Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE

ZveřejnilZdeněk Doležal

Podobné prezentace

Prezentace na téma: "URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE"— Transkript prezentace:

1 URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE
Úloha č. 5 URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE

2 SEKVENACE DNA sekvenační techniky: 1977 Maxam-Gilbertova metoda
1980 Sangerova metoda automatizovaná varianta metody nové generace pyrosekvenování, SOLID, SOLEXA

3 SANGEROVA METODA DNA polymerasa 2‘-deoxynukleosidtrifosfáty (dNTP)
primer 2‘,3‘-dideoxynukleosidtrifosfáty (ddNTP)

4 SANGEROVA METODA využití ddNTP

5 SANGEROVA METODA průběh a detekce

6 AUTOMATIZOVANÁ VARIANTA
varianta enzymatického sekvenování DNA amplifikace DNA na termocykléru (PCR) a elektroforetická separace fragmentů na sekvenátoru syntéza DNA probíhá v jedné reakci značení a detekce: ddNTP čtyři různé fluorescenční značky produkty se liší o 1 bázi

7 Genetický analyzátor ABI 3130

8 DETEKCE PRODUKTŮ

9 POSTUP přečištění ExoSAP sekvenační reakce
přečištění magnetickými kuličkami sekvenace vyhodnocení výsledků a určení druhu borrelie

Stáhnout ppt "URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE"

Podobné prezentace

Studium lidského genomu

Studium lidského genomu
Poznámky identifikaci SNP

Poznámky identifikaci SNP
Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,

Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,
Detekce proteinů na preparátech Histochemie. Metody detekce – vazba cílového proteinu Imunologické; primární protilátky sekundární protilátky Imunologické;

Detekce proteinů na preparátech Histochemie. Metody detekce – vazba cílového proteinu Imunologické; primární protilátky sekundární protilátky Imunologické;
Nově syntetizovaný řetězec DNA

Nově syntetizovaný řetězec DNA
Replikace DNA Milada Roštejnská Helena Klímová

Replikace DNA Milada Roštejnská Helena Klímová
Real-time PCR - princip

Real-time PCR - princip
Fingerprinting techniky

Fingerprinting techniky
PCR - polymerase chain reaction -polymerázová řetězová reakce

PCR - polymerase chain reaction -polymerázová řetězová reakce
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE

Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,

Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,
Polymorfizmy detekované speciálními metodami s vysokou rozlišovací schopností Stanovení jednonukleotidových polymorfizmů (Single Nucleotide Polymorphisms.

Polymorfizmy detekované speciálními metodami s vysokou rozlišovací schopností Stanovení jednonukleotidových polymorfizmů (Single Nucleotide Polymorphisms.
Molekulární genetika.

Molekulární genetika.
Sekvencování Sangerova metoda - dideoxyterminátory O PPP H OH H OH H H 5´ 3´ NTP N N N N NH 2 O PPP H H H OH H H 5´ 3´ dNTP N N N N NH 2 O PPP H H H H.

Sekvencování Sangerova metoda - dideoxyterminátory O PPP H OH H OH H H 5´ 3´ NTP N N N N NH 2 O PPP H H H OH H H 5´ 3´ dNTP N N N N NH 2 O PPP H H H H.
SMAMII-6b Amplifikační metody.

SMAMII-6b Amplifikační metody.
RNA diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A. , Kadlecová J

RNA diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A. , Kadlecová J
Sekvenování.

Sekvenování.
F.I.S.H. hotovo.

F.I.S.H. hotovo.
DNA diagnostika syndromu

DNA diagnostika syndromu
Milada Teplá, Helena Klímová

Milada Teplá, Helena Klímová

Podobné prezentace

Reklamy Google