DNA Hybridizační techniky

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Eutektikum a eutektický bod
Advertisements

Interaktivní tabule Je to velká interaktivní plocha, ke které je připojen počítač a data-video projektor. Kombinuje výhody běžné popisovatelné tabule a.
Hard Disk Drive & jeho alternativy
Single Nucleotide Polymorphism
NÁZEV DIPLOMOVÉ NEBO BAKAlÁŘSKÉ PRÁCE
Změny skupenství Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Petr Jeřábek. Materiál zpracován v rámci projektu Implementace ICT techniky.
Hodnocení práce Hodnocení práce je nástrojem zajišťujícím, aby požadavky, náročnost, složitost a podmínky práce se odrazily v diferenciaci odměny pracovníka.
Taxonomie x1, y1, z1 = plesiomofie
Kvalitativní výzkum.
Konduktometrie.
TERMOREGULACE NOVOROZENCE
Real-time PCR - princip
Fingerprinting techniky
Sterilizace je proces, který zabezpečuje usmrcení všech životaschopných mikroorganismů včetně spór.
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Měření emisí POPs - možnosti a praxe Vladimír Škorpík CS PROEKOS s.r.o.
Ústav technických zařízení budov MĚŘENÍ A REGULACE Ing. Václav Rada, CSc. ZS – 2003/
FMVD I - cvičení č.2 Měření vlhkosti dřeva a vlivu na hustotu.
Stanovení genetické vzdálenosti
PCR. Polymerase chain reaction PCR Je technika, která umožňuje v krátkém času namnožit daný kus DNA bez pomoci buněk užívá se, pokud je DNA velmi malé.
Metodika měření svislých posunů staveb
Bitmapová a Vektorová grafika
Vliv teploty na ztráty PHL – způsoby vyjádření Petr Molák, Shell Czech Republic
Schéma rovnovážného modelu Environmental Compartments
Bariérová ošetřovatelská péče
Účel procedury: První a závazný krok jakékoli seriozní komparativní studie. Umožňuje vyloučit možnost, že distribuce studovaného znaku (vlastnosti, vzorce.
STRATEGIE MOLEKULÁRNÍ GENETIKY
Použití molekulárních znaků v systematice
SOFTWARE, USPOŘÁDÁNÍ DAT V POČÍTAČI I. Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Světlana Filipová Materiál zpracován v rámci projektu.
okolí systém izolovaný Podle komunikace s okolím: 1.
Tato prezentace byla vytvořena
Jednotrubkový rozvod Střední odborná škola Otrokovice
První prenatální diagnostika u choroby Charcot-Marie-Tooth typ 1A v ČR. P. Seeman 1, M. Čtvrtečková 1, A. Lipková 2 1-Klinika dětské neurologie 2. LF UK.
Sekvenování.
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy.
 Zkoumáním fyzikálních objektů (např. polí, těles) zjišťujeme že:  zkoumané objekty mají dané vlastnosti,  nacházejí se v určitých stavech,  na nich.
Tuhnutí, sublimace a desublimace
Marie Černá, Markéta Čimburová, Marianna Romžová
„DRAWING“ EXPERIMENTÁLNÍ METODA TVORBY OJEDNOCENÝCH NANOVLÁKEN Ing
Tomáš Markovič, Jan Hirschner. Oči fyzika  “ Vidí to, co je lidským očím odepřeno “ Teplota, osvětlení, zvuková intenzita Vzdálenost, rychlost Zrychlení.
Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller
Vyšetření komplementového systému
DNA diagnostika II..
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“
HODNOCENÍ ANALYTICKÝCH DAT JAN TŘÍSKA CENTRUM VÝZKUMU GLOBÁLNÍ ZMĚNY AV ČR ČESKÉ BUDĚJOVICE.
Princip laseru Zdrojem energie (např. výbojka) je do aktivního média dodávána energie. Ta energeticky vybudí elektrony aktivního prostředí ze zákl. energetické.
Hybridizace nukleových kyselin
Sacharidová složka nukleotidů
9. KRAJSKÉ SETKÁNÍ METODIKŮ R O B O T I K A DUBEN 2015 PODPORA PŘÍRODOVĚDNÉHO A TECHNICKÉHO VZDĚLÁVÁNÍ NA STŘEDNÍCH ŠKOLÁCH V JIHOMORAVSKÉM KRAJI CZ.1.07/1.1.00/
Komplexní sloučeniny v roztoku
Metody měření rychlosti
Molekulární biotechnologie č.10a Využití poznatků molekulární biotechnologie. Molekulární diagnostika.
SMAMII-8 Detekce polymorfismů v genomech. Metody molekulární diagnostiky Se zaměřují na vyhledávání rozdílů v sekvencích DNA a Identifikaci polymorfismů.
SNPs Single Nucleotide Polymorphism Polymorfimus DNA, kdy se jedinci nebo druhy liší v jedné nukleotidové záměně AAGCCTA AAGCTTA V tomto případě mluvíme.
VIRTUÁLNÍ KOLONOSKOPIE Indikace: Vyšetření je určeno k detekci polypů a karcinomů v případě, že je optická kolonoskopie neúplná netolerovaná kontraindikovaná.
Odsolování vody Dostatek čisté vody je nezbytnou podmínkou rozvoje civilizace.
Anotace: Prezentace slouží k přehledu tématu vlastnosti vod Je určena pro výuku ekologie a monitorování životního prostředí v 1. a 2. ročníku střední.
Fyzika na scéně - exploratorium pro žáky základních a středních škol reg. č.: CZ.1.07/1.1.04/ Gymnázium, Olomouc, Čajkovského 9 Název úlohy: 1.1.
Rastrová grafika Základní termíny – Formáty rastrové grafiky.
FYZIKÁLNÍ PODSTATA ELEKTRICKÉ VODIVOSTI
Základní pojmy.
ADSORPCE na fázovém rozhraní pevná fáze-plyn.
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
Číslo projektu CZ.1.07/1.4.00/ Název sady materiálů Chemie 8. roč.
Parní tepelná soustava
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
ADSORPCE na fázovém rozhraní pevná fáze-plyn.
18b-Metody studia nukleových kyselin
Jak získáváme znaky pomocí sekvenace unikátních lokusů
Transkript prezentace:

DNA Hybridizační techniky

Obsah Princip metody Rozdělení metod Technika měření reasociační kinetiky Využití metody Výhody a úskalí

Princip metody DNA lze snadno denaturavat na jednotlivé komplementární řetězce Za vhodných podmínek komplementární řetězce reasociují na dvouřetězec Míra v jaké a rychlost s jakou dva jednořetězce reasociují závisí na stupni jejich podobnosti

Základní uspořádání Reasociace s DNA na pevném nosiči Dot blot Slot blot Southern blot Reasociace ve vodném roztoku

Měření reasociace v roztoku Izolovat (purifikovat) DNA Nalámat na vhodnou délku (500 pb) Změřit přesně její koncentraci Denaturovat teplem Smísit DNA dvou porovnávaných druhů Postupně ochladit Změřit procento renaturované DNA Vypočíst podobnost sekvencí Vypočíst počty mutací od okamžiku odvětvení

Kvantifikace reasociace Stanovit střední teplotu tání homoduplexů Tm= (TmA + TmB)/2 Stanovit teplotu tání heteroduplexu Vypočítat pokles ΔTm ∆Tm=((TmA + TmB)/2) - Tms Vypočítat p p = ΔTm . 0,01 (0,015) K = -3/4 ln(1 - 4/3 p)

Technické triky Tracer a driver Odstranění repetitivních sekvencí Způsoby monitorování míry reasociace Extinkce jednořetězcové a dvouřetězcové DNA Chromatografické oddělení na hydroxyapatitu Rozštěpení ssDNA pomocí S1 nukleázy

A B fragmentace denaturace radioaktivní značení renaturace S1 štěpení detekce

Výhody metody Multilokusová (totilokusová) metoda Použitelná na nejvzdálenější taxony

Nevýhody metody Distanční metoda Experimentálně dosti náročná Práce s izotopem Vyžaduje speciální vybavení Vyžaduje větší množství DNA (mg) Náchylná k artefaktům (repetitivní DNA) Experimentální náročnost N x N

Závěry Na velmi vzdálené taxony výhodné Měla by provádět specializovaná laboratoř Většinou lze nahradit jinými metodami (MLST) V budoucnu možná taxonomické DNA čipy