Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Orthomyxoviridae David Skupien Peter Tóth. Biologický úvod  Skupiny virů  Typy a podtypy virů chřipky  Jak vypadá a funguje virus chřipky.

Podobné prezentace


Prezentace na téma: "Orthomyxoviridae David Skupien Peter Tóth. Biologický úvod  Skupiny virů  Typy a podtypy virů chřipky  Jak vypadá a funguje virus chřipky."— Transkript prezentace:

1 Orthomyxoviridae David Skupien Peter Tóth

2 Biologický úvod  Skupiny virů  Typy a podtypy virů chřipky  Jak vypadá a funguje virus chřipky

3 Skupiny virů  Dělí se na 7 skupin (tříd) podle svého genetického materiálu  Třída I – viry s dvouvláknovou DNA  Třída II – viry s jednovláknovou DNA  Třída III – viry s dvouvláknovou RNA  Třída IV – viry s jednovláknovou RNA (tvořená mRNA je identická s genomem)  Třída V – viry s jednovláknovou RNA (tvořená mRNA je komplementární s genomem)  Třída VI – retroviry, viry s jednovláknovou RNA, ale v jejich rozmnožovacím cyklu je i stadium DNA

4 Typy chřipkových virů  Typ A  Nejobvyklejší, často mutující typ  Typ B  Typ napadající výhradně člověka (ze zvířat byl objeven pouze u tuleňů).  Nižší pravděpodobnost mutace než u typu A  Tělo si většinou po prvním nakažení udělá protilátky na delší dobu  Typ C  Typ napadající hlavně člověka a prasata  Není příliš častý a u dospělých má těžký průběh

5 Chřipka typu A  Dělí se na varianty a podtypy  Jména variant jsou nejčastěji uváděna podle druhu zvířat, které napadají (ze kterého byl odebrán vzorek)  Ptačí chřipka, prasečí, lidská, …  Podtypy  Například H1N1, H3N8,…  15 podtypů H  9 podtypů N  Dále se dělí podle stupně hrozby epidemie  LP (low pathogenic), HP (highly pathogenic)

6 Podtypy  Nejčastější typy sezonní chřipky  Zhruba od roku 2003 je u lidí dominantní H3N2  Proto se dnes H1N1 říká prasečí (je to ale zavádějící)  Například španělská chřipka byla typu H1N1

7 Jak vypadá virus chřipky?  Obsahuje 8 genů kódujících 11 proteinů  Kódované nepárovou RNA

8 Proč se vědci bojí prasečí nebo ptačí chřipky? 1/2  Chřipka typu A má obrovskou schopnost mutace  Typy chřipky (např. H1N1) definují pouze typ obalu  H = HA – hemaglutinin  N = NA – neuraminidáze  Obsah pouzdra?

9 Proč se vědci bojí prasečí nebo ptačí chřipky? 2/2  Typ obalu (hemaglutininu a neuraminidázy) určuje schopnost viru napadnout buňku (kompatibilitu s buněčnou membránou a následné vylití obsahu viru do prostoru buňky)

10 Mutace virů

11

12 Náš cíl  Vzít virus prasečí chřipky a nalézt podobnosti s jinými chřipkami  Ale!  Jak rozlišit prasečí chřipku od té klasické?

13 Metodika testování  1. Posbírat co nejvíce vzorků z celého světa  2. Porovnat s virem izolovaným z českého hostitele  Geny není třeba hledat  Každý je v kompaktním úseku RNA  Stačí je pouze přímo porovnat  Použili jsme porovnání pomocí komprese a následně vypočítali vzdálenost

14 První test 1/2  V mediích kolují zvěsti, že byl virus prasečí chřipky uměle vytvořen  Je to mix různých virů z celého světa  HA - Hemagglutinin typu 1 (nebo H1)  NA - Neuraminidáza typu 1, prasečí (N1), Evropa  PA - RNA polymeráza, ptačí, Severní Amerika  PB1 - RNA polymeráza, lidská, chřipka typu H3N2 z roku 1993  PB2 - RNA polymeráza, ptačí, Severní Amerika  NP - nukleoprotein; prasečí, Severní Amerika  M - matrix protein M1 M2; prasečí, Euroasie  NS/NEP - nestrukturovaný protein NS1; NEP Nuclear Export Protein; prasečí, Severní Amerika

15 První test 2/2  Některé podobnosti se potvrdily ale ne všechny  Odborníci testovali na mnohem větší databázi

16 Druhý test 1/2  V druhém testu jsme porovnali virus H1N1 izolovaný v České republice s různými zeměmi na celém světě  Všechny vzorky jsou z konce roku 2009

17 Druhý test 2/2  Drobné mutace, žádné razantní odlišnosti  Rusko má nejodlišnější variantu od té naší


Stáhnout ppt "Orthomyxoviridae David Skupien Peter Tóth. Biologický úvod  Skupiny virů  Typy a podtypy virů chřipky  Jak vypadá a funguje virus chřipky."

Podobné prezentace


Reklamy Google