MLPA MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION Kolektiv Laboratoře molekulární biologie Onkologické centrum J. G. Mendela Nový Jičín
SCHÉMA KONSTRUKCE PÁRŮ SOND komplementární sekvence k univerzálnímu primeru Y Stuffer sekvence specifická hybridizační sekvence komplementární sekvence k univerzálnímu primeru X
použití univerzálních primerů inaktivace ligázy při 98°C SCHÉMA PRINCIPU MLPA DENATURACE (98°C) HYBRIDIZACE (98°C) LIGACE (54°C) PCR SEPARACE ds DNA ss DNA F R Ligáza-65 použití univerzálních primerů inaktivace ligázy při 98°C fragmentová analýza
DETEKCE DELECÍ A) NORMÁLNÍ HOMOZYGOT B) DELETOVANÝ HOMOZYGOT A B C 1 2 3 4 1 3 4 1 2 3 4 1 3 4 4 A B C 3 2 1 2 2 C) HETEROZYGOT 1 2 3 4 1 3 4 2
EcoRV XbaI SphI BsmI (vector: blue plaques) (clone: white plaques) “Stuffer” sequence PCR primer sequence (vector: blue plaques) (clone: white plaques) Hybridizing sequence