Lek paradox ?.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Gonozomální dědičnost
Advertisements

Virová hepatitida typu C, epidemiologie, genetická heterogenita a její využití při šetření zdroje Hana Tkadlecová, KHS ZK se sídlem ve Zlíně, Vratislav.
Aster V, König J, Staňková M, Rozsypal H, Procházka B
Ideový závěr Co si mám z přednášky odnést (+ komentáře k užití statistiky v biologii)
Vliv společenského altruismu na globální lidský genofond Jan Kollár SBE.
Fylogeografie Studuje geografickou strukturaci populací Navazuje na evoluční biologii, ochranu živ. prostř., taxonomii.
Vznik diverzity živočichů: speciace a (adaptivní) radiace
Heterogenita nádorové buněčné populace v diagnostice a léčení
Power analysis aneb Co to vlastně znamená P0.05 (Podle Scheiner & Gurevitch 2001: Desing and analysis of ecological experiments.
Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice
Cvičení 6 – 25. října 2010 Heteroskedasticita
1 2 FUNKČNÍ VARIANTA GENU ANXA11 SNIŽUJE RIZIKO ONEMOCNĚNÍ SARKOIDÓZOU: POTVRZENÍ VÝSLEDKŮ CELOGENOMOVÉ ASOCIAČNÍ STUDIE. Sťahelová A. 1, Mrázek F. 1,
Výpočet a interpretace ukazatelů asociace v epidemiologických studiích
Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu
Biologická diverzita a Indexy biodiverzity
Základy genetiky.
Testování hypotéz vymezení důležitých pojmů
Obecný lineární model Analýza kovariance Nelineární modely
Teoretické základy šlechtění lesních dřevin Milan Lstibůrek 2005.
PARAZITISMUS Veronika Holcová 2005.
Instrukční hypotéza vytváření protilátek byla opuštěna ve prospěch hypotézy klonální. Mechanismy imunity jsou u obratlovců důležitější než mechanismy přirozené.
Vliv parazitů na ekologii populací a společenstev
Péče o biodiverzitu Jan Plesník Agentura ochrany přírody a krajiny ČR Praha
Opakování 1. K čemu slouží DNA? 2. Kde jsou umístěny chromozomy?
Přehled imunologie.
Řízení a supervize v sociálních a zdravotnických organizacích
GENETIKA Genetika je vědní disciplína, která se zabývá studiem dědičnosti a variability organismů.
Kladogeneze parazitů.
Vesmír v koncích.
Populační genetika je teoretickým základem šlechtění hospodářských zvířat; umožňuje sledování frekvencí genů a genotypů a tím i cílevědomé řízení změn.
Dědičnost základní zákonitosti.
Vznik diverzity živočichů: speciace a (adaptivní) radiace
SPECIES COEXTINCTION … možná krize biodiverzity Eva Tetíková.
Segregation distorter -octomilka
Vliv zdánlivé kompetice o sdíleného parazitoida na koexistenci hostitelských populací M. B. Bonsall, Michael P. Hassell, 1999: Parasitoid-mediated effects:
Účel procedury: První a závazný krok jakékoli seriozní komparativní studie. Umožňuje vyloučit možnost, že distribuce studovaného znaku (vlastnosti, vzorce.
- Pojmy - SPSS Statistické zpracování kvantitativních šetření.
Populační genetika.
Prostorová distribuce predace Lenka Čápová. -Shlukují se na místech s velkou hustotou kořisti -navzájem si konkurují a překážejí si; snižují rychlost.
1 Studie PROMID Placebo-controlled, double blind, prospective, Randomised study on the effect of Octreotide LAR in the control of tumor growth in patients.
Práce s výsledky statistických studií
Paraziti a pohlavní výběr
Interakce mezi organismy
Pohled z ptačí perspektivy
Senzitivita a specifita
Hostitelská specifita. Obsah Fenomén specifity Mechanismy specifity Měřítka specifity Evoluční příčiny existence specifity Faktory ovlivňující míru specifity.
Jak „dispersal limitation“ ovlivňuje druhovou bohatost společenstva Anna Vlachovská.
Evoluční a koevoluční procesy
Rychlost a směr evoluce parazita (ve srovnání se situací u jeho hostitele)
8. Syntéza a aplikace výsledků fylogenetických analýz
C < rb Čí je gen pro lezení na špičku?. Jde skutečně o adaptaci? - konvergentní vznik adaptací.
Výběr partnera.
Ekologie živočišných společenstev a populací
Vliv parazita na fenotyp hostitele
Paraziti vs. pohlavní množení. Koevoluce v rámci jedné populace vs. geografická mozaika Migrace a extinkce Potřebná variabilita je zajištěna: mutacemi.
Kospeciace vymizení přeskok duplikace.
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
R OZŠÍŘENÍ ŽIVOČICHŮ NA Z EMI Výukový materiál EK Tvůrce: Ing. Marie Jiráková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo:
Spontánní mutace Četnost: 10-5 – Příčiny:
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Zdraví a jeho determinanty Mgr. Aleš Peřina, Ph. D. Ústav ochrany a podpory zdraví LF MU Kamenice 5, Brno.
MUTACE náhodné nevratné změny genetické informace návrat do původního stavu je možný jen další (zpětnou) mutací jediný zdroj nových alel ostatní zdroje.
Ústav lékařské informatiky, 2. LF UK 2008 STATISTIKA II.
MIKROBY A MAKROORGANISMUS
Ekologie živočišných společenstev a populací
Vznik diverzity živočichů: speciace a (adaptivní) radiace
Fylogenetická evoluční analýza
BLECHY.
7. Kontingenční tabulky a χ2 test
Základy statistiky.
Transkript prezentace:

Lek paradox ?

Hamilton a Zuková: Good genes + Red Queen

3. Samičky dávají přednost „showy“ samečkům. Pro přijetí hypotézy Hamilton-Zuk je třeba splnění 4 podmínek: 1. Rezistence a „showiness“ jsou dědičné a v populaci existuje jejich variabilita. 2. Jedinci s nejvyšší parazitickou zátěží jsou méně „showy“ než zdraví jedinci. 3. Samičky dávají přednost „showy“ samečkům. 4. Druhy, které mají nejvíce parazitů, vykazují největší míru zbarvení a dalších znaků významných v pohlavním výběru.

Čím silnější tlak parazitů, tím výraznější by měl být efekt pohlavního výběru (test na krevních parazitech ptáků – Hamilton a Zuková) “showiness” Prevalence of blood parasites Fylogenetický konstreint?

barn swallow: tail display (Møller) H: longer tails attract females test: cut & lengthened tails 2.2. barn swallow: tail display (Box 8.2) 2.2.1. H1: longer tails attract females, handicap foraging 2.2.2. test: cut & lengthened tails, controls (2) 2.2.3. result: supported H1; paired earlier=> more broods 2.2.3.1. B: more extra-pair copulations 2.2.3.2. C: inefficient foraging=> short tail the next year

Jak se zabrání podvádění?! Pro přijetí hypotézy Hamilton-Zuk je třeba splnění 4 podmínek: 1. Rezistence a „showiness“ jsou dědičné a v populaci existuje jejich variabilita. 2. Jedinci s nejvyšší parazitickou jsou méně „showy“ než zdraví jedinci. 3. Samičky dávají přednost „showy“ samečkům. 4. Druhy, které mají nejvíce parazitů, vykazují největší míru zbarvení a dalších znaků významných v pohlavním výběru. Jak se zabrání podvádění?!

Podstata pohlavního výběru Hamilton - Zuk: good genes Zahavi: Handicap theory

Imunokompetentní teorie sekundární pohlavní znaky = dominance Podmiňuje produkci sekundárních pohlavních znaků endokrinní systém testosteron Indikují nepřítomnost parazita Blokuje imunitu Imunita parazit Stimuluje imunitu, pokud není hostitel přirozeně rezistentní (= good genes)

Specifita a koevoluce

Cryptosporidium muris Haematomyzus elephantis Dipilidium caninum

Hostitelská specifita Jak častá a silná je hostitelská specifita? Jak vzniká? Jak vznikají nové druhy parazita?

Pasivní i aktivní průnik Haematoloechus Vodní členovec specialista Pasivní průnik generalista Aktivní průnik Pasivní i aktivní průnik

Distribuce druhů z hlediska specifity (Helminti ptáků v bývalém SSSR) Log počtu hostitelských druhů Počet druhů parazitů

Hostitelský rozsah (host range) Závislost na počtu studií Definování druhu parazita na základě hostitelské specifity Chyby v určení Log počtu studií Log počtu hostitelů 1 2 Ektoparaziti ryb v Kanadě

Faktory určující hostitelskou specifitu (obvykle výraznější preference habitatu než vlastního hostitele) - Historické - Behaviorální - Ekologické - Geografické - Biochemické - Molekulární (receptory) - Imunita Různá specifita různých stádií

Hostitelská specifita % 100 80 60 40 20 0

Primární endosymbionti: kospeciace hostitele a symbionta Schizaphis graminum Rhopalosiphum padi R. maidis Buchnera 150-200 MY Acyrthosiphon pisum Diuraphis noxia Uroleucon sonchi U. rurale Myzus persicae Chaitophorus viminalis Mindarus kinseyi Pemphigus betae Melaphis rhois Schlechtendalia chinensis

Hostitelská specifita % 100 80 60 40 20 0

Hostitelská specifita % 100 80 60 40 20 0

Hostitelská specifita % 100 80 60 40 20 0

Sekvence pro env gen viru HIV

Proteocephalidea Pimelodidae

Pimelodidae Loricariidae

Hostitelská specifita % 100 80 60 40 20 0

Wolbachia (20 - 70% insect species) Drosophila simulans (R) Tribolium confusum Drosophila simulans (H) Drosophila orientaca Muscidifurax uniraptor Nasonia longicornis Nasonia vitripennis Ephestia cautela Wolbachia a – Proteobacteria (20 - 70% insect species) Lack of phylogenetic congruence Tribolium confusum Encarsia formosa Sitophilus oryzae Trichograma brevicornis Trichograma deion (MT) Trichograma cordubensis Trichograma deion (TX) Protocalliphora Nasonia grauli Nasonia longicornis Armadillidium vulgare Nasonia vitripennis Leptopilina australis Leptopilina clavipes Horizontal transfer between hosts and parasitoids Transient nature of infections (modification-rescue mechanism?)

- k jaké evoluční interakci došlo mezi konkrétními uzly? - je distribuce parazitů v hostitelích nenáhodná vzhledem k jejich fylogenetickým vztahům?

Brooksova parsimoniální analýza I 1 2 3 4 8 9 10 distribuce parazitů v hostiteli kladogram hostitelů parsimoniální analýza matice kódování distribuce a kladogramů parazitů do matice 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 2 4 3 5 6 7 10 8 9 11 12 kladogram parazitů

A B C D E 1 2 3 4 5 BPA II 1 2 3 4 5 6 7 8 9 A B C D E 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 P H 6 7 8 9 CI reflects switches A B C D E 1 2 3 4 5 6 7 8 9

kospeciace vymizení přeskok duplikace