Real-time PCR v diagnostice MRD a vývoji metastáz u neuroblastomu

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Kmenové buňky z pupečníkové krve současnost a budoucnost
Advertisements

Borrélie – úskalí laboratorní diagnostiky
Nádory pankreatu a žlučových cest: NEUROENDOKRINNÍ NÁDORY PANKREATU
* onkofetální (AFP, CEA ..) * onkoplacentární (hCG, isoenzymy ALP) KLASIFIKACE TUMOROVÝCH MARKERU A. Nádorem tvořené -Antigeny * onkofetální (AFP,
MEZIBUNĚČNÁ KOMUNIKACE
Heterogenita nádorové buněčné populace v diagnostice a léčení
(MNOHOČETNÝ) MYELOM.
Selhání imunitní tolerance: alergie a autoimunita
Novinky v onkologii ASCO 2009
Kvantitativní RT-PCR Praha
* onkofetální (AFP, CEA ..) * onkoplacentární (hCG, isoenzymy ALP) KLASIFIKACE TUMOROVÝCH MARKERU A. Nádorem tvořené -Antigeny * onkofetální (AFP,
Molekulární biologie nádorů
Preimplantační genetická diagnostika
ONKOMARKERY mají význam v ambulantní praxi ?
Protein S100B a maligní melanom
OBECNÁ ONKOLOGIE I. MUDr.Markéta Nová.
Modernizace a obnova přístrojového vybavení komplexního onkologického centra FN Brno Projekt „Modernizace a obnova přístrojového vybavení komplexního.
PSA jako diagnostický marker, PCA3 a další markery
Synoviální sarkom Ravčuková B1. , Kadlecová J1. , Štěrba J 2
Real-time PCR - princip
IMUNITNÍ SYSTÉM IMUNITA = schopnost organismu chránit se před patogeny (bakterie,viry,houby,prvoci  onemocnění) Nespecifická : Fagocytóza granulocytů,monocytů.
Obecná endokrinologie
Transplantace kmenových buněk krvetvorby u maligních onemocnění krvetvorby Klinika dětské hematologie a onkologie 2. LF UK a FN v Motole.
Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,
Radionuklidové metody v onkologii
Nádory -klasifikace, třídění.
Testikulární nádory.
Jiří Ferda, Eva Ferdová, Jan Záhlava, Alexander Malán
Preimplantační genetická diagnostika Oddělení lékařské genetiky FN Brno Gynekologicko - porodnická klinika Masarykovy univerzity v Brně.
DNA bankování pro lékařský výzkum „informovaný souhlas“ OLG FN Brno.
Muskulární dystrofie typu Duchenne (Becker) B. Ravčuková , J
RNA savčí buňka: pg celkové RNA rRNA (28S,18S, 5S) 80-85%
(genové mutace, otcovství, příbuznost orgánů při transplantacích) RNA
Patologická anatomie jatečných zvířat
1 Studie PROMID Placebo-controlled, double blind, prospective, Randomised study on the effect of Octreotide LAR in the control of tumor growth in patients.
RNA diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A. , Kadlecová J
Obecná onkologie I..
Indikátory kvality mamografického screeningu v podmínkách senologického centra Večeřová L., Zemanová G., Vachoušek J. Centrum pro nemoci prsu, Praha 10.
CYCLIN DEPENDENT KINASES AND CELL CYCLE CONTROL Nobel Lecture, December 9, 2001 Paul M. Nurse.
Inspirováno přednáškou Doc. MUDr. Ondrejčáka, CSc.
JEDEN HORMON JEDNA CÍLOVÁ TKÁŇ JEDEN EFEKT (ÚČINEK) Toto je ideální situace, která ve skutečnosti existuje jenom zřídka (hypofyzární tropní hormony).
Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod:
Molekulární biotechnologie č.6b Zvýšení produkce rekombinatního proteinu.
XIX.den profesora Vladimíra Staška Onkologie 21. století
Autor: Milan Blaha Konzultant: Prof. MVDr. Jan Motlík, DrSc.
Prediktivní a prognostická patologie Prediktivní a prognostická patologie Část I Část I.
* onkofetální (AFP, CEA ..) * onkoplacentární (hCG, isoenzymy ALP)
RNA savčí buňka: pg celkové RNA rRNA (28S,18S, 5S) 80-85%
DNA diagnostika.
Mikrodeleční syndrom 1p36
DNA diagnostika II..
Základní typy genetických chorob Marie Černá
Onkogenetika, genetické poradenství u hereditárních nádorových onemocnění v pediatrii Renata Gaillyová LF MU 2006.
Praktikum z genetiky rostlin JS Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana Genetické mapování genu odolnosti k padlí.
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
PREVENCE ►Primární prevence ► Primární prevence Cíl – odstraňovat nebo omezovat možné příčiny vzniku onemocnění Na základě nových poznatků o patogenezi.
Protinádorová imunita Jiří Jelínek. Imunitní systém vs. nádor imunitní systém je poslední přirozený nástroj organismu jak eliminovat vlastní buňky které.
Epidemiologie, dědičné riziko, možnosti genetického testování a prevence MUDr. Marie Navrátilová, PhD. Oddělení epidemiologie a genetiky nádorů, Masarykův.
Hereditární nádorové syndromy spojené s karcinomy kolorecta MUDr. Dagmar Štenglová, Genetika Plzeň s.r.o.
RNA savčí buňka: pg celkové RNA rRNA (28S,18S, 5S) 80-85% tRNA, snRNA 15-20% mRNA 1-5% mRNA molekul/buňku, tj rozdílných transkriptů.
Biotechnologie, technologie budoucnosti Aleš Eichmeier.
Současný stav klinické genetiky a její perspektivy v klinické medicíně.
Nevy, maligní melanom a jiné kožní nádory Nevy, maligní melanom a jiné kožní nádory.
Glioblastoma multiforme – možnosti léčby
Onkologie Jitka Pokorná.
A. Mrkvičková, K. Pernicová, R. Řezáč, S. Schniererová, D. Šabatová
Buněčný cyklus buněčný cyklus (generační doba) - doba mezi dvěma mitózami (rozdělení buňky na dvě dceřinné) - velmi variabilní, podle typu tkáně.
Václav Hořejší Ústav molekulární genetiky AV ČR IMUNITNÍ SYSTÉM vs
MiRNA
Poruchy mechanizmů imunity
Transkript prezentace:

Real-time PCR v diagnostice MRD a vývoji metastáz u neuroblastomu Kadlecová J.1, Kratochvílová A. 1, Ravčuková B 1 , Valášková I. 1, Gaillyová R. 1 a Štěrba J2. 1 Oddělení lékařské genetiky, 2 oddělení dětské onkologie FN Brno

Neuroblastom Nádor periferního nervového systému Patří mezi nejčastější dětské solidní tumory 8-10% všech pediatrických nádorových onemocnění 40% případů diagnostikováno do 12ti měsíců a 90% do 5ti let věku pacienta Incidence 5-10 nemocných na jeden milion dětí Odvozený od migrujících primitivních buněk neurální lišty autonomního nervového systému Primární ložiska: dřeň nadledvinek, ganglia sympatiku U >50% pacientů v době stanovení diagnosy zjištěny metastáze do ostatních orgánů (časně metastázující) O molekulárním mechanismu růstu, diferenciace a programované smrti NBL je stále velmi málo informací

Klinická stádia neuroblastomu Klasifikace podle Evanse (Children´s Cancer Study Group Staging System for Neuroblastoma) Stadium I Stadium II Stadium III Stadium IV Stadium IV-S -Ložisko nádoru je vymezeno orgánem,ve kterém nádor vznikl -Nádor se rozšiřuje mimo původní ložisko, ale nepřekračuje střední linii. Mohou být zasaženy regionální lymfatické uzliny v blízkosti nádoru. -Nádor se celkově rozšiřuje za střední linii, jsou zasaženy lymfatické uzliny na obou stranách těla. -Nádor metastázuje do vzdálených orgánů (lymfatické uzliny, kosti a kostní dřeň, játra, kůže). -Zahrnuje stádia I a II u dětí mladších 12 měsíců,s metastázemi v játrech, kůži, kostní dřeni, ale kosti nejsou zasaženy.

Prognostické faktory Věk Stadium choroby při diagnose Histopatologický nález Hladiny biochemických markerů v krvi a moči: k.vanilylmandlová a homovanilinová, ferritin, neurospecifická enoláza, laktátdehydrogenáza, katecholamin a jeho deriváty Genetické faktory  ploidie buňky, stupeň amplifikace N-myc protoonkogenuHSRs, delece 1p36(obsahuje gen pro nádorový supresor)LOH, dmins, úroveň exprese genu pro TH, TRK A a C, GD2 syntetázy, telomerázová aktivita....

Genová exprese v buňkách neuroblastomu molekulární markery Rozdílná genová exprese průběh nemoci příznivý vs. nepříznivý neuroblastom vs. normální tkáň Tkáňově specifická exprese gen TH GD2 syntetáza Nádorově specifická exprese geny MAGE, GAGE Trk A Trk C n-myc Trk B n-myc telomerázová aktivita (hTERT) telomerázová aktivita (hTERT) Změna úrovně exprese

Klinický význam molekulárních markerů  stanovení diagnósy  sledování průběhu onemocnění (MRD, relaps)  detekci NB buňěk v transplantátu před autologní transplantací  určení prognósy

Tyrosinhydroxyláza (TH) Stanovení citlivosti detekce TH mRNA fragmentační analýza (ABI PRISM 310) 10-3 bb NB 10-4 bb NB 10-5 bb NB 10-6 bb NB 1.enzym dráhy syntézy katecholaminů katecholaminy důležité neurotransmitery a hormony, regulují vnitřní funkce a motorickou koordinaci jsou sekretovány 98% NB (NB je endokrinně aktivní ) jejich metabolity používány pro sledování průběhu onemocnění exprese TH genu je regulována tkáňově specificky během neonatálního vývoje a diferenciace - lokalizace genu TH v oblasti 11p15.5 MG TH 299bp Stanovení citlivosti detekce mRNA pro TH 10-6 10-5 10-4 10-3 10-2

MAGE 1- 6 a GAGE 1-8 Strategie detekce exprese genů MAGE a GAGE izolace RNA RT-PCR kontrola kvality bMG detekce jednotlivých subtypů MAGE 1-6/ GAGE 1-8 Genové rodiny Kódují nádorové antigeny Jejich produkty (vázané na MHC) jsou rozpoznávány cytotoxickými T lymfocyty Exprimovány širokým spektrem lidských nádorů (NB, melanom, k.plic, žaludku, prsu...) M 1-6 1 2 3 4 5 6 K- 1,5 % agarózový gel, barveno EtBr

Detekce exprese MAGE1-6/ GAGE1-8 pomocí real-time PCR K-/genomDNA Real-time PCR : pomocí FRED sond ( fluorescence resonance energy transfer): Hybrid. proba 1: donor (fluorescein) Hybrid proba 2: akceptor (LC RED640, 750) Analýza bodu tání amplifikovaného produktu je přímo závislá na sekvenci analyzovaného produktu MAGE h-2M Relativní kvantifikace pomocí LightCycleru.(Roche) Koncentrace cílové sekvence (MAGE) je vyjádřena ve vztahu k referenčnímu (housekeeping) genu (beta2-Mikroglobulin). K výpočtu koncentrace cílové sekvence i refernečního genu analyzovaného vzorku je užívána standardní kalibrační křivka.

Neurotrofinové receptory trk A, B a C neurotrofiny a jejich receptory regulují proliferaci, diferenciaci a smrt normálních i neoplastických buněk nervové tkáně tyrosin-kinázové membránové receptory trk A, B, C jsou nezbytné pro vysokou vazebnou afinitu a plnou biologickou funkci neurotrofinů a hrají důležitou roli v biologii a klinickém chování neuroblastomů vazebný ligand pro trk A receptor je NGF (nerve growth factor), pro trk B receptor : BDNF (brain derived nerotrophic factor, pro trk C receptor : NT-3 (neurotrophin 3)

Kvantitativní stanovení transkriptu genu trk A pomocí real-time PCR h-2M Relativní kvantifikace. Koncentrace cílové sekvence (trk A) je vyjádřena v poměru ke koncentraci referenčního (housekeeping ) genu , např. 2M (2-Microglobulin gene) . K výpočtu koncentrací je užívána standardní kalibrační křivka.

Telomerázová aktivita (TA) Telomeráza multiproteinový komplex lidská telomerázová reversní transkriptáza (hTERT) vnitřní RNA řetězec (hTR) RNA vazebný protein (hTEP1) podíl na vývoji a progresi maligních nádorů TA je detekována v obnovujících se a rychle se dělících buňkách (zárodečné a nádorové buňky) může být zachycena v hyperplastických a jiných než neoplastických tkáních marker proliferace prognostický marker neuroblastických nádorů, vysoká TA (exprese hTERT) koreluje s agresivním biologickým chováním

GD2 syntetáza téměř všechny tkáně neuroblastomu vysokou úroveň GD2 gangliosidu normální buňky (ne neurálního původu) minimální nebo nulová hladina GD2 gangliosidu GD2 syntetáza (-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferáza) klíčová role v biosyntéze GD2 gangliosidu aktivita koreluje s expresí GD2 na povrchu buněk senzitivní a specifický molekulární marker pro detekci buněk odvozených od neurální lišty

Závěr Je možno postihnout heterogenitu NB  zvýší Zavedení vysoce citlivé metody real-time PCR k detekci i ke kvantifikaci nádorových markerů umožňuje odhad rizika vývoje metastáz v čase diagnózy nemoci prognózu léčebné odpovědi testování kmenových buněk před autologní transplantací kombinací více molekulárních markerů s dalšími nezávislými metodami detekce ( imunocytologickými, histologickými) je možno zvýšit detekční možnosti nádorové diagnostiky. Je možno postihnout heterogenitu NB  zvýší se pravděpodobnost záchytu NB

za laskavé poskytnutí buněčné linie neuroblastomu IMR-32 Poděkování patří především spolupracovnicím z laboratoře molekulární genetiky OLG Brno a také Dr. S. A Burchill z oddělení dětské onkologie,St.James´s University Hospital, Leeds za laskavé poskytnutí buněčné linie neuroblastomu IMR-32