Projekt HAPMAP 2002-2005 Popis haplotypů

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Mendelovy zákony, gonozomální dědičnost, Hardy-Weibergův zákon
Advertisements

Statistické metody pro testování asociace genů a nemocí
Genetika člověka.
Genetický polymorfismus
Základní genetické pojmy – AZ kvíz
Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice
Poznámky identifikaci SNP
POPULAČNÍ GENETIKA 6 faktory narušující rovnováhu populací
Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Světové obyvatelstvo.
Hardy – Weibergův zákon
Markery asistovaná selekce
Genetika populací, rodokmen
vytvořený v projektu OP VK
Opakování 1. K čemu slouží DNA? 2. Kde jsou umístěny chromozomy?
Využití v systematické biologii
1 Škola:Chomutovské soukromé gymnázium Číslo projektu:CZ.1.07/1.5.00/ Název projektu:Moderní škola Název materiálu:VY_32_INOVACE_BIOLOGIE 2_20 Tematická.
Název školy: ZÁKLADNÍ ŠKOLA PODBOŘANY, HUSOVA 276, OKRES LOUNY Autor: ING. EVA ŠÍDOVÁ Název:VY_32_INOVACE_621_GENETIKA Téma:ZÁKLADNÍ GENETICKÉ POJMY Číslo.
Dědičnost monogenní znaků
Projekt HUGO – milníky - I
1 Škola:Chomutovské soukromé gymnázium Číslo projektu:CZ.1.07/1.5.00/ Název projektu:Moderní škola Název materiálu:VY_32_INOVACE_BIOLOGIE 2_06 Tematická.
Autor: Mgr. Tomáš Hasík Určení: Septima, III.G
Společenské a hospodářské prostředí
Genetická variabilita populací  Pacient je obrazem rodiny a následně populace, ke které patří  Distribuci genů v populaci, a to jak jsou četnosti genů.
Populační genetika.
Genomika hospodářských zvířat
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
 VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI = nejdůležitější mikroevoluční
POLOHA, ROZLOHA A LIDNATOST
Ochrana rostlinného a živočišného genofondu
Polymorfismus lidské DNA.
Haplo-diploidní systém blanokřídlí Samec - haploidní z neoplozeného vajíčka Samice – diploidní z oplozeného vajíčka.
HW model: jedna zcela izolovaná populace  populace často rozděleny do subpopulací genetická výměna mezi lokálními populacemi = tok genů (gene flow) A.
Příklady z populační genetiky
Mendelistická genetika
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
meiotická segregace a kombinace genů
gonozomální dědičnost
Základní typy genetických chorob Marie Černá
GENETIKA.
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková
Praktikum z genetiky rostlin JS Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana Genetické mapování genu odolnosti k padlí.
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
OBYVATELSTVO A SÍDLA.
SNPs Single Nucleotide Polymorphism Polymorfimus DNA, kdy se jedinci nebo druhy liší v jedné nukleotidové záměně AAGCCTA AAGCTTA V tomto případě mluvíme.
Teoretické principy šlechtění a selekce Tomáš Kopec.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Vazba genů – teoretický základ Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/7 Šablona: III/2 Inovace a zkvalitnění.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – řešené příklady Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/14 Šablona: III/2 Inovace.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Vazba genů – příklady k procvičování Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/8 Šablona: III/2 Inovace.
Genetika populací Doc. Ing. Karel Mach, Csc.. Genetika populací Populace = každá větší skupina organismů (rostlin, zvířat,…) stejného původu (rozšířená.
Šlechtění hospodářských zvířat Doc. Ing. Karel Mach, CSc.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – teoretický základ Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10 /13 Šablona: III/2 Inovace.
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Nepřímá DNA diagnostika
Lidské rasy.
Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková
Molekulárně-biologické databáze
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
Genetika Přírodopis 9. r..
VY_32_INOVACE_19_28_Genetika
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Základní škola, Hradec Králové
Jana Michalová Tereza Nováková Radka Ocásková
Výukový materiál VY_52_INOVACE_22_ Nukleové kyseliny
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
Studium lidského genomu
Co to je DNA? Advanced Genetics, s.r.o..
37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
Transkript prezentace:

Projekt HAPMAP Popis haplotypů

Informace o projektu HapMap  Konsorcium pracovišť a grantových agentur z Kanady, Číny, Japonska, Nigérie, VB a USA  Hledání genů spojených s chorobami lidí  Cílem je popis haplotypů  Probíhal v letech 2002 až 2005  V katalogu varianty genů  uvnitř populace  mezi populacemi po celém světě

Sekvence nukleotidů 2 jedinců  1 rozdíl každých nukleotidů  varianty genů = alely  soubor alel = genotyp Alela není haplotyp !

Single nucleotide polymorphism  jednoduché nukleotidové záměny = SNP  10 milionů SNP u člověka  princip genové vazby

Pojem haplotyp Haplotyp tvoří takové oblasti genetických polymorfismů, které jsou spolu ve vazbě

Genotypizace Genotypizace = vyhledávání tag SNP V vedeném příkladu je genotypizací tří „tag SNP“ možno určit, který ze čtyř haplotypů se vyskytuje u probanda

Jiný příklad genotypizace

Četnost haplotypů

Vznik haplotypů  rekombinace - vznik hybridních chromozómů  segmenty chromozómů neporušené rekombinací = haplotypy Mnoho generací

Distribuce haplotypů  migrace z Afriky ( let)  populace mimo Afriku méně variabilní  četnosti haplotypů se liší podle regionů  lidské rasy jsou si rovné, neexistují černé, žluté či bílé geny, jen jejich varianty Lidské rasy se liší četností haplotypů