Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu Benjamín Skála vedoucí práce: Václav Hypša
Endosymbionti hmyzu bakterie žijící v tělních buňkách primární X sekundární Moran, 2006
P-endosymbionti mutualistický vztah s hostitelem vertikální přenos redukce genomu koevoluce s hostitelem Buchnera, Wigglesworthia, Blochmannia
Molekulární fylogenetika metodologické problémy: vysoký obsah AT potenciální horizontální přenos genů příbuzenské vztahy jsou zatím nejasné
groEL Herbeck et al., 2005
Otázky Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
Otázky Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
Flegr, 2005
Otázky Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete. Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím horizontálního přenosu genů (HGT) u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
Otázky Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete. Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%) Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.
Otázky Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete. Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%) Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete. Jaké symbiotické „houbovité organismy“ byly nalezeny u mšic?
Některé mšice tribu Cerataphidini obsahují tzv. YLS – yeast-like symbiont vřeckovýtrusné houby (Ascomycota), Sordariomycetes Hypomyces lactifluorum Xet-Mull, 2004