Restrikční mapování.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Studium lidského genomu
Advertisements

Metabolismus lipidů  - oxidace.
Manipulace a úpravy nukleových kyselin
Orbis pictus 21. století Tato prezentace byla vytvořena v rámci projektu.
PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 G1.
Taxonomie x1, y1, z1 = plesiomofie
Metody molekulární biologie
Nově syntetizovaný řetězec DNA
Fingerprinting techniky
Metody identifikace DNA –RFLP, PCR a RAPD
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Metody identifikace DNA RFLP, PCR a RAPD
Stanovení genetické vzdálenosti
PCR. Polymerase chain reaction PCR Je technika, která umožňuje v krátkém času namnožit daný kus DNA bez pomoci buněk užívá se, pokud je DNA velmi malé.
Projekt HUGO – milníky - I
Využití vzorců a funkcí k úpravám v textu
Základy molekulární taxonomie J.Flegr, Praha 2008.
Praktické cvičení č. 3 ZÁKLADY GENOVÉHO INŽENÝRSTVÍ Klonování PCR produktu do vektoru PCR®2.1-TOPO® a transformace do E. coli AMOLc Úvod do molekulární.
SMAMII-6b Amplifikační metody.
STRATEGIE MOLEKULÁRNÍ GENETIKY
Metody molekulární diagnostiky
Transkriptom.
Použití molekulárních znaků v systematice
(genové mutace, otcovství, příbuznost orgánů při transplantacích) RNA
Kompresní metoda ACB Associative Coder of Buyanovsky autor: George Buyanovsky připravil Tomáš Skopal podle knihy „Data Compression“ od D. Salomona, 1997,
Molekulární biotechnologie
Sekvenování.
F.I.S.H. hotovo.
1.3. Obecné problémy fyzikální teorie jaderných reaktorů
Molekulární biotechnologie č.6b Zvýšení produkce rekombinatního proteinu.
Marie Černá, Markéta Čimburová, Marianna Romžová
Polymorfismus lidské DNA.
Metoda SDA strand displacement amplification
Analýza a separace nukleových kyselin
Vývoj mikrosatelitních markerů (SSR) KBO/125 Jiří Košnar, katedra botaniky PřF JU, 2012 Kurz byl financován z projektu FRVŠ 1904/2012.
Analýza mutace C282Y v genu pro hemochromatózu
DNA diagnostika.
Náplň praktik Izolace vlastní DNA PCR - namnožení genů CFTR a HFE
PCR Polymerase Chain Reaction
DNA diagnostika II..
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“
Expresní DNA microarray
Získání klonovaných genů
Molekulární biotechnologie Č.3. Izolace cílového fragmentu DNA (genu) Který představuje malou část genomu (0.02% u E.coli) Umožňují genové či genomové.
Ildikó Németh, Marek Motola, Tomáš Merta
Vyšetřovací metody v molekulární biologii
Praktikum z genetiky rostlin JS Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana Genetické mapování genu odolnosti k padlí.
Vítězslav Kříž, Biologický ústav LF MU
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
DNA diagnostika a principy základních metod molekulární biologie
Molekulární biotechnologie č.10a Využití poznatků molekulární biotechnologie. Molekulární diagnostika.
SMAMII-8 Detekce polymorfismů v genomech. Metody molekulární diagnostiky Se zaměřují na vyhledávání rozdílů v sekvencích DNA a Identifikaci polymorfismů.
Teorie portfolia Markowitzův model.
SEKVENOVÁNÍ DNA. Jedna z metod studia genů Využití v aplikovaných oblastech molekulární biologie – např. medicíně při diagnostice genetických chorob.
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
Manipulace s DNA Manipulace s proteiny Analýza genové exprese
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu
Molekulární biotechnologie
PŘEHLED AMINOKYSELIN Cys Gly Lys Trp Met Ala Arg Phe Asp Val His Glu
Enzymy používané v molekulární biologii
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin
Sekvencování DNA.
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
Molekulární biotechnologie
Studium lidského genomu
1. Regulace genové exprese:
URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE
Imunofluorescence Nepřímá Přímá slouží k průkazu protilátek (Ab)
A324 A324.
Transkript prezentace:

Restrikční mapování

Účel restrikčního mapování zjistit rozložení restrikčních míst ve fragmentu DNA za pomoci restrikčních endonukleáz BglII EcoRI BglII EcoRI BamHI HindIII BamHI EcoRI BamHI EcoRI EcoRI HindIII BamHI EcoRI EcoRI

Dva základní přístupy štěpení dvojicemi restriktáz parciální štěpení jednotlivými enzymy

Štěpení dvojicemi enzymů 1 koncové značení rozštěpení a izolace jednoho z řetězců štěpení EcoRI štěpení BamHI

Štěpení dvojicemi enzymů 2 + + + _ _ _

Štěpení dvojicemi enzymů 3 A G C H E J D F B I štěpení BamHI štěpení EcoRI 1 1 2 A G 2 3 3 4 C H 4 5 5 6 E J 6 7 8 7 F D 9 8 9 B I

Štěpení dvojicemi enzymů 4 + + + _ _ _

Štěpení dvojicemi enzymů 5 1 …..A,G 2 …..G,C A C E D B 3 …..C,H 1 2 3 4 5 6 7 8 9 4 …..H,E 5 …..E,J 6 …..J,D G H J F I 7 …..D,F 8 …..D,I 9 …..I,B

Mapování pomocí parciální digesce 1 koncové značení rozštěpení a izolace jednoho z řetězců parciální digesce elektroforéza a autoradiografie

Mapování pomocí parciální digesce 2 + + + _ _ _ elektroforetogram autoradiogram

Využití metody „sekvenování chudých“ kvalitní znaková data v případě vhodně dlouhých fragmentů velmi efektivní metoda umožňuje odhadnout polaritu evolučních změn pro velký počet vzorků ideální v kombinaci se sekvenováním