(aminokyseliny, peptidy…)

Prezentace na téma: "(aminokyseliny, peptidy…)"— Transkript prezentace:

1 (aminokyseliny, peptidy…)
Proteiny (aminokyseliny, peptidy…)

2 Aminokyseliny

3 Proteinogenní aminokyseliny

4 Proteinogenní aminokyseliny

5 Proteinogenní aminokyseliny

6 postranní řetězce aminokyselin jsou místem posttranslačních modifikací proteinů

7 peptidová vazba Pořadí aminokyselin:
primární struktura peptidů a proteinů

8 Sekundární struktura proteinů
uspořádání po sobě následujících zbytků AK (helixy, otáčky, listy) charakteristické úhly mezi skupinami tvořícími peptidovou vazbu stabilizace vodíkovými vazbami mezi skupinami tvořícími peptidovou vazbu

9 a-helix kolagenový helix -obvykle pravotočivý vzácně levotočivý
-stabilizace vodíkovými vazbami -postranní řetězce směřují ven kolagenový helix -levotočivý, strmý -uvnitř helixu nejsou vodíkové vazby -tři helixy tvoří trojitou šroubovici stabilizovanou vodíkovými vazbami

10 b-(skládané) listy a-atomy ve „vrcholech“
-postranní řetězce směřují nad a pod rovinu listu

11 b-otáčky -změna směru polypeptidového řetězce
-vodíková vazba mezi 1. a 4. AK -spojka mezi rigidními strukturami (helixy, listy) -důležité pro sbalování proteinů do terciární struktury

12 Terciární struktura a „protein folding“
-uspořádání polypeptidového řetězce v prostoru -stabilizující interakce: hydrofóbní uvnitř globulární molekuly, polární zbytky na povrchu -vodíkové vazby mezi vzdálenými zbytky AK (vzhledem k primární struktuře) -disulfidové můstky -koordinační interakce s kovy (často Zn)

13 konformace proteinů je dynamická (vazba ligandů indukuje konformační změnu)

14 kvartérní struktura proteiny složené z více podjednotek
různé nebo stejné (oligomerní protein vs. multiproteinový komplex) enzymy DNA vazebné proteiny, transkripční faktory…