rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy
jednolokusové (sekvenování, SSCP, mikrosatelity, alozymy) mnoholokusové (DNA hybridizace, imunologické techniky, RFLP, AFLP, RAPD) poskytující znaková data poskytující distanční data
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy
mikrosatelity alozymy minisatelity d-loop (mtDNA) snp
RFLP totální DNA (repetitivní DNA), např. taxoprinty – odlišení sibling druhů RAPD sekvenování mtDNA sekvenování ITS AFLP
sekvenování úseků jaderné DNA (např. MLST) SSCP, DGGE DNA hybridizace imunologické techniky inserce transposomů (SINE)
sekvenování konzervativních genů DNA hybridizace studium obsahu genomu imunologické techniky
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy
vybavení spotřební materiál cena za znak cena za jedince investice do zavedení metody investice do zahájení analýzy nového taxonu
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy
BADS databáze , název techniky + population genetics, systematics, taxonomy, speciation…) počet článků
5% 44% 18% 14% 10% 8% 1%
4% 33% 16% 10,5% 7,5% 6% 0,8% 21%
Na ose y je vynesen počet článků ve WOS zmiňujících název metody v abstraktu.
Na ose y je vynesen podíl článků s názvem metody v titulu na celkovém počtu článků zmiňujících metodu v abstraktu.
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy
sběr dat –čipy –MLST –ireverzibilní unikátní znaky (SINE) zpracovávání dat –lepší alignment –vážená pasimonie –WEIGBOR, BIONJ –ML pro proteiny (multiprocesorové počítače) –Camin Sokalova maximální parsimonie a unikátní znaky
Metody se liší typem informace, kterou nám poskytují Pro jednotlivé aplikace se hodí jiné typy metod Používání jednotlivých metod je záležitost historická Metody se budou dále vyvíjet a je třeba jejich vývoj sledovat