Konvergenční testy Bc. Jakub Malohlava. Simulace  Monte Carlo  výpočet souborových středních hodnot za pomocí Markovových řetězců  parallel tempering.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Statistika.
Advertisements

GENEROVÁNÍ PSEUDONÁHODNÝCH ČÍSEL
Analýza spolehlivosti tlakové nádoby metodou Monte Carlo Jakub Nedbálek Katedra Aplikované Matematiky, Fakulta Elektrotechniky a Informatiky VŠB - Technická.
1 DFT a empirické modely interakcí v Monte Carlo simulacích klastrů molekul vody Lenka Ličmanová
Lekce 7 Metoda molekulární dynamiky I Úvod KFY/PMFCHLekce 7 – Metoda molekulární dynamiky Osnova 1.Princip metody 2.Ingredience 3.Počáteční podmínky 4.Časová.
Odhady parametrů základního souboru
Hodnocení způsobilosti měřících systémů
Kalmanuv filtr pro zpracování signálů a navigaci
ENERGIE KLASTRŮ VODY ZÍSKANÁ EVOLUČNÍMI ALGORITMY
Lekce 12 Metoda Monte Carlo III Technologie (kanonický soubor)
Lekce 9 Metoda molekulární dynamiky III Technologie Osnova 1. Výpočet sil 2. Výpočet termodynamických parametrů 3. Ekvilibrizační a simulační část MD simulace.
David Kramoliš Vedoucí práce: Doc. RNDr. René Kalus, Ph.D.
Molekulová dynamika.
Optimalizace v simulačním modelování. Obecně o optimalizaci  Optimalizovat znamená maximalizovat nebo minimalizovat parametrech (např. počet obslužných.
– základní matematické operace se signály (odečty, podíly...) – složitější operace se sadou datových souborů – tvorba maker pro automatizaci zpracování.
Získávání informací Získání informací o reálném systému
Statistická mechanika - Boltzmannův distribuční zákon
Rozbory přesnosti v jednotlivých fázích vytyčení
ROVNOVÁŽNÝ STAV, VRATNÝ DĚJ, TEPELNÁ ROVNOVÁHA, TEPLOTA A JEJÍ MĚŘENÍ
CHYBY MĚŘENÍ.
Systémy pro podporu managementu 2
Autor: Boleslav Staněk H2IGE1.  Omyly  Hrubé chyby  Chyby nevyhnutelné  Chyby náhodné  Chyby systematické Rozdělení chyb.
Rozbor přesnosti vytyčení
IONIZAČNÍ POTENCIÁLY A FÁZOVÉ PŘECHODY KLASTRŮ ARGONU
STANOVENÍ NEJISTOT PŘI VÝPOŠTU KONTAMINACE ZASAŽENÉHO ÚZEMÍ
FEM model pohybu vlhkostního pole ve dřevě - rychlost navlhání dřeva
Stáž v rámci SGS, 2010 Jakub Malohlava.  Místo: VŠCHT Praha  Délka pobytu: –  Cíl: Seznámit se se MC simulacemi v makroskopických.
Fyzika 6.ročník ZŠ Fyzikální veličina D é l k a Creation IP&RK.
Optimalizace versus simulace 9.přednáška. Obecně o optimalizaci  Maximalizovat nebo minimalizovat omezujících podmínkách.  Maximalizovat nebo minimalizovat.
Metody vyrovnání nivelačních sítí
Tento výukový materiál vznikl v rámci Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost 1. KŠPA Kladno, s. r. o., Holandská 2531, Kladno,
LOGISTICKÉ SYSTÉMY /14.
1 Revidované výsledky srážek iontů Rg+ s klastry Rg3, analýza disociovaných stavů systému Rg4+, rozvoj balíku Multidis (v rámci projektu Otevřená věda.
Jedno-indexový model a určení podílů cenných papírů v portfoliu
Směsi plynů Rozdělení výpočtu plynů :
Tvorba simulačních modelů. Než vznikne model 1.Existence problému 2.Podrobnosti o problému a o systému 3.Jiné možnosti řešení ? 4.Existence podobného.
Přesnost a spolehlivost v účelových sítích Bc. Jindřich Poledňák.
Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Ing. Pavel Najman. Obchodní akademie a Střední odborná škola logistická, Opava, příspěvková.
Prezentace příkladu 6.3 FIPV1 Jana Marcelová.
Výpisky z fyziky − 6. ročník
Normální rozdělení a ověření normality dat
Monte Carlo simulace Experimentální fyzika I/3. Princip metody Problémy které nelze řešit analyticky je možné modelovat na základě statistického chování.
Výukový materiál zpracovaný v rámci projektu
Biostatistika 8. přednáška
5.4. Účinné průřezy tepelných neutronů
Optimalizace versus simulace 8.přednáška. Obecně o optimalizaci  Maximalizovat nebo minimalizovat omezujících podmínkách.  Maximalizovat nebo minimalizovat.
Hustota pravděpodobnosti – případ dvou proměnných
BioTech 2011, Strážná. O čem to bude? Stochastické simulace Diferenciální rovnice (ODR) Automaty.
Antonín Krása Školitel: RNDr. Vladimír Wagner, CSc. Produkce neutronů v tříštivých reakcích GeV protonů na tlustém olověném terči (Experiment versus.
Monte Carlo simulace hexameru vody Autor: Bc. Lenka Ličmanová Vedoucí práce: Mgr. Aleš Vítek Seminář KFY PŘF OU.
Molekulová fyzika 3. přednáška „Statistický přístup jako jediná funkční strategie kinetické teorie“
Úvod do praktické fyziky Seminář pro I.ročník F J. Englich, ZS 2003/04.
STATISTIKA 1. MOMENTY Vztah mezi momenty v rámci skupin a celku Data rozdělena do několika skupin S 1, …, S k Počty objektů v jednotlivých skupinách n.
Radovan Plocek 8.A. Stavové veličiny Izolovaná soustava Rovnovážný stav Termodynamická teplota Teplota plynu z hlediska mol. fyziky Teplotní stupnice.
Molekulová fyzika 2. Sada pomocných snímků „Teplota“
Chyby měření / nejistoty měření
Stochastické procesy a Markovovy řetězce
Molekulární dynamika vody a alkoholů
Monte Carlo Typy MC simulací
- váhy jednotlivých studií
STATISTICKÉ CHARAKTERISTIKY
Výpisky z fyziky − 6. ročník
Vytápění Teplo.
Spojitá a kategoriální data Základní popisné statistiky
DSI – Dysphonia Severity Index
Vnitřní energie plynu, ekvipartiční teorém
Statistika a výpočetní technika
Analýza kardinálních proměnných
Plánování přesnosti měření v IG Úvod – základní nástroje TCHAVP
Základy statistiky.
Transkript prezentace:

Konvergenční testy Bc. Jakub Malohlava

Simulace  Monte Carlo  výpočet souborových středních hodnot za pomocí Markovových řetězců  parallel tempering  simulace M replik současně při různých teplotách

Inicializační soubory  GLOBAL.INI  NN – Počet molekul vody v klastru  INTERACT.INI  WW_DIATOM_POTENTIAL_TYPE – 0 default, 1 TIP3P, 2 TIP4P, 3 TIP5P, 4 TIP5PA, 5 KJ  ADMIX_TYPE – Index příměsi v interakčním modelu KJ, 0 čistý klastr, 1 s příměsí  CALC_POLARIZABILITY – Výpočet polarizační energie u modelu KJ, 1 - ano  MAIN.INI  EQUILIB – Počet ekvilibrizačních kroků.  NOSS – Počet simulačních kroků.  OMIT – Počet Monte Carlo cyklů mezi vzorkováním.  RESULTS_SAVE – Četnost ukládání výsledků.  RND_SEED_VAL – 0 Začátek sekvence z náhodného čísla.  TYPE_OF_PROGRAM – 1 Během simulace je použit pouze jeden potenciál. 2 – Počátek ze souboru z přerušeného výpočtu. 3 – Výpočet multiple histogram.

 MC.INI  SWITCH_ON_MOVE - Zapnout posun molekul při simulaci, TRUE – bude docházet k posunu.  SWITCH_ON_ROT – Zapnout rotaci molekul při simulaci, TRUE – bude docházet k rotaci. Pokud tam bude cokoli jineho, rotace se vypne.  SET_RATIO – Poměr počtu přijatých konfigurací k počtu navržených konfigurací.  SET_RATIO_ROT – Poměr přijatých rotací k navrženým.  MULTI_HIST.INI  VARIANTA – 1 – Aritmetický průměr, 2 – Tsai-Jordan metoda průměrování hustoty stavu.  MULTIPLE_HISTOGRAM – 1 – Bude použita metoda multiple histogram.  ENERGY_LOW – Nejnižší hodnota energie histogramu[eV].  ENERGY_UP – Nejvyšší hodnota energie histogramu[eV].  NUM_ENERG_DEAL – Počet dílků v histogramu.  MH_DOWN_TEMPER - Dolní mez teploty, pro kterou budou počítány termodynamické veličiny.  MH_UP_TEMPER – Horní mez teploty, pro kterou budou počítány termodynamické veličiny.  NUM_MH_TEMPER – Počet teplot, pro které budou počítány Multiple Histogram veličiny.

 POL_ENERG.INI  STOP_IT – 1 – pevný počet iterací el. pole, 2 – iterování do dosažení určité přesnosti.  NMB_IT – Počet iterací pokud STOP_IT = 1.  ACCUR_IT – Požadovaná přesnost výpočtu při STOP_IT = 2.  WATER_PT.INI  NUMBER_OF_SYSTEMS – Počet systémů (tzn. počet teplot nebo energií, při kterých poběží dané simulace).  NUMBER_OF_CALC_SYSTEMS – Počet systémů, na kterých dochází k měření, musí být ≤ NUMBER_OF_SYSTEMS, vynechány jsou nejvyšší teploty.  DOWN_T_E – Spodní mez, tzn. nejnižší teplota nebo energie, při které poběží daná simulace.  UP_T_E – Horní mez, tzn. nejvyšší teplota nebo energie, při které poběží daná simulace.  NASOBEK – Míra exponenciálního rozvržení teplot systému, je rovna podílu z rozdílu dvou nejvyšších teplot a dvou nejnižších teplot.  ZEBRICEK – 0 – načte teploty ze souboru, jinak bude rozložení teplot exponenciální.  SIMUL_EXCHANGE_RAT – Pravděpodobnost navrhnuti výměny systému (výměna systému / (výměna systému + simulace systému))

Polarizační energie

Počet replik

Pravděpodobnost výměny

Děkuji za pozornost