Verifikace modelu toxicity na aktuálních onkologických datech

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Patologie mužského pohlavního systému
Advertisements

Testování hypotéz Jana Zvárová
Kulatý stůl-Paliativní medicína evropské zkušenosti
Kulinářský ateliér Eva Kandzerová Marta Kubínová Petra Lexová Petr Horák Brno 2010.
Testování neparametrických hypotéz
Testování hypotéz – princip,
Testování statistických hypotéz
Export dat, vytvoření tabulek a grafů na
4EK416 Ekonometrie Úvod do předmětu – obecné informace
Prevence a léčba komplikací spojených s ozářením karcinomu prostaty
Statistika Vypracoval: Mgr. Lukáš Bičík
Tloušťková struktura porostu
Nádory penisu.
Nemocní s metastazujícím onemocněním citliví k léčbě cytostatiky vyléčitelní lokálními metodami (chirurgie, radioterapie) nevyléčitelní lokálními metodami.
CHEMOTERAPIE - uplatnění u chirurgická léčba nebo radioterapie není možná u omezení radikálních - mutilujících zákroků (neoadjuvantní chemoterapie) u léčba.
Řízení a supervize v sociálních a zdravotnických organizacích
Kontingenční tabulky Závislost dvou kvalitativních proměnných.
VÝZKUM V OŠETŘOVATELSTVÍ
Nádory vaječníků.
Testy významnosti Karel Mach. Princip (podstata): Potvrzení H O Vyvrácení H O →přijmutí H 1 (H A ) Ptáme se:  1.) Pochází zkoumaný výběr (jeho x, s 2.
Tento Digitální učební materiál vznikl díky finanční podpoře EU- OP Vzdělávání pro konkurenceschopnost. Není –li uvedeno jinak, je tento materiál zpracován.
Lineární regresní model Statistická inference Tomáš Cahlík 4. týden.
Excel – Grafy Ing. Bohumil Bareš.
Kolorektální karcinom
Další spojitá rozdělení pravděpodobnosti
- Pojmy - SPSS Statistické zpracování kvantitativních šetření.
Kontingenční tabulky.
Analýza variance (ANOVA).
Ekonometrie „ … ekonometrie je kvantitativní ekonomická disciplína, která se zabývá především měřením v ekonomice na základě analýzy reálných statistických.
Statistika 4  Korelace VY_32_INOVACE_ Korelace - teorie.
Pohled z ptačí perspektivy
Bolest a primární péče MUDr.Bohumil Skála,PhD Praktický lékař pro dospělé SVL ČLS JEP Ústav soc.lékařství LF UK Hradec Králové.
Fitování Konstrukce křivky (funkce), která co nejlépe odpovídá naměřeným hodnotám. - může podléhat dodatečným podmínkám Lineární vs. nelineární regrese.
Na co ve výuce statistiky není čas
VŠB –TUO ATŘ Manažerská grafika Grafy v MS Excel 2003 Podešva Petr
8. Kontingenční tabulky a χ2 test
© Institut biostatistiky a analýz INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ ANALÝZA A KLASIFIKACE DAT prof. Ing. Jiří Holčík, CSc.
Biostatistika 8. přednáška
Biostatistika 1. přednáška Aneta Hybšová
Marketingový průzkum Milan Mrázek Matematika & Business
PSY717 – statistická analýza dat
Jak statistika dokazuje závislost
Kontingenční tabulky a grafy Název školyGymnázium Zlín - Lesní čtvrť Číslo projektuCZ.1.07/1.5.00/ Název projektuRozvoj žákovských.
ADDS cviceni Pavlina Kuranova. Testy pro dva nezávislé výběry Mannův Whitneyho test - Založen na Wilcoxnově statistice W - založen na pořadí jednotlivých.
Tento vzdělávací materiál vznikl v rámci projektu EU – peníze školám Název projektu : Objevujeme svět kolem nás Reg. číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/
Základy testování hypotéz
Zhoubné nádory dětí a sport Jan Novotný, Hana Hrstková*, Martina Novotná Pedagogická fakulta MU, Brno *Lékařská fakulta MU, Brno.
Postup při empirickém kvantitativním výzkumu
Paliativní péče, podpůrná péče léčba bolesti atd…
Kvalita v radiační onkologii David Feltl. Co chceme a co nechceme? Chceme správnou léčbu správnému pacientovi Nechceme stavět způsoby onkologické léčby.
Identifikace pacientů v MOÚ J. Kocourková, H. Vorlíčková, Masarykův onkologický ústav, Brno.
BIOSTATISTIKA LS 2016 Garant předmětu: Ing. Martina Litschmannová, Ph.D. Přednášející: Ing. Martina Litschmannová, Ph.D. Cvičící: Ing. Martina Litschmannová,
Ústav lékařské informatiky, 2. LF UK 2008 STATISTIKA II.
Testování hypotéz Otestujte,… Ověřte,… Prokažte,… že střední věk (tj.  ) …činí 40 let (= 40) …je alespoň 40 let (≥ 40)
… jsou bohatší lidé šťastnější?
Ukládání dat biodiverzity a jejich vizualizace
INDUKTIVNÍ STATISTIKA
Statistické testování – základní pojmy
Číslo a název projektu: CZ /1. 5
TESTOVÁNÍ STATISTICKÝCH HYPOTÉZ
METODICKÝ LIST PRO ZŠ Pro zpracování vzdělávacích materiálů (VM)v rámci projektu EU peníze školám Operační program Vzdělávání pro konkurenceschopnost   
Hodnocení závislosti STAT metody pro posouzení závislosti – jiné pro:
Úvod do induktivní statistiky
příklad: hody hrací kostkou
Školní vědecký projekt
Lineární regrese.
Metody sociologického výzkumu kvantitativní. MSV-KVANT Výuka v LS 2018
7. Kontingenční tabulky a χ2 test
Testování hypotéz - pojmy
NOMINÁLNÍ VELIČINY Odhad hodnoty pravděpodobnosti určitého jevu v základním souboru Test hodnoty pravděpodobnosti určitého jevu v základním souboru Srovnání.
Transkript prezentace:

Verifikace modelu toxicity na aktuálních onkologických datech autor: Hana Vašíčková škola: VŠB-TU Ostrava fakulta: FEI obor: Výpočetní matematika

Cíl práce Analýza dat Zodpovězení jednotlivých lékařských otázek Seznámení s praktickým využitím statistiky na konkrétních medicínských datech Spolupráce s lékaři Porozumění lékařské terminologii Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Analýza dat K dispozici 502 pacientů Data ve formě tabulek v Excelu Nesjednocený formát dat Nesjednocené označení Stejný význam různých označení Klasifikace pacientů do tříd Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Analýza dat Nesjednocený formát Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Analýza dat Nesjednocené označení Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Analýza dat Stejný význam různých označení Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Analýza dat Klasifikace pacientů do tříd Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Některé zpracovávané otázky Kolik pacientů v jednotlivých stádiích podstoupilo RAPE, LAE nebo OE? Kolik pacientů po RAPE mělo kurativní radioterapii? Kolik pacientů v jednotlivých stádiích mělo nějaký typ hormonální léčby? Jaké je procentuální zastoupení jednotlivých stupňů akutní a pozdní toxicity (UGS,GIT)? Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Terminologie RAPE - chirurgicky vyjmuta prostata LAE - odstraněny pánevní lymfatické uzliny OE - chirurgicky odstraněny varlata Kurativní rad. – snaha vyléčit i za cenu nežádoucích účinků Paliativní rad. – nevyléčitelný stav, šetrná léčba UGS – intenzita nežádoucích účinků radioterapie v močovém měchýři GIT – intenzita nežádoucích účinků radioterapie v konečníku Nádory prostaty M0 nízké stádium M1 střední stádium vysoké stádium Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Exploratorní analýza Exploratorní analýza (koláčový graf) základní graf ukazující množství pacientů, kteří podstoupili RAPE a kteří ne Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Exploratorní analýza Exploratorní analýza (Mozaikový graf) Ve skupině M0 se nevyskytují žádní pacienti, kteří podstoupili paliativní radioterapii. Za to ve skupině M1 z 21 pacientů v téhle skupině podstoupili pouze 4 radioterapii kurativní. Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Kontingenční tabulka Závislosti v kontingenční tabulce Formulace nulové a alternativní hypotézy Platí H0 / Nezamítáme H0 – Spolehlivost Platí HA / Zamítáme H0 – Síla testu možnost chyby 1. nebo 2. druhu: 1. druhu: Platí H0 / Zamítáme H0 2. druhu: Platí HA / Nezamítáme H0 Výpočet p-value p-value < 0,01 – zamítáme H0 0,01 < p-value < 0,05 - nerozhodná oblast (větší rozsah dat) p-value > 0,05 – nezamítáme H0 Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Kontingenční tabulka Závislosti v kontingenční tabulce Kontingenční tabulka závislosti podání hormonů na rizikové skupině: Volba nulové a alternativní hypotézy: H0: Podání hormonů pacientům nezávisí na rizikové skupině. HA: Podání hormonů pacientům závisí na rizikové skupině. p-value = 3,52*10^-5 <0,05, proto zamítáme nulovou hypotézu ve prospěch alternativní hypotézy NELZE TVRDIT, že podání hormonů pacientům nezávisí na rizikové skupině. Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Křivky přežití Křivky přežití Kaplan-Meierova metoda cenzorovaná data studuje čas od určitého počátečního bodu sledování do výskytu dané události dokud zbývá více než 30 pacientů Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Křivky přežití Křivky přežití Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Některé výsledky 84% pacientů bez operace vyjmutí prostaty 17 pacientů s paliativní radioterapií typ zvolené radioterapie i typ operace závisí na rizikové skupině (M0,M1) intenzita nežádoucích účinků v močovém měchýři závisí na podstoupení operace vyjmutí prostaty Nepotvrzení závislosti intenzity nežádoucích účinků v konečníku na operaci Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Vlastní přínos práce Osobní přínos: Zpracování praktických dat velkého rozsahu Seznámení se s praktickým využitím statistiky v lékařském oboru Přínos ostatním: Práce na nové zautomatizované databázi Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011

Děkuji za pozornost! Bc. Hana Vašíčková 3.1.2011