Projekt EU na Lékařské fakultě UP v Olomouci „Zavádění principů medicíny založené na důkazu do výuky na vysokých školách“ Řešitelské pracoviště: Lékařská fakulta UP v Olomouci Garant: Prof. MUDr. Vladimír Mihál, CSc. URL: http://ebm.upol.cz TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁN EVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM ROZPOČTEM ČESKÉ REPUBLIKY

Získávání informací pro obor zubní lékařství Zdroje & Postupy Mgr. Jarmila Potomková Knihovna & Ústav lékařské biofyziky LF UP v Olomouci potomkov@tunw.upol.cz Odborná spolupráce: Doc. MUDr. Dagmar Koukalová, CSc. Ústav mikrobiologie LF UP v Olomouci Technická spolupráce: RNDr. Dana Šubová Knihovna LF UP v Olomouci

Získávání informací Co potřebujeme vědět: Kde vyhledávat (multizdrojový přístup) Jak vyhledávat Rešeršní strategie (terminologie) Logické vazby mezi termíny (Booleovské operátory – AND, OR, NOT) Jak hodnotit kvalitu vyhledaných informací

Kde vyhledávat? Google zvyšuje kvalitu obsahu Tang H., Hwee Kwoo Ng, J. Googling for diagnosis – use of Google as a diagnostic aid: internet based study. BMJ 2006, published online 10 November. Giustini D., How Google is changing medicine. BMJ 2005, 331:1487-8.

Kde vyhledávat ? Vyhledávací služby „search engines“ Google Vyhledávací postupy Pokročilé vyhledávání Klasifikace a kvalita informací www.google.com (cz) Informace z různých zdrojů www.scholar.google.com Informace z časopiseckých článků

Google Výsledky vyhledávání Články z odborných časopisů Citace Abstrakta Plné texty Přímo od nakladatelů nebo prostřednictvím poskytovatelů (ScienceDirect, Blackwell Publishing, Ovid Technologies, EBSCO, HighWirePress, Proquest aj.) Předplatné, licence, „pay-per-view“ apod. Volná dostupnost („open access“)

Google Výsledky vyhledávání Odkazy na jiné databáze / katalogy/ vyhledávací služby PubMed (Medline) – „zlatý standard“ pro medicínu včetně zubního lékařství LookSmart Find Articles Journal Watch INIST Aj. Webové stránky Institucí Univerzit Odborných společností Zdravotnických zařízení Farmaceutických firem Médií Obchodních společností Soukromých osob Ostatní dokumenty Pacientské informace Obrazová dokumentace Prezentace v powerpointu Bibliografické soupisy Patenty A mnoho dalších…….

Hodnocení kvality vyhledaných informací eEurope 2002: Quality Criteria for Health related Websites Communication from the Commission to the Council, the European Parliament, the Economic and Social Committee and the Committee of the Regions Originally published in the Journal of Medical Internet Research (http://www.jmir.org), 29.11.2002

eEurope 2002: Kvalitativní kritéria pro webové stránky se zdravotnických obsahem Transparentnost obsahu, důvody pro zveřejnění, příp. zdroje financování; Autorství obsahu včetně citací použitých informačních zdrojů; Ochrana pacientských dat; Aktualizace obsahu; Zajištění validity a spolehlivosti pacientských informací; Technická podpora přístupu k informacím s ohledem na cílovou skupinu.

Odborné téma pro vyhledávání: Autorka: Doc. MUDr. D. Koukalová, CSc Zubní plak jako faktor vzniku zubního kazu

*Google česky : www.google.cz Pokročilé vyhledávání Zadaní termínů Se všemi slovy: kaz plak S přesnou frází: Alespoň s jedním ze slov: zub zuby zubní zubech zubů Výskyt: kdekoliv na stránce

* Google anglicky: www.google.com Advanced Search With al the words: plaque caries With the exact phrase: With at least one of the words: dental tooth teeth Where my words occur: in the title of the page Možné kombinace: dental plaque, plaque on teeth, dental caries, tooth caries, caries of teeth

* Google Scholar: časopisy, brožury….. www.scholar.google.com Advanced Search With all the words: plaque caries With the exact phrase: With at least one of the words: dental tooth teeth Occurrences: anywhere in the article in the title of the articles Citační ohlasy na publikované články Cited by…..

*Odborné časopisy pro zubní lékařství „Dentistry Journals“ Ulrich´s Periodicals Directory www.ulrichsweb.com Browse by Subject Medicine ---MEDICAL SCIENCE-DENTISTRY Celkový počet časopisů z oboru = 1213(2007), 1258(2008) Odborné (scholarly) = 424 Recenzované (peer-reviewed, refereed) = 165 ČR=69/LF=10 Elektronická verze = 167 Recenzované = 100

*Odborné časopisy pro zubní lékařství Dostupnost v ČR Síť lékařských a zdravotnických knihoven Souborný katalog Národní lékařské knihovny v Praze http://www.nlk.cz/Katalogy,Databáze/Medvik Vyhledávání – rozšířené – předmět Souborný katalog konkrétních titulů (kód knihovny = „sigla“) LFUP (OLD002); VKOL (OLA001) Registrace pro vzdálený přístup (200,- Kč/rok) Knihovna LF UP v Olomouci http://knihovna.upol.cz/lf - Časopisy Vědecká knihovna v Olomouci http://www.vkol.cz Např. DENTAL ABSTRACTS

Dostupnost časopisů v ČR Caries Research www.nlk.cz Katalogy a databáze / Medvik / Najdi časopis:

DENTAL ABSTRACTS Vychází 6x ročně od r. 1955 Stručné informace o obsahu klíčových článků ze světových stomatologických časopisů Rozsah: ca. 50 článků/číslo Záběr: ca. 100 časopisů Šetří čas nutný pro vyhledávání, získání a studium původní literatury. Vědecká knihovna v Olomouci www.vkol.cz Prezenčně ve studovně časopisů

Odborné časopisy: Které jsou ty dobré? Recenzování („peer-review“) Měření kvality časopisů podle citačního ohlasu „impakt faktor“ (IF) Bibliometrie 60. léta 20. st. …..aplikace matematických a statistických metod pro hodnocení vědeckého dopadu psané literatury a ostatních komunikačních médií“

*Institute for Scientific Information Ústav pro vědecké informace Philadelphia, Penn., USA Zakladatel Eugene Garfield www.garfield.library.upenn.edu/ 1960 ISI Citační analýza (Science Citation Index) Impakt faktor časopisů (Journal Citation Reports) Databáze WEB OF KNOWLEDGE http://isiknowledge.com Špála M. Impakt faktor – Dobrý sluha, ale špatný pán. Ikaros [online]. 2006, roč. 10, č. 4 [cit. 2007-01-24]. Dostupný na World Wide Web: http://www.ikaros.cz

Impakt faktor Způsob výpočtu Sledované období = 3 roky IF 2006 se vypočítal takto: A = kolikrát byly články z daného časopisu publikované v letech 2004 + 2005 citovány jinými sledovanými časopisy v průběhu r. 2006 B = kolik vyšlo v daném časopise za roky 2004 + 2005 článků celkem IF daného časopisu pro rok 2006 = A : B

*Impakt faktor : příklad výpočtu „Caries Research“ A = kolikrát byly články z daného časopisu publikované v letech 2004 + 2005 citovány jinými sledovanými časopisy v průběhu r. 2006 2004: 252 2005: 89 04+05=341 B = kolik vyšlo v daném časopise za roky 2004 + 2005 článků celkem 2004: 73 2005: 75 04+05= 148 IF daného časopisu pro rok 2005 = A : B 341 : 148 = 2,304

*Časopisy pro zubní lékařství podle IF: srovnání s jinými obory WEB OF KNOWLEDGE http://isiknowledge.com Journal Citation Reports View a group of journals by Subject Category – Dentistry, Oral Surgery Abecední řazení změnit podle IF Sorted by: Impact Factor --- Sort again View all journals

*Kde vyhledávat ? Databáze MEDLINE via PubMed http://www.pubmed.com

DATABÁZE MEDLINE „Zlatý standard“ pro biomedicínu Charakteristika National Library of Medicine /Bethesda, USA Bibliografické citace a autorské souhrny 4,600 časopisů publikovaných v USA a 70 dalších zemích více než 17 mil. záznamů od r. 1950 OldMedline od r. 1950 Většina záznamů z anglicky psaných zdrojů (nebo s anglickým abstraktem) MEDLINE na platformě PubMed (www.pubmed.com) originálním obsahem je citace + abstrakt plné texty dokumentů jsou poskytovány hypertextově od nakladatelů (LinkOut) Přístup k citacím + abstraktům zdarma Plné texty zdarma licence

Odborné téma pro vyhledávání: Autorka: Doc. MUDr. D. Koukalová, CSc Zubní plak jako faktor vzniku zubního kazu

Příprava rešeršní strategie Plán pro vyhledání požadovaných informací Jak na to: Rozdělte rešeršní dotaz na logické celky Specifikujte hlavní termíny (klíčová slova, víceslovné pojmy) Určete alternativní termíny (synonyma, hierarchii pojmů) Použijte logické operátory pro kombinaci termínů Upřesněte dotaz Výskyt hledaných termínů v různých částech dokumentu (název, název + abstrakt, text…) Věkové skupiny Typologie dokumentů (pyramida důkazu) Stáří dokumentu Praktické zkušenosti, intuice ……

Booleovská logika Symbolicky vyjadřuje vztahy mezi pojmy Booleovské operátory: AND Dokumenty obsahují oba (nebo více) hledaných terminů dental plaque AND dental caries OR Dokumenty obsahují jeden (nebo všechny) hledané termíny. Synonyma dental caries OR tooth decay NOT Vylučuje daný termín. dental caries NOT fluoride

Praktické vyhledávání MEDLINE via PUBMED

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.com Search PubMed for: KROK 1 (caries OR decay*) AND plaque Limits: Title

Pravostranné rozšíření Truncation, Wildcard PubMed vyhledá všechny termíny od slovního základu, za nímž je znak * Příklad: decay* PubMed vyhledá:decay,decays, decayed,,,,,,,,

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.com Search PubMed for: KROK 2 tooth OR teeth OR dent* Limits: Title

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.com Search PubMed for: KROK 3 Combine searches - kombinace (AND operator) #1 AND #2 Limits – další možnosti omezení dotazu Age – věkové kategorie Type of articles – typy publikací Review – přehledové články Clinical trials – klinické studie aj. Publication date – kdy článek vyšel Languages – v jakém jazyce byl publikován

*Jak PubMed zobrazuje výsledky? Formáty Summary AbstractPlus MEDLINE Aj. Zpracování výsledků Send to Clipboard (vytvoření podmnožiny vybraných záznamů) Text (převedení do textové podoby) File (uložení do souboru) Printer (tisk záznamů)

Ověřování dostupnosti časopisů a jejich kvality PubMed Links – LinkOut / plný text? Uvést poskytovatele: např. Springer, Elsevier, Proquest apod. MEDVIK http://www.nlk.cz Souborný katalog ČR; rok odběru; Uvést siglu knihovny WEB OF KNOWLEDGE http://isiknowledge.com Additional Resources -Journal Citation Reports – Impakt faktor Uvést hodnotu IF

Struktura citace časopiseckého článku Minimum pro objednání dokumentu Autoři: Cutress TW et al. (více autorů) Název: Effects of fluoride-supplemented sucrose on experimental dental caries and dental plaque pH. Časopis: Adv Dent Res. 1995;9(1):14-20. 9 – označení svazku (volumu) (1) – označení čísla v rámci svazku

Přehledové články (review) Klasické review subjektivní a nekvantitativní souhrn dvou a více vědeckých studií. Systematické review kvantitativní kombinace dvou nebo více souvisejících studií, která umožní získat souhrnnou odpověď na studovanou otázku. Meta-analýza systematické review, které používá statistické metody pro hodnocení studií Potomková J., Význam systematických přehledů pro medicínu založenou na důkazu. Pediatrie pro Praxi 2004(2): 105-106. www.solen.cz

Pyramida důkazů Hierarchické uspořádání vědeckých důkazů v biomedicíně zahrnuje kromě výsledků primárního výzkumu i formy sekundárního výzkumu (systematické přehledy a meta-analýzu). Systematické přehledy, meta-analýza Randomizované kontrolované pokusy Kohortové studie Studie případů a kontrol Kazuistiky Odborné posudky, konzultace Laboratorní výzkum

Zubní lékařství založené na důkazu Vyhledávání a kritická analýza poznatků

Archibald L. Cochrane (1909-1988) Effectiveness and Efficiency. Random Reflections on Health Services. London, 1972. „Naše povolání bychom měli nepochybně podrobit velké kritice. Nebyli jsme zatím schopni nabídnout kritický přehled (průběžně AKTUALIZOVANÝ) všech významných randomizovaných kontrolovaných studií.“ Cochrane Collaboration Cochrane Library URL: www.cochrane.org/

Randomizovaná kontrolovaná studie Co to je? Klinické studie Observační (žádným způsobem se nezasahuje do „chodu událostí“, zaznamenávají se zjištění) Intervenční (výzkumníci určují kdo a jaké léčbě bude podroben) Randomizované kontrolované Porovnání dvou skupin osob, z nichž jedna je např. léčena klasickým (kontrolním způsobem) a druhá postupem novým (testovaným). Zařazení do skupin může být prováděno náhodně nebo nenáhodně. Náhodné přiřazení (randomizace) omezuje možnost vzniku interpretačních chyb.

Pyramida důkazů Hierarchické uspořádání vědeckých důkazů v biomedicíně zahrnuje kromě výsledků primárního výzkumu i formy sekundárního výzkumu (systematické přehledy a meta-analýzu). Systematické přehledy, meta-analýza Randomizované kontrolované pokusy Kohortové studie Studie případů a kontrol Kazuistiky Odborné posudky, konzultace Laboratorní výzkum

Pyramida důkazů : Komentáře Systematické přehledy a meta-analýzy. Randomizované kontrolované studie (RCT). RCT s  validními výsledky (tj. intervaly spolehlivosti, jež se nepřekrývají s prahem klinicky významného účinku, méně než 20% ztrát probandů). RCT s  méně validními výsledky (tj. výstup ze studie naznačuje klinicky významný účinek, ale  intervaly spolehlivosti se překrývají s prahem pro tento účinek). Kohortové studie. Studie případů a kontrol. Kazuistiky. Odborné posudky, úvodníky, názory…..

Pro další vzdělávání http://www.euromise.cz Statistické metody v epidemiologii

Téma pro vyhledání důkazů Autor: Prof. MUDr. V.Mihál, CSc Význam fluoridů v prevenci zubního kazu u dětí a adolescentů z pohledu medicíny založené na důkazu

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.com Search PubMed for: KROK 1 (caries OR decay*) AND fluori* Limits: Title

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.com Search PubMed for: KROK 2 tooth OR teeth OR dent* Limits: Title

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.com Search PubMed for: KROK 3 Combine searches - kombinace (AND operator) #1 AND #2 Limits – další možnosti omezení dotazu Age – věkové kategorie Child: 6-12 years, Adolescent: 13-18 years Type of articles – typy publikací Randomized Controlled Trials – randomizované kontrolované studie NEBO Subsets Systematic reviews – systematické přehledy

Randomizovaná kontrolovaná studie Příklad Truin GJ, van't Hof MA. Caries prevention by professional fluoride gel application on enamel and dentinal lesions in low-caries children. Caries Res. 2005;39(3):236-40.

Subsets : Systematic reviews Příklady přehledových článků Časopisecký přehled Marinho VC, Higgins JP, Logan S, Sheiham A. Systematic review of controlled trials on the effectiveness of fluoride gels for the prevention of dental caries in children. J Dent Educ. 2003;67(4):448-58. Review. „Cochrane“ review Marinho VC et al. Fluoride gels for preventing dental caries in children and adolescents. Cochrane Database Syst Rev. 2002, Issue 2.

1993 – 50 skupin Zaměření činnosti http://www.cochrane.org „Cochrane Database of Systematic Reviews „ http://www.cochrane.org Access Cochrane Library/Advanced Přístup do plných verzí systematických přehledů je za poplatek

COCHRANE LIBRARY ADVANCED SEARCH fluori* Record Title AND "dental caries" OR "dental decay*„ Restrict Search by Product: The Cochrane Database of Systematic Reviews (Cochrane Reviews - CDSR)

Systematický přehled Příklad (CDSR) Fluoride gels for preventing dental caries in children and adolescents The record should be cited as: ………….. Datum poslední aktualizace CDSR: ………. Strukturovaný abstrakt Background(úvod)-Objectives(cíl)–Search strategy (vyhledávání)–Selection criteria(kritéria výběru studií)-Data collection & analysis(sběr a analýza dat)-Main results(hlavní výsledky)-Authors´conclusions(závěry autorů)-Plain language summary(závěr pro laiky).

Systematický přehled Příklad: rozbor (CDSR) Výběr studií Randomizované studie Výsledky 25 zařazených studií /7747 dětí Meta-analýza Jednoznačný důkaz inhibičního účinku fluoridového gelu na tvorbu zubního kazu 2 studie popisovaly negativní účinky Závěry autorů Nutnost dalších klinických studií

COCHRANE REVIEWS Přístup k dokumentu v síti LF UP Marinho VCC et al. Fluoride gels for preventing dental caries in children and adolescents. Cochrane Database of Systematic Reviews 2002, Issue 1. http://www.upol.cz/Lékařská fakulta/Pracoviště/Knihovna LF/Databáze

Syntetická databáze DynaMed Kriticky hodnocené poznatky http://search.epnet.com

Standardní struktura témat v databázi DynaMed Popis nemoci (včetně kódu MKN-9) Příčiny a rizikové faktory Komplikace Anamnéza Fyzikální nález Diagnóza Prognóza Terapie Prevence & Screening Použitá literatura (včetně přehledových článků a praktických postupů - guidelines) Pacientské informace

Klinická otázka pro dnešní den P = zubní kaz u dětí I = fluoridy C = bez fluoridů O = prevence zubního kazu

Vyhledání tématu v databázi DynaMed Find dental caries fluorides Text Dental caries (MKN) Prevention and Screening Kvalitativní hodnocení „Levels of evidence“ – úrovně důkazu

Pro další vzdělávání http://ucebnice.euromise.cz Statistické metody v epidemiologii http://isiknowledge.com WEB OF KNOWLEDGE

Zubní lékařství založené na důkazu Multizdrojové vyhledávání informací & bibliometrie

Přehled online zdrojů SCHOLAR GOOGLE http://www.scholar.google.com Jen časopisecké články + citační ohlasy (pokud existují) MEDLINE (PubMed) http://www.pubmed.com COCHRANE LIBRARY http://www.cochrane.org

Přehled online zdrojů WEB OF SCIENCE http://isiknowledge.com General Search (multidisciplinární DB) Cited Reference Search (citační ohlasy) Journal Citation Reports (impakt faktor) NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA http://www.nlk.cz Katalogy a databáze (Souborný katalog zahr.časopisů) Bibliographia Medica Čechoslovaca (české články) Česko-anglický tezaurus termínů z lékařství a zdravotnictví MeSH CZ

Klinická otázka pro dnešní den Minimálně invazivní léčba v parodontologii Návrh terminologie: [periodontal disease, periodontitis] periodont* nonsurg* OR noninvasive therap* OR treat* OR manag*

SCHOLAR GOOGLE http://www.scholar.google.com With all the words: periodontal nonsurgical At least one of the words: treatment therapy management Where my words occur: in the title of the article Articles published between: 2002 2007

MEDLINE - PubMed http://www.pubmed.com Krok 1 periodont*/Title Krok 2 (nonsurg* OR noninvasive) AND (therap* OR treat* OR manag*)/Title Krok 3 1 AND 2 Krok 4 Randomized controlled trial

Kritická analýza Randomizovaná kontrolovaná studie 1:Loesche WJ, Giordano JR, Soehren S, Kaciroti N. The nonsurgical treatment of patients with periodontal disease: results after five years. J Am Dent Assoc. 2002 Mar;133(3):311-20. Kvalita studie: 90/ztráta 46

Kritická analýza Randomizovaná kontrolovaná studie 2. Kasaj A, Willershausen B, Berakdar M, Tekyatan H, Sculean A. Effect of an oily calcium hydroxide suspension on early wound healing after nonsurgical periodontal therapy. Clin Oral Investig. 2006 Mar;10(1):72-6. Kvalita studie: jednoduše zaslepená, 19/ ztráta 0, trvání 3 týdny

Kritická analýza Systematický přehled Labriola A, Needleman I, Moles DR. Systematic review of the effect of smoking on nonsurgical periodontal therapy. Periodontol 2000. 2005;37:124-137. Comment in: Evid. Based Dent. 2005; 6(2):37-8.

COCHRANE LIBRARY http://www.cochrane.org Search for: periodont*/Record Title AND non-surg* OR noninvasive/ Title,Abstract,Keywords Restrict Search by Product: CD Systematic Reviews

WEB OF SCIENCE http://isiknowledge.com RCT č.1: Loesche WJ /JADA/ 2002 Cited Reference Search (citační ohlasy) RCT č.1: Loesche WJ /JADA/ 2002 Times cited: 10x Journal Citation Reports (impakt faktor) RCT č.1: Journal of the American Dental Association Impact Factor: 0,935

WEB OF SCIENCE http://isiknowledge.com General Search (multidisciplinární DB) Postup vyhledávání stejný jako v PubMed

Výsledky Srovnání PubMed x Web of Science Počty záznamů: PubMed……..…………………..68 Web of Science ………………59 z toho unikáty……………31

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA http://www.nlk.cz Katalogy a databáze MEDVIK Vyhledávání časopisů Ověřit dostupnost časopisu: Loesche WJ, Giordano JR, Soehren S, Kaciroti N. The nonsurgical treatment of patients with periodontal disease: results after 6.4 years. Gen Dent 2005 Jul-Aug;53(4):298-306

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA http://www.nlk.cz Katalogy a databáze Tezaurus MeSH (řízený slovník) Bibliographia Medica Čechoslovaca (články v českých časopisech) Medical Subject Headings

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA Tezaurus MeSH Vyhledávání parodont Vyhledá výraz tezauru: periodont

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA Báze BMC Vyhledávání: Rejstřík: Název parodont? and ter? Výsledek: 16 záznamů Rejstřík: Deskr MeSH periodont and terapie Výsledek: 50 záznamů Rejstřík: Všechny Výsledek:127 záznamů