Odborný poradce: Prof. MUDr.V. Mihál, CSc. Doktorský studijní program 2013/2014 Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci PRÁCE S LITERÁRNÍMI DATABÁZEMI.

Prezentace na téma: "Odborný poradce: Prof. MUDr.V. Mihál, CSc. Doktorský studijní program 2013/2014 Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci PRÁCE S LITERÁRNÍMI DATABÁZEMI."— Transkript prezentace:

1 Odborný poradce: Prof. MUDr.V. Mihál, CSc. Doktorský studijní program 2013/2014 Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci PRÁCE S LITERÁRNÍMI DATABÁZEMI Aktualizace leden 2014 Garant kurzu: Mgr. J. Potomková, Ph.D. jarmila.potomkova@upol.cz Oborová knihovna LF UP v Olomouci & Ústav lékařské biofyziky Odborný poradce: Prof. MUDr.V. Mihál, CSc. Dětská klinika LF UP v Olomouci E-learningové materiály http://biomedicina.upol.cz/moodle http://biomedicina.upol.cz/moodle

2 Struktura kurzu Úvod –Kontakty –Internetové adresy –Elektronické informační zdroje na UP v Olomouci Vzdálený přístup Klinický případ, f ormulace informační otázky Multizdrojové vyhledávání online –Výklad –Interaktivní cvičení. Diskuze, dotazy – průběžně Závěr – zápočet.

3 Kontakty Mgr. Jarmila Potomková, Ph.D. Vedoucí Oborové knihovny Lékařské fakulty UP v Olomouci Odb. as. Ústavu lékařské biofyziky jarmila.potomkova@upol.cz Prof. MUDr. Vladimír Mihál, CSc. Přednosta Dětské kliniky LF UP a FN Olomouc mihalv@fnol.cz Oborová knihovna Lékařské fakulty UP v Olomouci http://www.lf.upol.cz http://www.lf.upol.cz -- Knihovna Portál DSP „QAKOM“ http://biomedicina.upol.cz/moodle http://biomedicina.upol.cz/moodle -- Kurzy

4 Doporučujeme: internetové adresy Knihovna Univerzity Palackého v Olomouci http://knihovna.upol.cz http://knihovna.upol.cz Katalog; Součásti knihovny / Oborová knihovna LF Vědecká knihovna Olomouc http://www.vkol.cz Od 1.1.2005 lze jako čtenářský průkaz v knihovně používat identifikační kartu Univerzity Palackého v Olomouci. Aktivaci karty lze provést ve volném výběru knihovny (­­1. patro).­­1. patro Případné dotazy směrujte na ­­is@vkol.cz. Národní lékařská knihovna Praha http://www.nlk.czhttp://www.nlk.cz – Kmpletní informace http://www.medvik.czhttp://www.medvik.cz – Portál MEDVIK http://www.medvik.cz/bmchttp://www.medvik.cz/bmc – Česká lékařská bibliografie BMČ National Library of Medicine (USA) http://www.locatorplus.govhttp://www.locatorplus.gov – Katalog knih http://www.pubmed.govhttp://www.pubmed.gov – Databáze MEDLINE Mezinárodní souborný katalog publikací http://www.worldcat.com Internetové vyhledávače Google http://www.google.comhttp://www.google.com - Všeobecný vyhledávač http://www.scholar.google.comhttp://www.scholar.google.com - Vyhledávač odborných článků http://books.google.comhttp://books.google.com - Vyhledávač knih s dílčím fulltextovým náhledem

5 Elektronické informační zdroje (EIZ) na UP v Olomouci Přehled podle abecedy, fakult, oborů http://ezdroje.upol.cz/ezdroje / Lékařské databáze http://www.lf.upol.cz/http://www.lf.upol.cz/ Knihovna LF Databáze –Volně dostupné (PubMed http://www.pubmed.gov) –V počítačové síti UP v Olomouci (Dynamed http://search.epnet.com)http://search.epnet.com FN Olomouc (Uptodate http://www.uptodate.com/online)http://www.uptodate.com/online –Vzdálený přístup VPN Shibboleth / eduID Heslo

6 Vzdálený přístup k licencovaným EIZ 1. VPN - Virtual Private Network Navigace: http://portal.upol.cz Návody a nápovědy Počítačová síť UP Přístup do počítačové sítě UP prostřednictvím VPN 2. EduID – Česká akademická federace identit http://eduid.czhttp://eduid.cz dříve Shibboleth více na: http://knihovna.nkp.cz/knihovna91/pavlik.htmhttp://knihovna.nkp.cz/knihovna91/pavlik.htm Navigace pro ověření vlastní identity: http://portal.upol.czhttp://portal.upol.cz --- Kontakty – UPOL hledání studentů Username: portálové ID Password: rodné číslo bez lomítka, pokud jste je nezměnili na jiné heslo.

7 Klinický případ Formulace informační otázky

8 Klinický případ (autor: V. Mihál) Chlapec, 2 roky Zánět středního ucha (otitis media); Horečka, bolest ucha, nespal celou noc; Matka přichází do ordinace PLDD; Farmakologická anamnéza antibiotika v posledním půlroku neguje; pneumokoková vakcína nebyla Matka chce vědět, zda antibiotická léčba je doporučována okamžitě?

9 Informační otázka Formát PICO Patient (pacient/problém/populace – Otitis media u dětí mladších 2 let Intervention (intervence/expozice) – Okamžitá antibiotická léčba (např. amoxicilin) Comparison (srovnání intervencí) – Placebo; observace Outcome (výsledek) – Účinnost zvolené intervence

10 Odborná terminologie P Otitis media Middle ear inflammation Middle ear infection(s) I Antibiotic(s) Antimicrobial Wait/Watch and see Otitis media Otitida Zánět středního ucha Zánět středouší Středoušní zánět Antibiotika Observace

11 Co je to otitis media? Velký lékařský slovník http://lekarske.slovniky.czhttp://lekarske.slovniky.cz/ Merck Manual of Diagnosis and Therapy http://www.merckmanuals.com http://www.merckmanuals.com Vybrat: MMDT Hledat: otitis media

12 Kde vyhledávat?

13 Elektronické knihovní katalogy Odborné databáze pro medicínu a zdravotnictví : výběr

14 Elektronické knihovní katalogy (1) Národní lékařská knihovna Praha/Medvik Navigace a funkce: Prohledej Medvik/ Rozšířené Heslo MeSH: otitis media Hledat Datum vydání/ sestupně Vybrané do schránky Schránka / Text / Zobrazit ? MeSH = Medical Subject Headings Řízený slovník tezaurového typu http://www.medvik.cz

15 Elektronické knihovní katalogy (2) National Library of Medicine (USA)/LocatorPlus Navigace a funkce: LocatorPlus / Find Books …. Advanced Menu Search otitis media phrase/Title AND antibiotic antibiotics any of these/Title Search Sort results /Publish date descending Detailed view Ctrl+F/otitis/Hledej http://www.locatorplus.gov

16 Elektronické knihovní katalogy (3) Mezinárodní katalog Worldcat Navigace a funkce: Advanced search Title/ otitis media Keyword/ antibiotics Year/ 2000-2014 Content/ Thesis/Dissertation Search http://www.worldcat.org

17 Elektronické knihovní katalogy (4) Projekt Google Books Navigace a funkce: Hledat knihy: otitis media antibiotics Rozšířené vyhledávání S přesnou frází/ acute otitis media Alespoň s jedním/ antibiotic antibiotics amoxicillin O této knize – bibliografické údaje http://books.google.com

18 Internetové zdroje Rozmanitost forem, obsahu a kvality

19 Kvalita zdravotnických webových stránek eEurope 2002: Quality Criteria for Health related Websites Communication from the Commission to the Council, the European Parliament, the Economic and Social Committee and the Committee of the Regions Dokument volně dostupný online

20 Kvalita zdravotnických webových stránek Základní kritéria Transparentnost obsahu, důvody pro zveřejnění, příp. zdroje financování; Autorství obsahu včetně citací použitých informačních zdrojů; Ochrana pacientských dat; Aktualizace obsahu; Zajištění validity a spolehlivosti pacientských informací; Technická podpora přístupu k informacím s ohledem na cílovou skupinu.

21 INTERNET Nástroje „hlubokého webu “ Navigace a funkce: Rozšířené vyhledávání služby Scholar Fráze: otitis media Alespoň jedno slovo: antibiotic antibiotics amoxicillin Výskyt: v názvu článku Datum: 2000-2014 http://www.scholar.google.com Jen články z časopisů Různé verze Citační ohlasy

22 Odborné databáze pro medicínu a zdravotnictví: výběr MEDLINE/PubMed Mezinárodní článková bibliografie Volný přístup Navigace do fulltextů BMČ – Bibliographia Medica Čechoslovaca článková bibliografie českých/slovenských autorů Volný přístup Tvorba digitální knihovny fulltextů DynaMed Synoptická databáze Přístup v síti LF UP v Olomouci/VPN/heslo UpToDate Syntetická/znalostní databáze Přístup v síti LF UP a FN Olomouc/VPN

23 MEDLINE/PubMed http://www.pubmed.gov Advanced Search

24 MEDLINE/PubMed „ Zlatý standard“ pro medicínu a zdravotnictví Bibliografické citace a autorské souhrny >5000 časopisů publikovaných v USA a 80 dalších zemích 23 mil. přes 23 mil. záznamů od r. 1950 Většina záznamů z anglicky psaných zdrojů (nebo s anglickým abstraktem) MEDLINE na platformě PubMed www.pubmed.govwww.pubmed.gov originálním obsahem je citace + abstrakt plné texty dokumentů jsou poskytovány hypertextově od nakladatelů (LinkOut – More Resources) Přístup k citacím + abstraktům zdarma Plné texty zdarma licence absence

25 Booleovské operátory Symbolicky vyjadřují vztahy mezi pojmy AND, OR, NOT Dokumenty obsahují alespoň dva (nebo více) z hledaných terminů  otitis media AND antibiotics Dokumenty obsahují některý (nebo všechny) z hledaných termínů.  otitis media OR middle ear inflammation Vylučuje daný termín  otitis media NOT surgery

26 PubMed: postup vyhledávání Navigace: http://www.pubmed.gov --- Advancedhttp://www.pubmed.gov Search Builder (příprava) Booleovské operátory OR (a/nebo), AND(a), NOT(ne) Pravostranné rozšíření * (odvozená slova) Krok #1 Title: otitis media (výskyt termínů v názvu) OR Title/abstract: middle ear inflammation (výskyt termínů v názvu anebo abstraktu) Add to History (vyhledání + archivace postupu) Krok #2 Title: antibiotic*(výskyt termínu v názvu) OR Title/abstract: antimicrobial* (výskyt termínu v názvu anebo abstraktu) Add to History (vyhledání + archivace postupu) Krok #3 History #1 AND #2 (kombinace množin) Search Show additional filters: Ages – Show: Infant birth-23 months

27 PubMed : Práce s citacemi Summary (citace) Abstract –Related articles –Send to : File (uložení) E-mail (požadavek do knihovny) –Article types, MeSH Terms (Medical Subject Headings – tezaurus) Typologie dokumentů Deskriptory obsahu článku –Linkout – more resources Přístup do plných textů –Free fulltext –Poskytovatelé (licence, předplatné)

28 Funkce Send to == Email Pole Additional text musí být vyplněno (kontakt na odesílatele, zpráva pro adresáta). Jinak je zásilka anonymní.

29 BMČ – Bibliographia Medica Čechoslovaca http://www.medvik.cz/bmc Pokročilé hledání

30 BMČ Navigace: http://www.medvik.cz/bmc --- Pokročilé hledáníhttp://www.medvik.cz/bmc Booleovské operátory OR (a/nebo), AND(a), NOT(ne) Pravostranné rozšíření * (odvozená slova) Krok #1 otiti* OR zánět* střed* /Název Krok #2 antibiotik* /Kdekoliv Krok #3 Kombinovat AND

31 Syntetické a znalostní databáze pro medicínu založenou na důkazu (evidence based medicine – EBM) DynaMed UpToDate

32 Navigace a funkce http://search.epnet.com Počítačová síť LF UP v Olomouci + vzdálený přístup (VPN nebo heslo na vyžádání jarmila.potomkova@upol.cz) jarmila.potomkova@upol.cz Vyhledávání: otitis media antibiotics Search Výsledek Strukturovaný synoptický dokument na základě analýzy a hodnocení publikovaných studií + citace/PubMed + plné texty Vyhledávání klíčových slov uvnitř dokumentu Search within text Značky kvality  „Levels of evidence“ – úrovně důkazu  References including reviews and guidelines

33 Výsledek : Acute otitis media (AOM) Treatment overview

34 Navigace a funkce Přístup - http://www.uptodate.com/onlinehttp://www.uptodate.com/online V síti LF UP v Olomouci V síti FN Olomouc VPN – vzdálený přístup Přehledy založené na důkazu (tj. aktuálních literárních pramenech po jejich kritické interpretaci) Asi 8000 tématAsi 8000 témat (specifické otázky) 14 lékařských oborů 80 000 stran (text, grafika, prolinkování na abstrakta PubMedu) 260 000 literárních citací Léková databáze Aktualizace 4x ročně

35 New Search: otitis media antibiotics Search

36 Výsledek: Acute otitis media in children: TreatmentAcute otitis media in children: Treatment

37 Doporučení a odpověď na informační otázku Summary and Recommendations The choice of initial treatment with antibiotics or observation depends upon the age of the child and the laterality and severity of illness: We recommend that children with AOM who are <6 months be treated with antibiotics We suggest that children with AOM who are between six months and two years be treated with antibiotics ATD. Chlapec, 2 roky, akutní zánět středního ucha

38 Diskuze a závěr Dotazy Zápočet