain Reaction

HODNOCENÍ ANALYTICKÝCH DAT JAN TŘÍSKA CENTRUM VÝZKUMU GLOBÁLNÍ ZMĚNY AV ČR ČESKÉ BUDĚJOVICE.

Případová studie Seminář 2014.

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i.

EVROPSKÝ FOND PRO REGIONÁLNÍ ROZVOJ

Struktura bakalářské práce

Laser Simulation DSS Ing. Jana Hájková Doc. Ing. Pavel Herout, Ph.D.

Ústav technických zařízení budov MĚŘENÍ A REGULACE Ing. Václav Rada, CSc. ZS – 2003/

Molekulární biotechnologie č.10a Využití poznatků molekulární biotechnologie. Molekulární diagnostika.

Laboratorní diagnostika PRRS: rutina nebo umění ? Jiří Smola a Vladimír Celer Ústav mikrobiologie a imunologie.

Flexibilní rozsah akreditace – fyzikálně chemické analýzy Eva Břízová, Pavel Kořínek Seminář ČIA Flexibilní rozsah akreditace laboratoří Brno 11. října.

Stanovení citlivosti mikroorganismů k ATB Mgr. Petra Straková Podzim 2014 Cvičení z obecné mikrobiologie.

Environmentální aplikace molekulární biologie

QF-PCR v prenatální diagnostice častých aneuploidií - naše pětileté zkušenosti . M. Putzová & GENNET.

qRT-PCR Kryostat Mgr. Jiřina Medalová, Ph.D. Mgr. Martina Lánová RNDr. Josef Večeřa, Ph.D. Bc.

Co je MSO? proces vysokoteplotní likvidace organických odpadů

Real-time PCR - princip

MOŽNOSTI DETEKCE LIKVOREY

Analýza merchandisingu a nákupní atmosféry vybrané obchodní jednotky

OPTIMALIZACE LOGISTICKÝCH PROCESŮ VE FIRMĚ BAUER TECHNICS a.s.

RT – PCR: návrh primerů.

SMAMII Amplifikační metody.

Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,

Jan Abraham, Helena Plachá, Eva Paznerová

18b-Metody studia nukleových kyselin

Doc. RNDr. Jakub Hofman, Ph.D. jaro 2014

Shredlage v krmných dávkách vysokoprodukčních dojnic – postřehy z praxe Ing. Roman Poštulka, Ph.D. tel

Transkript prezentace:

Laboratoř potravinářské mikrobiologie (Rokoska) Ústav 320 Lucie Vondráková prof. Ing. Kateřina Demnerová, CSc. doc. RNDr. Jarmila Pazlarová, CSc.

Úvodem … Termotolerantní Campylobacter spp. G- tyčinky Mikroaerofilní atmosféra Optimální teplota 42 °C Onemocnění Akutní střevní infekce tzv. kampylobakterióza C. jejuni (80-85 %) C. coli C. lari Infekční dávka velmi nízká Závažné postinfekční komplikace www.photoshelter.com

Detekce, identifikace a kvantifikace termotolerantních Campylobacter spp. ČSN EN ISO 10272–1 Mikrobiologie potravin a krmiv - horizontální metoda průkazu a stanovení počtu Campylobacter spp. Selektivní pomnožení Problém rozlišení mezi jednotlivými druhy Nízká biochemická aktivita kampylobakterů Rostoucí počty rezistentních kmenů Časová náročnost

Multiplex qPCR detekce, druhová identifikace primery cílené na druhově specifické geny C. jejuni – hipO (hipurikasa) C. coli – glyA (serin hydroxymethyltransferasa) C. lari – pepT (peptidasa T) absolutní kvantifikace a možnost provedení v multiplexu vynechání pomnožovacího kroku zjištění počtu porovnáním se standardními křivkami triplex – duálně značené hydrolyzační sondy

Návrh protokolu qPCR a výsledky In silico analýza FastPCR nBLAST výběr, chemické modifikace, nastavení experimentu Experimentální postup klasická PCR s elektroforetickým vyhodnocením singleplex/multiplex real-time PCR se SYBR Green křivka tání s cílovými i dalšími druhy kampylobakterů

Analýza křivky tání C. lari C. coli C. jejuni

Návrh protokolu qPCR a výsledky singleplex qPCR multiplex qPCR DNA vzorek jednoho druhu/směsný vzorek DNA validace protokolu na reálných vzorcích - oplachy kuřecích křídel - umělá kontaminace v rozsahu 101-105 CFU/ml - porovnání s klasickou metodou počítání CFU na miskách - kvantifikace pomocí qPCR možná i u nejvyššího ředění - misky – C. jejuni při nejvyšším ředění 100 % negativní, C. coli 33 % a C. lari 67 %

Závěrem Analýza dat a satistika Druh Efektivita (%) LOD (CFU/rce) R2 Slope C. jejuni 90.85 6.62 < LOD < 16.10 0.998 -3.565 C. coli 96.97 5.13 < LOD < 6.30 -3.399 C. lari 92.89 4.87 < LOD < 5.23 -3.506 Analýza dat a satistika 7500 Software (Applied Biosystems, USA, verze 2.0.5) GenEx software (MultiD Analyses AB, Sweden, verze GenEx 5 Enterprise) MIQE guidelines

Děkuji za pozornost