Základy molekulární taxonomie J.Flegr, Praha 2008.

Prezentace na téma: "Základy molekulární taxonomie J.Flegr, Praha 2008."— Transkript prezentace:

1 Základy molekulární taxonomie J.Flegr, Praha 2008

2 Obsah kurzu  Co je to molekulární taxonomie  Zvláštnosti molekulárních znaků  Základní metodické přístupy  Metody získávání experimentálních dat  Metody zpracovávání dat  Biologická interpretace

3 Molekulárně biologické techniky  Hybridizace DNA  Sekvenování DNA  Restrikční mapování  Restriktáza fingerprinting  PCR fingerprinting  Mikrosatelity  Imunologické techniky  Alozymová analýza  jiné techniky (obsah/struktura genomu)

4 Zpracovávání dat  Výpočet genetických vzdáleností  Konstrukce fylogenetických stromů  na základě distančních dat  na základě znakových dat  Datování štěpných událostí  Stanovování spolehlivosti fylogenetických stromů  Testování konkordance kladogeneze a anageneze

5 Studijní materiály  Flegr J. Evoluční biologie, Academia 2005. Kapitoly: IX.Evoluce sekvence DNA, XXIV. Molekulární fylogenetika.  Syllabus  Slovník nejdůležitějších termínů  Obrazové prezentace  Audionahrávky  http://www.natur.cuni.cz/~flegr/moltaxmater.php

6 Doporučená literatura  Avise J.C. Molecular markers, natural history and evolution. Chapman & Hall, 1993  Hillis D.M. & spol. Molecular systematics. Sinauer Associates, Inc. 1996  Li W.-H. Molecular evolution. Sinauer Associates, Inc. 1997  Page DR.D.M. Holmes E.C. Molecular Evolution. A phylologenetic approach. Blackwell Science 1998  Graur D. & Li W.-H. Fundamentals of molecular evolution. Sinauer Associates, Inc. 1999  Nei M. & Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics. Oxford Univ. Press, 2000  Hall, B.G. Phylogenetic trees made easy. A How-To manual for molecular biologist. Sinauer Associates, Inc. 2001  Flegr J. Evoluční biologie. Academia 2005