POPULAČNÍ GENETIKA 3 Pravděpodobnost v genetice populací

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
AUTOR: Ing. Helena Zapletalová
Advertisements

Irena Svobodová Gymnázium Na Zatlance
ZÁKLADY PRAVDĚPODOBNOSTI
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Číslo DUM:
Statistické metody pro testování asociace genů a nemocí
GENETIKA MNOHOBUNĚČNÝCH ORGANISMŮ
Genetika Biologická věda zabývající se zkoumáním zákonitostí dědičnosti a proměnlivosti organismů.
Vzorce na umocnění.
GENETIKA POPULACÍ KVANTITATIVNÍCH ZNAKŮ 8
4 Pravděpodobnost a genetické prognózování
GENETIKA POPULACÍ 9 KVANTITATIVNÍCH ZNAKŮ
statistické parametry STR typingu
4IZ 229 – Cvičení 3 Práce s neurčitostí Vladimír Laš.
POPULAČNÍ GENETIKA 6 faktory narušující rovnováhu populací
Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Morganovo číslo, Morganovy zákony, příklady
Hardy – Weibergův zákon
Markery asistovaná selekce
25. října 2004Statistika (D360P03Z) 4. předn.1 Statistika (D360P03Z) akademický rok 2004/2005 doc. RNDr. Karel Zvára, CSc. KPMS MFF UK
Stránky o genetice Testy z genetiky
Genetika populací, rodokmen
Teoretické základy šlechtění lesních dřevin Milan Lstibůrek 2005.
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Číslo DUM:
Opakování 1. K čemu slouží DNA? 2. Kde jsou umístěny chromozomy?
Využití v systematické biologii
Pravděpodobnost a genetická prognóza
Základy genetiky Role nukleových kyselin DNA – A,T,C,G báze
Diskrétní rozdělení Karel Zvára 1.
Populační genetika je teoretickým základem šlechtění hospodářských zvířat; umožňuje sledování frekvencí genů a genotypů a tím i cílevědomé řízení změn.
Dědičnost monogenní znaků
Teratogeneze a teratologie Určeno pro bakalářské a magisterské studijní obory Zdravotně sociální, Pedagogické a Zemědělské fakulty prof. Ing. Václav Řehout,
POČET PRAVDĚPODOBNOSTI
Autor: Mgr. Tomáš Hasík Určení: Septima, III.G
Genetická variabilita populací  Pacient je obrazem rodiny a následně populace, ke které patří  Distribuci genů v populaci, a to jak jsou četnosti genů.
Populační genetika.
Genové interakce.
Heritabilita multifaktoriálních chorob, Dědičnost vázaná na pohlaví
Genetika populací kvalitativních znaků
ZÁKLADY TEORIE PRAVDĚPODOBNOSTI
PREVENCE genetických patologických stavů (GPS). Prognózování GPS a genetické poradenství Principem genetického prognózování je předpovědění vzniku určitého.
Základy zpracování geologických dat
Příbuzenská, liniová a čistokrevná plemenitba
Autor: Mgr. Tomáš Hasík Určení: Septima, III.G
Výpočty rizik monogenních chorob
Příklady z populační genetiky
Mendelistická genetika
Vazba genů seminář č. 405 Dědičnost
Principy dědičnosti, Mendelovy zákony Marie Černá
Příklady z mendelovské genetiky
Molekulová fyzika 3. přednáška „Statistický přístup jako jediná funkční strategie kinetické teorie“
Populační genetika Fenotypy, genotypy RNDr Z.Polívková
Autozomální dědičnost
Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – řešené příklady Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/14 Šablona: III/2 Inovace.
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Genetika populací Doc. Ing. Karel Mach, Csc.. Genetika populací Populace = každá větší skupina organismů (rostlin, zvířat,…) stejného původu (rozšířená.
NÁZEV ŠKOLY: GYMNÁZIUM JOSEFA JUNGMANNA, LITOMĚŘICE, Svojsíkova 1, příspěvková organizace ČÍSLO PROJEKTU: CZ.1.07/1.5.00/ NÁZEV MATERIÁLU: VY_32_INOVACE_1C_20_Zaklady.
Vazba genů I Autor: Mgr. Jitka MaškováDatum: Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308.
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Narušení genetické rovnováhy
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
3. Mendelovy zákony.
Hardyův – Weinbergův zákon genetické rovnováhy v populacích
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
Genetika.
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
Transkript prezentace:

POPULAČNÍ GENETIKA 3 Pravděpodobnost v genetice populací (magisterské studijní obory JU) Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.

Pravděpodobnost v genetice populací Jevy jisté: pravděpodobnost 100% Jevy nemožné: pravděpodobnost 0% Genetické jevy: pravděpodobnost 0-100%

Pravděpodobnost v genetice populací Cíl genetického prognózování: zpravidla stanovit pravděpodobnost výskytu určitého defektu, anomálie, abnormality a jiné geneticky podmíněné vady Východisko gen. prognózování: populačně genetické a statistické studie informace o frekvencích genů, četnostech výskytu jednotlivých genotypů, znaků, vlastností apod.

Pravděpodobnost v gen. populaci n příznivých jevů n možných jevů P = 1 = jistota v gen. výjimečně P = 0 = nemožnost

Pravděpodobnost v gen. populaci Základní pravidla (věty): nezávislé jevy (nevylučují se): P(AB) = P(A) . P(B) disjunkční jevy (vylučují se): P(AUB) = P(A) + P(B)

Aplikace pravděpodobnosti do genetiky n příznivých jevů n možných jevů

Aplikace pravděpodobnosti do genetiky Model 1 alelického páru: 1 2 1 2 P (A) = P (a) = p q P(Aa) = P(A) . P(a) P(aA) = P(A) . P(a) pq = p . q qp = p . q P(AaUaA) = P(Aa) + P(aA) = pq + qp = 2pq ♂ ♀ ♀ ♂

Aplikace pravděpodobnosti do genetiky Model 1 alelického páru: P(AA) = P(A) . P(A) = p . p = p2 P(aa) = P(a) . P(a) = q . q = q2 ♂   A p a q p2 pq qp q2 ♀ p2 + 2pq + q2= 1

Aplikace pravděpodobnosti do genetiky P(AAUAaUaa) = P(AA) + P(Aa) + P(aA) + P(aa) 1 = p2 + pq + qp + q2 1 = p2 + 2pq + q2 (p + q)2 = p2 + 2pq + q2 = 1

Typy křížení – příklad výpočtu ♀ ♂ P (AA) . P (AA) = P(AA x AA) p2 . p2 = p4 odvozená výsledná pravděpodobnost pravděpodobnost

Typy křížení a jejich pravděpodobnosti Pravděpodobnost genotypů potomstva křížení Odvozená Výsledná AA Aa aa AA . AA p2 . p2 p4  p4   4 AA . Aa p2 . 2pq 4p3q 2p3q Aa . AA 2pq . p2 1 : 1 aa . AA q2 . p2 2p2q2 AA . aa p2 . q2 Aa . Aa 2pq . 2pq 4p2q2 p2q2  1 : 2 : 1 Aa . aa 2pq . q2 4pq3 2pq3 aa . Aa q2 . 2pq aa . aa q2 . q2 q4

Pravděpodobnost výskytu jedin. genotypů u dihybida např.: A = pA = 0,4 B = pB = 0,7 AABB = 0,16 . 0,49 = 0,0784 AABb = 0,16 . 0,42 = 0,0672 Aabb = 0,48 . 0,09 = 0,0432 AaBB = 0,48 . 0,49 = 0,2352 AaBb = Aabb = aaBB = aaBb = aabb = Σ = 1 P(AABB) = P(AA) . P (BB) = p2A . p2B