POPULAČNÍ GENETIKA 3 Pravděpodobnost v genetice populací (magisterské studijní obory JU) Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Pravděpodobnost v genetice populací Jevy jisté: pravděpodobnost 100% Jevy nemožné: pravděpodobnost 0% Genetické jevy: pravděpodobnost 0-100%
Pravděpodobnost v genetice populací Cíl genetického prognózování: zpravidla stanovit pravděpodobnost výskytu určitého defektu, anomálie, abnormality a jiné geneticky podmíněné vady Východisko gen. prognózování: populačně genetické a statistické studie informace o frekvencích genů, četnostech výskytu jednotlivých genotypů, znaků, vlastností apod.
Pravděpodobnost v gen. populaci n příznivých jevů n možných jevů P = 1 = jistota v gen. výjimečně P = 0 = nemožnost
Pravděpodobnost v gen. populaci Základní pravidla (věty): nezávislé jevy (nevylučují se): P(AB) = P(A) . P(B) disjunkční jevy (vylučují se): P(AUB) = P(A) + P(B)
Aplikace pravděpodobnosti do genetiky n příznivých jevů n možných jevů
Aplikace pravděpodobnosti do genetiky Model 1 alelického páru: 1 2 1 2 P (A) = P (a) = p q P(Aa) = P(A) . P(a) P(aA) = P(A) . P(a) pq = p . q qp = p . q P(AaUaA) = P(Aa) + P(aA) = pq + qp = 2pq ♂ ♀ ♀ ♂
Aplikace pravděpodobnosti do genetiky Model 1 alelického páru: P(AA) = P(A) . P(A) = p . p = p2 P(aa) = P(a) . P(a) = q . q = q2 ♂ A p a q p2 pq qp q2 ♀ p2 + 2pq + q2= 1
Aplikace pravděpodobnosti do genetiky P(AAUAaUaa) = P(AA) + P(Aa) + P(aA) + P(aa) 1 = p2 + pq + qp + q2 1 = p2 + 2pq + q2 (p + q)2 = p2 + 2pq + q2 = 1
Typy křížení – příklad výpočtu ♀ ♂ P (AA) . P (AA) = P(AA x AA) p2 . p2 = p4 odvozená výsledná pravděpodobnost pravděpodobnost
Typy křížení a jejich pravděpodobnosti Pravděpodobnost genotypů potomstva křížení Odvozená Výsledná AA Aa aa AA . AA p2 . p2 p4 p4 4 AA . Aa p2 . 2pq 4p3q 2p3q Aa . AA 2pq . p2 1 : 1 aa . AA q2 . p2 2p2q2 AA . aa p2 . q2 Aa . Aa 2pq . 2pq 4p2q2 p2q2 1 : 2 : 1 Aa . aa 2pq . q2 4pq3 2pq3 aa . Aa q2 . 2pq aa . aa q2 . q2 q4
Pravděpodobnost výskytu jedin. genotypů u dihybida např.: A = pA = 0,4 B = pB = 0,7 AABB = 0,16 . 0,49 = 0,0784 AABb = 0,16 . 0,42 = 0,0672 Aabb = 0,48 . 0,09 = 0,0432 AaBB = 0,48 . 0,49 = 0,2352 AaBb = Aabb = aaBB = aaBb = aabb = Σ = 1 P(AABB) = P(AA) . P (BB) = p2A . p2B