Úvod do biomedicínské statistiky Petr Waldauf KAR, FNKV.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
MONITORING PACIENTŮ UŽÍVAJÍCÍCH ArthroStop® PLUS
Advertisements

Testování parametrických hypotéz
Ideový závěr Co si mám z přednášky odnést (+ komentáře k užití statistiky v biologii)
A5M33IZS – Informační a znalostní systémy Testování modelů.
Testování statistických hypotéz
Power analysis aneb Co to vlastně znamená P0.05 (Podle Scheiner & Gurevitch 2001: Desing and analysis of ecological experiments.
Odhady parametrů základního souboru
Cvičení 6 – 25. října 2010 Heteroskedasticita
Výpočet a interpretace ukazatelů asociace v epidemiologických studiích
Meta-analýza v epidemiologii a toxikologii
Epidemiologické přístupy v toxikologickém výzkumu
Testování hypotéz vymezení důležitých pojmů
MUDr. Michal Jurajda, PhD. ÚPF LF MU
8. listopadu 2004Statistika (D360P03Z) 6. předn.1 chování výběrového průměru nechť X 1, X 2,…,X n jsou nezávislé náhodné veličiny s libovolným rozdělením.
Lineární regresní model Statistická inference Tomáš Cahlík 4. týden.
Další spojitá rozdělení pravděpodobnosti
Test dobré shody Fisherův přesný test McNemar test
Kontingenční tabulky.
Ekonometrie „ … ekonometrie je kvantitativní ekonomická disciplína, která se zabývá především měřením v ekonomice na základě analýzy reálných statistických.
1 Studie PROMID Placebo-controlled, double blind, prospective, Randomised study on the effect of Octreotide LAR in the control of tumor growth in patients.
Odhad metodou maximální věrohodnost
ODDS RATIO Relationships between categorical variables in contingency table Jiří Šafr jiri.safr(AT)seznam.cz updated 29/12/2014 Quantitative Data Analysis.
Pohled z ptačí perspektivy
Samostatný úkol: Jednovýběrový t-test Dvouvýběrový nepárový t-test
Fitování Konstrukce křivky (funkce), která co nejlépe odpovídá naměřeným hodnotám. - může podléhat dodatečným podmínkám Lineární vs. nelineární regrese.
Základy matematické statistiky. Nechť je dána náhodná veličina X (“věk žadatele o hypotéku“) X je definována rozdělením pravděpodobností, s nimiž nastanou.
8. Kontingenční tabulky a χ2 test
Statistická významnost a její problémy
Biostatistika 8. přednáška
PSY717 – statistická analýza dat
Jak statistika dokazuje závislost
Popisná analýza v programu Statistica
1. cvičení
STATISTICKÝ ROZCESTNÍK aneb CO S DATY Martin Sebera.
Základy testování hypotéz
Mann-Whitney U-test Wilcoxonův test Znaménkový test
. Výuka pediatrie u lůžka pacienta Kazuistika založená na důkazu
POZNÁMKA: Pokud chcete změnit obrázek na tomto snímku, vyberte obrázek a odstraňte ho. Potom klikněte na ikonu Obrázek v zástupném textu a vložte vlastní.
Popisné charakteristiky statistických souborů. ZS - přesné parametry (nelze je měřením zjistit) VS - výběrové charakteristiky (slouží jako odhad skutečných.
Testování hypotéz Testování hypotéz o rozdílu průměrů  t-test pro nezávislé výběry  t-test pro závislé výběry.
Možnosti biostatistiky RNDr. Karel Hrach, Ph.D. Ústav zdravotnických studií UJEP Biomedicínský výzkum s podporou evropských zdrojů v nemocnicích ( )
Ústav lékařské informatiky, 2. LF UK 2008 STATISTIKA II.
POZNÁMKA: Pokud chcete změnit obrázek na tomto snímku, vyberte obrázek a odstraňte ho. Potom klikněte na ikonu Obrázek v zástupném textu a vložte vlastní.
Testování hypotéz Otestujte,… Ověřte,… Prokažte,… že střední věk (tj.  ) …činí 40 let (= 40) …je alespoň 40 let (≥ 40)
INDUKTIVNÍ STATISTIKA
Biostatistika Opakování – základy testování hypotéz
Statistické testování – základní pojmy
Test dobré shody Fisherův přesný test McNemar test
t-test Počítání t-testu t statistika Měření velikosti efektu
TESTOVÁNÍ STATISTICKÝCH HYPOTÉZ
- váhy jednotlivých studií
Popisná analýza v programu Statistica
Proč statistika ? Dva důvody Popis Inference
Spojitá a kategoriální data Základní popisné statistiky
Úvod do statistického testování
Hodnocení závislosti STAT metody pro posouzení závislosti – jiné pro:
Samostatný úkol: Jednovýběrový t-test Dvouvýběrový nepárový t-test
Typy proměnných Kvalitativní/kategorická binární - ano/ne
Neparametrické testy pro porovnání polohy
Interventional studies: Biologics
Interventional studies: Devices
Interventional studies: Drugs
Koncepce normality/normálnosti v medicíně
Úvod do induktivní statistiky
Statistika a výpočetní technika
Analýza kardinálních proměnných
7. Kontingenční tabulky a χ2 test
Výpočet a interpretace ukazatelů asociace v epidemiologických studiích
Základy statistiky.
Testování hypotéz - pojmy
Transkript prezentace:

Úvod do biomedicínské statistiky Petr Waldauf KAR, FNKV

Populace Průměr populace

Populace Průměry výběrů Výběr musí být náhodný x selection bias

Průměr populace Průměry výběrů

Populace Výběr musí být náhodný x selection bias

průměr výběru průměr výběru s 95% intervalem spolehlivosti 95% confidential interval (CI) = interval ve kterém se s 95% pravděpodobností nachází průměr populace Výběr musí být náhodný x selection bias průměr populace

Porovnání 2 skupin H0 = nulová hypotéza = mezi skupinama není rozdíl H1 = alternativní hypoteza = mezi skupinama je rozdíl

Porovnání 2 skupin Chyba 1.řádu = α = p = hladina významnosti = pravděpodobnost že platí H0, resp. chyba které se dopustíme pokud zamítneme p<0,05 = statisticky významný rozdíl p<0,01= statisticky velmi významný rodíl

Porovnání 2 skupin Chyba 1.řádu = α = p = hladina významnosti CAVE: statistická x klinická významnost

Porovnání 2 skupin Chyba 2.řádu = β = chyba které se dopustíme pokud nezamítneme H0, když platí H1 Power = 1 – β = síla testu, měla by být alespoň 80% a více

Porovnání 2 skupin Design studie: α < 0,05 power ≥ 0,8 jaký chce detekovat rozdíl mezi skupinami? jaký je potřeba počet pacientů?

Porovnání 2 skupin Design studie: jaký chce detekovat rozdíl mezi skupinami? d = effect size = (ø1-ø2)/ SD jedná se o vzdálenost hypotézy H0 a H1 malý 0,2- 0,3 střední okolo 0,5 (0,3-0,8) velký >0,8

Porovnání 2 skupin Design studie: jaký je potřeba počet pacientů?

Typy dat spojitá data kategorická data (ano/ne)

Spojitá data Normální = gaussovské rozložení Histogramy N = 5N = 10N = 40

Normální = gaussovské rozložení průměr, ± SD

Normální = gaussovské rozložení testování

Spojitá data Nen ormální rozložení Histogramy

Spojitá data Nen ormální rozložení nepoužívejte průměr a SD !!!! ale median a horní a dolní kvartil (25 a 75 percentil)

Maximum Minimum Dolní kvartil Horní kvartil Median Spojitá data – boxové grafy

Statistické testování hypotéz kontinuální x kategorická data kontinuální: normálně x nenormálně rozložená data nepárová x párová data 1,2 nebo více skupin

Statistické testování hypotéz výběr statistického testu

Statistické testování hypotéz příklad testů 2 nezávislé skupiny kontinuální parametr s normální distribucí nepárový Studentův t-test

Statistické testování hypotéz příklad testů 2 nezávislé skupiny kontinuální parametr s nenormální distribucí Mannův-Whitneyův test

Statistické testování hypotéz příklad testů 3 a více nezávislých skupin kontinuální parametr s normální distribucí ANOVA

Statistické testování hypotéz příklad testů Měření závislosti 2 spojité normálně rozložené parametry regresní analýza

Y X R 2 =1 Regresní analýza

Y X R 2 =0,8 Regresní analýza

Y X R 2 =0 Regresní analýza

Vztah mezi CVP a objemem krve Vztah mezi CVP a objemem krve Schopnost předpovězení CVP reakci na podání objemu Schopnost předpovězení CVP reakci na podání objemu Medline, Cochrane Library, Embace Library Medline, Cochrane Library, Embace Library Screening 213 článků, 24 studií (803 pacientů) bylo zařazeno do metaanalýzy Screening 213 článků, 24 studií (803 pacientů) bylo zařazeno do metaanalýzy

R 2 = 0,01

 Based on the results of our systematic review, we believe that CVP should no longer be routinely measured in the ICU, operating room, or emergency department. However, measurement of the CVP may be useful in select  circumstances, such as in patients who have undergone heart transplant, or in those who have suffered a right ventricular infarction or acute pulmonary embolism. In these cases, CVP may be used as a marker of right ventricular function rather than an indicator of volume status.

Logistická regrese 1 0 např.: pravděpodobnost úmrtí x pohlaví, IM, DM, věk …

Statistické testování hypotéz příklad testů 2 skupiny kategorická data -> kontingenční tabulka 2x2 chi-square test χ²

Statistické testování hypotéz příklad testů chi-square test χ² Očkování proti chřipce se zúčastnilo 460 dospělých, z nichž 240 dostalo očkovací látku proti chřipce (očkovaná skupina) a 220 dostalo placebo (kontrolní skupina). Na konci experimentu onemocnělo 100 lidí chřipkou. 20 z nich bylo z očkované skupiny a 80 z kontrolní skupiny. p<0,001

Statistické testování hypotéz příklad testů 2 skupiny kategorická data -> kontingenční tabulka 2x2 relativní riziko a poměr šancí (odds ratio)

Statistické testování hypotéz příklad testů relativní riziko Odhad relativního rizika získáme jako poměr odhadů absolutních rizik vzniku onemocnění u exponovaných a neexponovaných osob

Statistické testování hypotéz příklad testů relativní riziko (RR) 0 až ∞ důležitá je hodnota 1 = není rozdíl mezi skupinama <1 = menší riziko >1 = větší riziko opět jsou potřeba intervaly spolehlivost (95%) ke statistické významnosti je potřeba χ² test

Statistické testování hypotéz příklad testů poměr šancí (odds ratio) OR = 0,57/0,09 = 6,3

OR RR frekvence parametru

. For instance, relative risk cannot be calculated for case-control studies, as they provide no incidence data Relative risk also lacks usefulness in the event that non-occurrence of disease is of equal interest to occurrence of disease. As we have seen previously, the odds ratio gives a symmetrical result, while the relative risk does not RR - Generally, when comparing an experimental group to a control group In epidemiology class, we are typically advised to use OR for case-control study and use RR for cohort study. For cross-section studies, both OR and RR may be used.

1<1<1 >1>1 RR±CI

Meta-analýza přehledné shrnutí výsledků studií týkajících se určité problematiky a souhrnné zhodnocení údajů z jednotlivých studií 1<1<1 >1>1 RR±CI studie 1 studie 2 studie 3 studie 4 výsledek metaanalýzy

JAMA RCTs 5051 pacientů

Conclusions: In critically ill patients, use of the PAC neither increased overall mortality or days in hospital nor conferred benefit. Despite almost 20 years of RCTs, a clear strategy leading to improved survival with the PAC has not been devised. In critically ill patients, use of the PAC neither increased overall mortality or days in hospital nor conferred benefit. Despite almost 20 years of RCTs, a clear strategy leading to improved survival with the PAC has not been devised.

Klinické studie průřezová studie / cross-sectional study populace náhodný výběr exponovaní s nemocí jednorázově zjišťuje prevalenci

Klinické studie intervenční studie primární cíl (primary endpoint) sekundární cíl(cíle) (secondary endpoints) nulová/alternativní hypotéza power analýza RANDOMIZACE = eliminace zavádějících faktorů (biases) experimentální skupina kontrolní skupina (eliminace placebo efektu) zaslepení (jednoduché/dvojité)

google: euromise + učebnice

Děkuji za pozornost…