Bakteriální oxidace uhlovodíků

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
PRINCIP SOUČASNÉHO NÁZVOSLOVÍ ANORGANICKÝCH SLOUČENIN
Advertisements

Karbonylové sloučeniny
21.1 Vím, jakým způsobem třídíme chemické rovnice.
Mangan.
Vznik protonmotivní síly při fotosyntéze
III. fáze katabolismu Citrátový cyklus
Redoxní reakce = Oxidačně-redukční reakce (učebnice str. 60???)
Typy chemických reakcí
Stálost v roztoku [M(H2O)6] [MLn] [ML(n – 1) ] · [L] k k3 (kn) =
REDOXNÍ DĚJ RZ
Chemie 9.ročník Mgr. Daniela Ponertová
Metabolismus sacharidů
Druhy chemických reakcí
Názvosloví halogenidů
VIII. OXIDAČNĚ - REDUKČNÍ (REDOX) REAKCE
Identifikace vzdělávacího materiálu
Citrátový cyklus a Dýchací řetězec
Vyčíslení chem. rovnic.
REDOXNÍ DĚJ.
Klasifikace chemických reakcí
NÁZVOSLOVÍ HYDROXIDŮ.
S SO S2-S2- Přírodovědecká fakulta Jihočeské Univerzity Katedra fyziologie rostlin Kurz fyziologie rostlin Minerální výživa rostlin 3 Ivan Šetlík.
přeměna látek a energie
OXIDAČNĚ REDUKČNÍ REAKCE
Obecné principy metabolismu Biologické oxidace, makroergní sloučeniny
ORGANICKÁ CHEMIE OPAKOVÁNÍ
přeměna látek a energie
Metabolismus sacharidů
Organické sloučeniny obsahující síru
Metabolismus sacharidů
Princip, jednotlivé fáze
NÁZEV ŠKOLY: Základní škola Javorník, okres Jeseník REDIZO: NÁZEV:VY_32_INOVACE_139_Druhy chemických reakcí AUTOR: Igor Dubovan ROČNÍK, DATUM:
Aktivita č.6: Poznáváme chemii Prezentace č. 26 Autor: Lenka Poláková
Redoxní reakce 9.A, B 23/5 3-ox.;.
NÁZVOSLOVÍ DVOUPRVKOVÝCH SLOUČENIN
Metabolismus sacharidů
Redoxní reakce.
ÚPRAVA OXIDAČNĚ REDUKČNÍ ROVNIC
DÝCHACÍ ŘETĚZEC. enzymy jsou umístěny na vnitřní membráně mitochondrií získání energie (tvorba makroergických vazeb v ATP) probíhá oxidací redukovaných.
Kapaliny a roztoky Rozpustnost – děj na molekulární úrovni
Fotosyntésa.
Fotosyntéza Základ života na Zemi.
Fotosyntéza Klára Mavrov.
Fotosyntéza Světelná fáze.
Dýchací řetězec a oxidativní fosforylace
Jméno autoraMgr. Eva Truxová název projektuModernizace výuky na ZŠ Česká Lípa, Pátova ulice číslo projektuCZ.1.07/1.4.00/ číslo šablony V/2 Inovace.
Redox procesy – přenos elektronů Marcus a Hush: 4  3 2 (  G ° + ) 2 k ET k ET = · H AB · exp – h 2 k B T 4 k B T.. – – nuclear reorganisation parameter.
Úvod.
(Citrátový cyklus, Cyklus kyseliny citrónové)
Světelná reakce fotosyntézy.
Heterocyklické sloučeniny
Cyklus kyseliny citrónové, citrátový cyklus.
OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE
Energetický metabolismus
Biogenní prvky.
1 DÝCHACÍ ŘETĚZEC. 2 PRINCIP -většina hetero. organismů získává hlavní podíl energie (asi 90%) procesem DÝCHÁNÍ = RESPIRACE -při tomto ději – se předávají.
REDOXNÍ REAKCE Chemie 9. ročník
CITRÁTOVÝ CYKLUS = KREBSŮV CYKLUS= CYKLUS TRIKARBOXYLOVÝCH KYSELIN CH 3 CO-ScoA + 3H 2 O  2CO  H  + CoASH.
CO JE FOTOSYNTÉZA?  Soubor chemických reakcí, v jejichž průběhu dochází k pohlcování energie slunečního záření, která je využita k přeměně jednoduchých.
NÁZEV ŠKOLY: ZŠ J. E. Purkyně Libochovice AUTOR: RNDr. Adéla Lipšová NÁZEV: VY_52_INOVACE_11_REDOXNÍ REAKCE TÉMA: REDOXNÍ REAKCE ČÍSLO PROJEKTU: CZ.1.07/1.4.00/
Elektronické učební materiály – II. stupeň Chemie 9 Autor: Mgr. Radek Martinák REDOXNÍ REAKCE.
Redoxní reakce.
Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je
Obecná a anorganická chemie
Stanovení genotypu a aktivity alkohol dehydrogenasy z krve
Lékařská chemie Aminokyseliny Peptidy, proteiny Primární, sekundární, terciární a kvartérní struktura proteinů.
C5720 Biochemie 13-Koenzymy a vitaminy Petr Zbořil 9/18/2018.
25_Speciální metabolické dráhy
Mgr. Natálie Čeplová Fyziologie rostlin.
Lékařská chemie Aminokyseliny.
Transkript prezentace:

Bakteriální oxidace uhlovodíků NADH CH4 CH3OH O2 H2O Fe2S2 FAD R Fe O H B    Bakteriální oxidace uhlovodíků Fe2III + O2H– Fe2IV = O H2O PFeIII + O2H– PFeV = O H2O •PFeIV = O Bakteriální oxidace uhlovodíků

Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků FeII hem FeIII FeIV + FeV – CO + CO O2 e– H2O R–H R–OH 2 H+ XOH XOOH Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků

Ferredoxin Fe Gly 12 Cys 11 Cys 14 Ala 13 S

Ferredoxin Změny náboje a oxidačních stavů železa ve ferredoxinu: [ 4 Fe – 4 S ] 0 [ 4 Fe – 4 S ] 1+ [ 4 Fe – 4 S ] 2+ [ 4 Fe – 4 S ] 3+ 4 Fe(II) 3 Fe(II) + Fe(III) 2 Fe(II) + 2 Fe(III) Fe(II) + 3 Fe(III) proteiny: — Fdred Fdox / HPred HPox + 0,1 až + 0,3 V – 0,3 až – 0,5 V analoga: [Fe4S4(SR)4]4 – *[Fe4S4(SR)4]3 – *[Fe4S4(SR)4]2 – *[Fe4S4(SR)4]1 – Fd = ferredoxin HP = „high-potencial“ protein * izolováno

Fe – S klastry Ferredoxin SR RS – 2,269 Å 2,208 Å 2,233 Å Fe – S klastry Ferredoxin Fe S SR RS 3– 2,286 Å 2,295 Å 2,354 Å Fe4S4(SR)4– Fe S SR RS 2– 2,296 Å 2,263 Å 2,267 Å Fe4S4(SR)43– Fe4S4(SR)42–

Transport elektronu přes ferredoxin B C

Tvorba radikálů Methionin S-adenosyl methionin

Fe – S klastry (I) 1 3 4 2 6 5

Fe – S klastry (I I) 8 7 10 9

Syntézy FeS klastrů [FeCl4]2– [Fe(SEt)4]2– [Fe3S4(SEt)4]3– 4 NaSEt, MeCN [Fe3S4(SEt)4]3– [Fe3S4(SR)4]3– [Fe4S4(SEt)4]2– [Fe2S2(SEt)4]2– [Fe6S9(SEt)2]4– [Fe6S9(SR)2]4– 1,4 S; Me2CO 4 RSH, MeCN 2 RSH, MeCN 60 ºC, MeCN 1,5 S; 85 ºC; MeCN 1 S; MeCN 80 ºC, MeCN MeCN 1 FeCl2, 1 NaSEt

Chlorofyl R ’ R Mg hydrofobní řetězec a: R = CH3 b: R = CHO

Umístění atomů železa v chlorofylu 2 feofytiny ne-hemové 4 hemy 4 chlorofyly 2 chinony železo Chlorofyl Umístění atomů železa v chlorofylu

Fotosyntéza – „Z“-schema P680 P700

Fotosyntéza – „Z“-schema Fotosystém II Fotosystém I Tok elektronů ve fotosystémech I a II

Fotosyntéza P680 Mn S0  S1  S2  S3  S4 2 H2O  O2 + 4 H + + 4 e– P680 Klastr čtyř atomů Mn Mn

Fotosyntéza S0  S1  S2  S3  S4 2 H2O  O2 + 4 H + + 4 e– O2 III – H+ H O H2O

Fotosyntéza S0  S1  S2  S3  S4 2 H2O  O2 + 4 H + + 4 e– O2 III – e – H+ IV H O

Fotosyntéza S0  S1  S2  S3  S4 2 H2O  O2 + 4 H + + 4 e– O2 III – e IV O

Fotosyntéza S0  S1  S2  S3  S4 2 H2O  O2 + 4 H + + 4 e– O2 O III – e IV O – e – 2H+

Fotosyntéza S0  S1  S2  S3  S4 2 H2O  O2 + 4 H + + 4 e– O2 III – 2 H+ IV O (S4 ) S0 + H2O

Modelové sloučeniny klastrů manganu [Mn4O2ac7bipy2] [Mn3O3Cl4ac3py2] [Mn4O2ac6bipy2]

N H Co N Corrin

Vitamín B-12 (kobalamin) Co+ R a) R = CH3 methylkobalamin . b) R = H2O aquokobalamin c) R = – C  N – kyanokobalamin (vitamin B-12) d) R = adenosylkobalamin (koenzym B-12)

Koenzym B-12

Příklady reakcí katalyzovaných vitamínem B-12 Záměna funkčních skupin Přenos methylu Ribonukleotid reduktáza Glutamát mutáza Redukce ribonukleotid Diol dehydratáza deoxyribonukleotid + – Methionin syntetáza Příklady reakcí katalyzovaných vitamínem B-12

Obecné schema mechanismu isomerázy závislé na adenosyl-kobaltaminu

Methionin syntetáza

Methionin syntetáza

Methyl transferáza

Katalytický mechanismus záměny funkčních skupin