Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén.

Podobné prezentace


Prezentace na téma: "Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén."— Transkript prezentace:

1 Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén

2 Eukaryota: Rostlinně- živočišná dichotomie

3 micro*scope David J. Patterson: The diversity of eukaryotes. American Naturalist 1999 AcanthareaDiphylleiaKomokiacea PseudosporaActinophryidaDiplomonadida LuffisphaeraRamicristata Alveolata Discocelis MicrosporidiaRhodophyta AncyromonasEbriida Ministeria ReticulomyxaApusomonadidaEllobiopsida MulticiliaRetortamonadidaBiomyxa Entamoebidae Nephridiophagidae„Rosette agent“ CaecitellusEuglenozoa Nucleariidae SpironemidaeCarpediemonasFonticula OpisthokontaSpongomonadidaCentroheliozoa Glaucophyta OxymonadidaStephanopogon CercomonadidaGranuloreticulosa Parabasalida SticholoncheChlorarachniophytaGymnophrea ParamyxeaStramenopilesCoelosporidium Gymnosphaerida PelobiontidaTelonema CollodictyonHaplosporida Phaeodarea ThaumatomonadidaCopromyxidaHaptophyta PhagodiniumTrimastixCryothecomonas Heterolobosea PhalansteriumVampyrellida CryptomonadidaHyperamoeba Plasmodiophorida ViridaeplantaeDesmothoracidaJakobida PolycistineaXenophyophoraDimorphida KathablepharidaPseudodendromonadida....plus mnoho rodů s nejasnou ultrastrukturní identitou! Konec milénia: 71 dobře popsaných taxonů bez zjevných sesterských skupin

4 Nová fylogenetická struktura diversity eukaryot Simpson AG and Roger AJ, Curr Biol 2004: The real 'kingdoms' of eukaryotes.

5 Superskupina Opisthokonta Nuclearia Choanoflagellata Fungi - Chytridiomycota Ichthyosporea Metazoa Fungi - Microsporidia

6 Synapomorfie opisthokont: Unikátní inzerce v EF1  Steenkamp et al., Mol Biol Evol 2006

7 Superskupina Amoebozoa Entamoeba Mastigamoebida Multicilia Phalansterium Amoeba proteus Mycetozoa Arcellinida

8 Superskupina Excavata Heterolobosea Parabasala Carpediemonas Trimastix Diplomonadida Jakobida Oxymonadida Malawimonas Euglenozoa

9 suspension-feeding groove: morfologická synapomorfie exkavát Dysnectes brevis (Yubuki et al. 2007) Carpediemonas membranifera (Simpson 2003)

10 Synapomorfie spojující diplomonády a parabasalidy: horizontální transfer prolyl-tRNA synthetasy z archebakterií Andersson et al., 2005

11 Superskupina Archaeplastida (Plantae) Embryophyta Glaucophyta Rhodophyta Zygnematales Chlorophyta

12 Superskupina Chromalveolata Kathablepharida Telonema Haptophyta Cryptophyta Oomycota Dinoflagellata Apicomplexa Ciliophora Phaeophyceae

13 Synapomorfie chromalveolát: unikátní paralog jaderně kódované v plastidu fungující glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasy

14 Superskupina Rhizaria Cercomonadida Plasmodiophorida Chlorarachniophyta Euglyphida Desmothoracida Foraminifera Acantharea Polycistinea

15 „Zbylé“ linie eukaryot Planomonas (dříve Ancyromonas) Collodictionida ApusomonadidaCentrohelida Hemimastigophora Breviata

16 Rhizaria – jen další skupina chromalveolát? ML analýza, 16 proteinů Hackett et al., 2007

17 Kořen eukaryot mezi Unikonta a Bikonta? Stechmann & Cavalier-Smith, Curr Biol 2003: The root of the eukaryote tree pinpointed

18 Myosiny třídy II: možná synapomorfie unikont...? Richards & Cavalier-Smith, Nature ale Naegleria je má taky!! Odronitz & Kollmar, 2007

19 Apusomonády asi sesterské opistokontům! Apusomonas proboscidea Amastigomonas mutabilis Bayesovská analýza, SSU+LSU+aktin+HSP90+  -tubulin +  -tubulin; Kim et al., 2006

20 Kořen eukaryot mezi archeplastidy a zbytkem? RGC - rare genomic changes (A)– RGC_CAM (B)- RGC_CA (C)- RGC_DEL (D)- RGC_INS Rogozin et al., 2009


Stáhnout ppt "Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén."

Podobné prezentace


Reklamy Google