Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Metody dostupné v laboratoři Centra pro výzkum a vývoj FN HK
Advertisements

Imobilizace a stabilizace enzymů.
Metoda QFD metoda plánování jakosti založená na principu maticového diagramu umožňuje transformaci požadavků zákazníků do navrhovaného produktu a procesu.
Projektové řízení Modul č.1.
Mikrovlnná integrovaná technika (M I T)
Měření dielektrických parametrů ztrátových materiálů
Kvantitativní RT-PCR Praha
Preimplantační genetická diagnostika
Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,
Synoviální sarkom Ravčuková B1. , Kadlecová J1. , Štěrba J 2
Real-time PCR - princip
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Mikrovlnná integrovaná technika (M I T)
Laboratoř potravinářské mikrobiologie (Rokoska)
Informační strategie. řešíte otázku kde získat konkurenční výhodu hledáte jistotu při realizaci projektů ICT Nejste si jisti ekonomickou efektivností.
Vybrané metody analýzy
Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,
Picoliter Ondřej Hlaváč. 2 Seznámení s projektem Společnost Picoliter vyvinula novou mikrofluidní technologii bezkontaktního přenosu pikolitrových.
OLED technologie Úvod OLED = Organic Light Emitting Diode
Polymorfizmy detekované speciálními metodami s vysokou rozlišovací schopností Stanovení jednonukleotidových polymorfizmů (Single Nucleotide Polymorphisms.
ONEMOCNĚNÍ Z HLEDISKA GENETIKY
Marketing Návrh výrobku Vývoj, konstrukce Příprava výroby Zásobování Výroba Montáž, kompletace Prodej Poprodejní služby měření, zkoušky, testy konkurenčních.
Preimplantační genetická diagnostika Oddělení lékařské genetiky FN Brno Gynekologicko - porodnická klinika Masarykovy univerzity v Brně.
J. Weiser Laboratoř mikrobiální proteomiky Proteomika jako nástroj ke studiu fyziologických regulací u bakterií.
Molekulární biologie v oboru šlechtitelské praxe vojtech pivnicka.
STRATEGIE MOLEKULÁRNÍ GENETIKY
Transkriptom.
(genové mutace, otcovství, příbuznost orgánů při transplantacích) RNA
RxFISH.
DNA Hybridizační techniky
F.I.S.H. hotovo.
DNA diagnostika syndromu
Microarrays and chips M .Jurajda.
XIX.den profesora Vladimíra Staška Onkologie 21. století
031122GKANALYTICS ANALYTIKA zdroj informací KACÍŘSTVÍ či PARADIGMA ? Jiří ŠEVČÍK.
MLPA MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION
Vývoj mikrosatelitních markerů (SSR) KBO/125 Jiří Košnar, katedra botaniky PřF JU, 2012 Kurz byl financován z projektu FRVŠ 1904/2012.
DNA diagnostika.
Microarray Martin Erdös.
PCR Polymerase Chain Reaction
DNA diagnostika II..
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“
Základní typy genetických chorob Marie Černá
Expresní DNA microarray
Lanové převody Vysoká škola technická a ekonomická v Českých Budějovicích Institute of Technology And Business In České Budějovice.
Patologie propojující lékařské obory Jaroslava Dušková
Technologické aspekty čipových technologií Boris Tichý LÉKAŘSKÁ FAKULTA MASARYKOVY UNIVERSITY Interní hematoonkologická klinika LF MU a FN Brno.
Praktikum z genetiky rostlin JS Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana Genetické mapování genu odolnosti k padlí.
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
Párováni bazí, hybridizace a denaturace DNA/RNA hraje důležitou roli v přírodě i aplikacích: - struktura DNA a duplikace genetické informace - transkripce.
Mikročipy ..
Molekulární biotechnologie č.10a Využití poznatků molekulární biotechnologie. Molekulární diagnostika.
Ligázová řetězová reakce
Zlepšení podmínek pro vzdělávání na středních školách Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost Název a adresa školy: Integrovaná střední.
Suchá chemie Miroslava Beňovská (vychází z přednášky doc. Šterna)
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
QF-PCR v prenatální diagnostice častých aneuploidií - naše pětileté zkušenosti . M. Putzová & GENNET.
C7188 Úvod do molekulární medicíny 3/12
Pátráme po mikrobech Díl IX. Průkaz nukleové kyseliny
Moderní metody analýzy genomu Čipové technologie I
Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,
DELFIA Dissociation-Enhanced Lanthanide Fluorescent ImmunoAssay
Polymerase chain reaction Polymerázová řetězová rekce
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
Proteinové, buněčné a tkáňové čipy
Dopady kouření v ČR: epidemiologický pohled
Dominika verešová Kateřina Sapáková
C7188 Úvod do molekulární medicíny 4/12
18b-Metody studia nukleových kyselin
Transkript prezentace:

Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller Technologie DNA mikročipů aplikace v oblasti klinické genetiky Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller

„globální experiment“ Princip Hybridizace značených nukleových kyselin se sondami imobilizovanými v pravidelném uspořádání na pevné matrici. Metoda umožňuje paralelní sledování jednotlivých hybridizačních reakcí komplexního vzorku. „globální experiment“

Dvojí technologie cDNA mikročipy oligonukleotidové mikročipy

cDNA mikročipy Skleněná nebo nylonová matrice Sondy tvořeny produkty PCR Nanesení sond robotem (dispensing) Poly-L-lysinové linkery

Oligonukleotidové mikročipy Matrice výhradně skleněná Sondy syntetizovány „in silico“ Nanesení sond fotolitograficky Linkery-fotosenzitivní, vázané na Si-OH

Oligonukleotidové mikročipy Výhody: - vysoká hustota spotů - malé množství vzorku - dobrá reprodukovatelnos Nevýhody: - vysoké pořizovací náklady - nízká flexibilita ve fázi návrhu

cDNA mikročipy Výhody: - dostupnost vlastního návrhu Nevýhody: - nižší výrobní náklady Nevýhody: - velké množství nanášeného vzorku - menší počet spotů - snížená reprodukovatelnost

Podstata techniky DNA mikročipů

Aplikace oligonukleotidových mikročipů Analýza expresního profilu Screening polymorfismu Specifické analýzy Analýza genotypu (Drosophila, Arabidopsis) …

Analýza expresního profilu DNA čip – „fotografie transkriptomu v daném okamžiku“ původ tkáně stádium ontogenetického vývoje pohlaví fáze biorytmu patofyziologický stav

Skrýnynk polymorfismu Možnost sledování SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) Ztráta heterozygotnosti LOH (loss of heterozigosity)

Sledování specifických mutací např. p53

Aplikace cDNA čipů Klasifikace a stanovení prognózy onkologických onemocnění nádory plic tlustého střeva prostaty sarkomy melanomy lymfomy