Institucionální financování Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Jan Kopečný a Michal Kubelka

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika LaboratořKvalitaRelevanceSvět Studenti a personálníOstatníCelkem Kaňka LVB323433,15 Kubelka LBMBZB Motlík LBRP121211,25 Anger LPMT Míšek LEŽ332332,8 Horák LBN443443,8 Ráb LGR Macholán LEGS232322,25 Stratil LGŽ343423,2 Marounek LFV443523,9 Kopečný LAM333222,75 ÚŽFG Hodnocení 1 – 1,25 posílení personální a materiální laboratoře 2.Hodnocení 1, posílení materiální laboratoře 3.Hodnocení 2 – 3nové výběrové řízení na vedoucího laboratoře 4.Hodnocení 3 a vícezrušení laboratoře Stimulační systém hodnocení: Kvalita publikací Vyhodnocování publikační aktivity laboratoří Odměňování vynikajících publikací Personální podpora a doktorandi Interní grantová agentura Konference doktorandů Odměňování aktivních navrhovatelů grantů Navracení části režií navrhovatelům grantů

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika KvalitaPodíl autorů ÚŽFGPodíl v ústavu Mikrobiologie 2,416 50%15,3 Biochemie z. b. 2,375 75%9,6 Embryologie 2,875 75%12,6 ExAM 2,542 58%34,2 Evoluční biologie 1,875 83%21,2 Vývojová genetika 2, %7,1 ÚŽFG celkem: 2,349 69%100 I. Fáze hodnocení 12345Průměr Evoluční BiologieRáb996001,875 Biochemie zárodečných buněkKubelka215002,375 Anaerobní mikrobiologieŠimůnek156002,417 ExamJuhás ,542 Vývojová genetikaKaňka115002,571 EmbryologieBuchtová025102,875

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Kvalita výsledků a podíl týmů I. Fáze hodnocení 12345Průměr UFCH ,011 UBO ,014 UOCHB ,084 UIACH ,188 BFU ,234 UMG ,287 UEB ,295 BTU ,311 BU ,336 MBU ,360 UMCH ,417 BC ,455 UACH ,473 UEM ,513 UCHP ,534 FGU ,535 CVGZ ,617 Celkem ,336 Vybrané výsledky II. vědní oblasti

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Kvalita výsledků a podíl týmů II. Fáze hodnocení KvalitaPodíl v ústavu Mikrobiologie Zvyšující se kvalita výstupů během sledované periody 15,3 Biochemie z. b. Viditelná mezinárodně, mnoho ocenění, 9,6 EmbryologieVysoká produktivita kvalitních publikací, 12,6 ExAMVýsledky dobré a některé velmi dobré 34,2 Evoluční biologieVynikající publikace, mnoho ocenění 21,2 Vývojová genetika Časopisy o reprodukční biologii, většinou z 3Q 7,1 ÚŽFG celkem:Většinou dobré až velmi dobré. Většina čs. grantů, 45% zachrničních. 100

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Kvalita výsledků a podíl týmů Ocenění pracovníků MVDr. Martin Anger, CSc. – Fellowship J.E.Purkyně AV ČR (pro význačné perspektivní vědecké pracovníky) excelence/fellowship_purkyne/udeleny_fellowship/2008.html Prof. Ing. Petr Ráb, DrSc. a kol. - Cena AV ČR za dosažené vynikající výsledky velkého vědeckého významu (Vědecký výsledek: Klonální obratlovci: objev, mechanismy, biodiversita a rekonstrukce na modelu sekavcovitých ryb) - autorský tým Ústavu živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i., ve složení: Mgr. Karel Janko, Ph.D., prof. Ing. Petr Ráb, DrSc., Ing. Marie Rábová, CSc., RNDr. Vlastimil Šlechta, CSc., Ing. Věra Šlechtová, CSc., RNDr. Petr Kotlík, Ph.D., Dr. Jörg Bohlen, PhD., Mgr. Vendula Bohlen Šlechtová, Ph.D., Bc. Jana Kopecká, Bc. Šárka Pelikánová, RNDr. Lukáš Choleva, Ph.D., Ing. Martin Flajšhans, Dr. rer. agr., doc. Ing. Lukáš Kalous, Ph.D., RNDr. Zdeněk Lajbner, Ph.D., Ing. Jan Kohout, Mgr. Alena Kohoutová Šedivá, Ph.D. badatele.html Prof. MVDr. Jan Motlík, DrSc. – člen Klubu českých hlav RNDr. Hana Kovářová, CSc. – Cena Arnolda Beckmana za proteomiku Ing. Josef Matoušek, DrSc. - Čestná medaile Za zásluhy o Akademii věd ČR _26_AR_www.pdf?

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Kvalita výsledků a podíl týmů Ocenění pracovníků Prof. RNDr. Eva Matalová, CSc – Cena L´Oreal pro ženy ve vědě Ing. Michal Kubelka, CSc., Ing. Andrej Šušor, PhD. – Nominace na Cenu Česká hlava 2015 (na základě výzkumu publikovaném v časopise Nature Communications – tiskové zprávy) Mgr. Karel Janko, PhD., Mgr. Vendula Bohlen-Šlechtová, PhD. –Prémie Otto Wichterleho AV ČR wichterle/2012.html RNDr. Lukáš Choleva, PhD., Mgr. Helena Kupcová-Skalníková, PhD. –Prémie Otto Wichterleho AV ČR /2013.html Ing. Michaela Strážnická – Cena ministra životního prostředí Ing. Jiří Killer, PhD - Cena pro nejlepšího českého a slovenského mladého mikrobiologa za rok Československá společnost mikrobiologická

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Společenská, sociální a ekonomická relevance Společenská (sociální, ekonomická a kulturní) relevancePodíl v ústavu MikrobiologieVýznamné je získávání nových znalostí o anaerobech a možné praktické aplikace 15,3 Biochemie z. b,Význam aneuploidie, embryonální vývoj9,6 EmbryologiePokročilé metody kraniofaciálního vývoje, možné aplikace 12,6 ExAMStudium a léčba neurodegenerativích onemocnění má vysokou relevanci 34,2 Evoluční biologiePřínosy k praktickému rybářství, dobré aplikace21,2 Vývojová genetikaVýznamné přínosy k živočišné produkci7,1 ÚŽFG celkem:Praktické výstupy a popularizační aktivity100

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Studenti ve výzkumu Zapojení studentů do výzkumuPodíl v ústavu MikrobiologieMnoho studentů středo- i vysokoškolských15,3 Biochemie z. b,Přednášky, dostatek studentů přímo ve výzkumu9,6 EmbryologieMnoho studentů, přednášky na několika školách12,6 ExAMZapojení studentů do výzkumu je vysoké34,2 Evoluční biologieDostatek studentů ve výzkumu, mnoho má ocenění21,2 Vývojová genetikaStřední zapojení studentů, je třeba zvýšit.7,1 ÚŽFG celkem:Podíl studentů na výzkumu většinou velmi dobré, některé týmy mají rezervy. 100

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Národní a mezinárodní kontext MezinárodníNárodníPodíl v ústavu MikrobiologieUznávaní 15,3 Biochemie z. b,Viditelní a respektovaníVýznamní9,6 EmbryologieMnoho spoluprací a návštěv, viditelní Uznávaní vedoucí v oboru12,6 ExAMPrasečí model je částečně vnímán mezinárodně V národním měřítku je model unikátní. 34,2 Evoluční biologieViditelní a respektovaní Významní21,2 Vývojová genetikaUznávaní 7,1 ÚŽFG celkem:Hodně spoluprací laboratoří Uznávaní100

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Vitalita, udržitelnost a perspektiva VitalitaUdržitelnostPerspektiva MikrobiologieDobrá personální struktura Získat nové postdokyDobrá, udržovat kontakt s mezinárodními partnery Biochemie z. b,Dostatek grantů Silná témataVelmi dobrá EmbryologieDostatek českých grantů Velmi dobrá ExAMPochybují o možné spolupráci jednotlivých laboratoří Pochybují o možné udržitelnosti celého projektu PIGMOD Doporučují vyšší specializaci Centra PIGMOD Evoluční biologieDobrá personální struktura Dostatek grantůVynikající, mnoho ocenění Vývojová genetikaDobrá personální struktura Nový vedoucí laboratoře Dostatek schůdných cílů ÚŽFG celkem:Většinou optimální věková struktura Dobré spolupráceDobré předpoklady do budoucna.

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Strategie a záměry do budoucnosti Strategie do budoucnaZáměry Mikrobiologiemetabolomika a funkční proteomika Mezinárodní především evropské projekty Biochemie z. b.Aneuploidie a změny morfologie preimplantačních embryí Pokračování stejnými způsoby EmbryologieŠiroký záběr týmu zúžit, získat větší granty Pokračovat na zúženém zaměření ExAMKomise doporučuje vyšší specializaci Centra PIGMOD a provázání s klinickým výzkumem Centrum se chce zaměřit na modely dalších chorob. Evoluční biologiepokračování studia, asexuální rozmnožování, fylogenomika, Globální změny počasí, domestikace ryb Vývojová genetikaChybí ambiciózní cíleNoví postdoci ÚŽFG celkem:Dobrá stávající strategie Omicsové technologie a transkriptomika Zahraniční poradní skupina

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Operační programy Centrum PIGMOD Vybudováno v rozmezí 2012 – 2015 Prasečí modely nemocí Pavilon biomedicíny Pavilon experimentálních chirurgických oborů Stáje Střednice Centrum Mendelianum Vybudováno v rozmezí 2014 – 2015 Popularizační centrum pro genetiku Expozice genetiky v Moravském zemském muzeu Mendelova interaktivní škola Mendelovo vědecké centrum

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Hodnocení 2010 – 2014 Připomínky Hodnocení týmů nekoreluje s výkony jednotlivých laboratoří Pravidla hodnocení by měla být známa dopředu všem Různá úroveň připravenosti komisí Není dynamika výsledků v daném období Různá úroveň hodnocení komisí Komise nehodnotily všechny týmy Kritéria hodnocení se střetávají s kritérii OP VaVp

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Srovnání komisí v hodnocení ústavu Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Komise 6Komise 7Komise 9 Přednosti Výhodou pro ústav jsou chovy zvířecích modelů, a ryb. Výzkum financují fy US. Zřizuje se grantové oddělení ústavu. Modely miniprasat. Ústav je mezinárodně uznávaný s výbornými PIs. Unikátní sbírky, mikrobů, kolekce ryb a prasečí modely s různými aplikacemi. PIGMOD modely jsou zajímavé. Celkově je ústav na vysoké úrovni vědecké a pedagogické, hlavně v Praze a Brně. Hodně vazeb do zahraničí. Možnosti Mezinárodní spolupráce Centra PIGMOD se zahraničím. IGA pro studenty Strukturální změny v ústavu ke zvýšené vědecké aktivitě. Zvýšení impaktů. ExAM má nízkou úroveň prací ExAM generuje spolupráce v aplikovaném výzkumu. Dobrá infrastruktura. Vysoká vědecká úroveň. Slabosti Rozdělení ústavu do tří lokalit je historické dědictví. Chybí spojovací aktivity celého ústavu. Úroveň laborek je různá. Mezinárodní grantů tvořily 45% všech grantů. Rozdělení ústavu do tří lokalit komplikuje ústavní spolupráci. Diverzifikovaný výzkum snižuje konkurenceschopnost laboratoří. Vzdálenost 3 oddělení nevede k další spolupráci laboratoří. PIGMOD se zabývá vývojem modelů a ne vlastním výzkumem. Hrozby Málo grantů v roce Rizikovost financování Centra PIGMOD je snížena získáním NPU. Některé týmy mají potíže se získáváním PhD studentů. Ústav nepůsobí zaměřením týmů jednotně. Rozdílná kvalita týmů. Malé granty neumožňují vysokou specializaci. Věková struktura je suboptimální. Není mezinárodní poradní orgán. LAM nemá propojení s ústavem. Věková struktura je suboptimální Doporučení Aplikovat více na evropské granty. Více studentů ve výzkumu. Vedoucí laboratoří by se měli vybírat mezinárodně. PIGMOD by měl být podpořen AV ČR. Ústav dosáhl průkazných změn za poslední období. Měl by tak pokračovat Podporovat výzkum na myších a rybách a nepreferovat miniprasata. Zlepšit úroveň Laboratoře vývojové biologie a získávání studentů. Upřesnit výzkumný koncept a strategii na 10 let. Zvýšení institucionálního financování dlouhodobých projektů. Vybrat úzké oblasti výzkumu vynikající na mezinárodní úrovni. Vytvořit mezinárodní poradní orgán. Víc zahraničních pracovníků.

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Srovnání komisí v hodnocení ústavu Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Komise 6Komise 7Komise 9 Kvalita výsledků Kvalita výsledků byla velmi dobrá, hodně národních grantů, mezinárodních málo. Kvalita výsledků byla dobrá a zlepšovala se v celém období. Celkově dobrá kvalita výsledků, částečně velmi dobrá a v projektech spolupráce činí týmy ústavu zásadní příspěvky. Relevance výsledků Výuka na ústavu je excelentní. Popularizace na velmi vysoké úrovni. Výsledky práce ústavu jsou veřejnosti známé. Výsledky práce jsou veřejnosti známé. Významné bylo úspěšné vybudování Centra Mendelianum pro popularizaci genetiky. Účast v Natura 2000 projektu. Relevance výzkumu je ústavu je průměrná, ale v Brně velmi dobrá Studenti ve výzkumu Začlenění studentů do výzkumu je dostatečné, v některých týmech by se mohlo zvýšit. Vědci přednáší a školí, je mnoho studentů v laboratořích. Měl by se zlepšit nábor studentů. Začlenění studentů do výzkumu je odpovídající a velmi dobré v Brně. Národní kontext V národním měřítku je ústav ve svém oboru vedoucí. V národním měřítku hraje ústav ve svém oboru vedoucí roli. Hraje vedoucí roli v národním měřítku. Mezinárodní kontext Ústav je velmi dobře znám v zahraničí díky spolupracím s laboratořemi a zvířecími modely. Ústav je znám v zahraničí díky jednotlivým laboratořím a ne jako celek. Je mezinárodně viditelný. Vitalita a udržitelnost Téměř optimální personální struktura, ředitel a rada iniciovali vznik nových laboratoří a zánik neproduktivních. Dobrá personální struktura, nové laboratoře, problémem je rozdíl v úrovni jednotlivých laboratoří Vzhledem k řadě slabostí jsou vitalita a udržitelnost relativně nízké. Věková struktura je suboptimální. Strategie a záměry Ústav má dobrou strategii od 2015 do Důraz je kladen na Grantové oddělení, mezinárodní spolupráci a nová zařízeni v Brně a Praze. Vzniknou nové modely. Dobrá strategie do budoucna je založená na svých nejlepších výsledcích; je třeba vyžít možnosti centra PIGMOD ve prospěch ústavu. Strategie a plány nejsou přesvědčivé a potřebují podstatné zlepšení.

Kancelář Akademie věd 1. ČR června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Celkové výnosy v roce 2015 byly tis. Kč. Provozní dotace činila celkem tis. Kč. Z toho 44% činila institucionální podpora od AV ČR ve výši tis. Kč. Další provozní dotace byly poskytnuty v celkové výši tis. Kč. Z toho: 22% činila dotace od GA ČR tj tis. Kč, 13% projekty ostatních resortů tj tis. Kč, 21% projekty se zahraniční spoluúčastí tj tis. Kč. V rámci hlavní činnosti pak nejvýznamnější podíl měly výnosy ze smluvního výzkumu celkem tis. Kč, z čehož tis. Kč bylo od společnosti CHDI Foundation z USA, 828 tis. Kč je od společnosti UNIQURE. Celkové výnosy v roce 2014 byly tis. Kč. Provozní dotace činila celkem tis. Kč. Z toho 44% činila institucionální podpora od AV ČR ve výši tis. Kč. Další provozní dotace byly poskytnuty v celkové výši tis. Kč. Z toho: 25% činila dotace od Grantové agentury ČR tj tis. Kč, 15% projekty ostatních resortů tj tis. Kč, 16% projekty se zahraniční spoluúčastí tj tis. Kč. V rámci hlavní činnosti pak nejvýznamnější podíl měly výnosy ze smluvního výzkumu celkem tis. Kč, z čehož tis. Kč bylo od společnosti CHDI Foundation z USA, 872 tis. Kč je od společnosti NEURALSTEM. Struktura příjmů 2014 a hlavní činnost

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Struktura příjmů vedlejší činnost Výnosy ze zakázek v rámci jiné činnosti (výběrově): 247 tis. Kč Zakázky Kovářová MS 621 tis. Kč Zakázky Šlechta ryby genotypizace 173 tis. Kč Zakázky Juhás veterinární činnost 919 tis. Kč Zakázky Motlík FNUSA, GMO prasata s chlopněmi bez antigenů Výnosy ze zakázek v rámci jiné činnosti (výběrově): 46 tis. Kč Zakázky CB BIO Litvínec ustájení a ošetřování prasat 674 tis. Kč Zakázky Šlechta ryby 295 tis. Kč Zakázky Juhás veterinární činnost 209 tis. Kč Zakázky Motlík FNUSA GMO prasata s chlopněmi bez antigenů

Kancelář Akademie věd 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Návrh rozpočtu 2017 – V minulém hodnoceném období náš ústav eliminoval laboratoře, které měly hodnocení nižší než 3. Produkce zbývajících se během 5 let výrazně zkvalitnila. Současně bylo v ústavu za tu dobu v rámci projektu OP VaVpI vybudováno Centrum PIGMOD. Na základě těchto výsledků bychom chtěli požádat o zařazení následujících položek do rozpočtu ÚŽFG AV ČR, v.v.i. pro rok 2017: 1. Prioritou pro chod ústavu jsou náklady na nově vzniklé režie Centra PIGMOD ve výši 920 tis. Kč na provoz nového pavilonu Biomedicíny Centra PIGMOD (v roce 2016 jsou kryty dotací KAV). V této částce nebyly zahrnuty náklady na provoz a údržbu klimatizace, automatického krmného systému a odklízeč hnoje pro prasata ve výši 50 tis. Kč v Pavilonu experimentálních oborů. Celkem 970 tis. Kč. 2. Pokládáme za nutné ocenit týmy, které v současném hodnocení byly zařazeny ve srovnání se světovými týmy jako vedoucí nebo excelentní a proto navrhujeme pro Tým evoluční biologie roční příspěvek 300 tis. Kč a pro Tým biochemie a molekulární biologie zárodečných buněk roční příspěvek 100 tis. Kč. Celkem 400 tis. Kč. Rok Výše podpory (tis. Kč)

Kancelář Akademie věd 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika Návrh rozpočtu 2017 – Rok Výše podpory (tis. Kč) Vzhledem k rozvoji metodik hmotnostní spektrometrie, NGS a analýzy obrazu je nezbytné přijmout bioinformatika pro výše uvedené obory Celkem 380 tis. Kč. Celkem pro rok tis. Kč 4. Servisní smlouva na MS QTRA a PM Celkem od tis. Kč 5. Zbývající akce zahrnující zvýšení mezd pro provozní pracovníky a techniky, založení Mezinárodní vědecké rady ústavu, přijetí aplikačního manažera, obsazení operátora MS, a zajištění zástupu správce IT budeme řešit v rámci stávajícího rozpočtu.

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika

Kancelář Akademie věd 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika

Kancelář Akademie věd 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika

Kancelář Akademie věd ČR 1. června 2016 Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v.. Rumburská 89, Liběchov, Česká republika