8 Evoluce 2015 signály a znaky

Ecological differentiation in recombining microbial populations. (A) Example genealogy of neutral marker genes sampled from the population(s) at different times. (B) Underlying model of ecological differentiation. Thin gray or black arrows represent recombination within or between ecologically associated populations. Thick colored arrows represent acquisition of adaptive alleles for red or green habitats. Shapiro et al. Science 2012: 336, 48-51

Global tree of eukaryotes from a consensus of phylogenetic evidence (in particular, phylogenomics), rare genomic signatures, and morphological characteristics. Fabien Burki Cold Spring Harb Perspect Biol 2014;6:a ©2014 by Cold Spring Harbor Laboratory Press

Bhattacharya BioEssays 26, 50, 2003

Signál (zpráva) Rozpoznatelný na pozadí světlušky svítí či blikají v noci uschlý list v pamětníku Není to potrava hormony, feromony atd. jsou deriváty metabolitů (acetylcholin, adrenalin, trijodtyronin) anebo krátké peptidy. Představují ale „slepou“ větev metabolických drah – nelze je použít k syntézám dalších látek ani nejsou potravou

Quorum

Vlastnosti zprávy Rámcové sdělení – jsem zpráva láhev na pláži se svitkem papíru uvnitř Vnější sdělení – dekóduj tak a tak příjemce nějak pozná, že sdělení je napsáno japonsky a sežene Japonce, který umí česky Vnitřní sdělení - sama zpráva co se vlastně sděluje

Předpoklady rozpoznání signálu Příjem (tj. rozpoznání na pozadí) receptor s vysokou afinitou k signálu (fotonu, hormonu, zvuku apod.) Zesílení signálu, „přepis“ do jiného média „druhý posel“, sprška akčních potenciálů putujících axonem, „signální částice“ apod. Včasná likvidace signálu, aby se prostředí nezahltilo synapse – likvidace mediátoru umožní příjem dalšího signálu z presynaptického vlákna cAMP fosfodiesteráza

Způsoby signalizace Množství (koncentrace) – „analogový“ signál pH, teplota, zasolení Průběh – analogový signál stejná délka dne v dubnu a září – jiné vyhodnocení gradient morfogenu Poměr metabolity Sled impulzů – „digitální“ signál

poměr

Prahy citlivosti, poměry

Receptor – 3 fáze fungování Neobsazený a připravený vázat ligand Obsazený ligandem Neobsazený, necitlivý k ligandu (refrakterní), tj. neschopný vázat ligand časové konstanty jednotlivých fází, jejich nastavitelnost senzitizace / desenzitizace receptoru digitalizace analogových signálů

„Umělé“ mutace

...auagaacucuua... …VASEIQIECL…...auagaacucaua... …VASEIQIECI…

ARTKQ TARKS TGGKA PRKQL ATKAA RKSA AρTκQ TARασ TGGKA PRKQL ATKAA RμSA ARTλQ TARKS TGGKA πRKQL ATKAA RKSA ARTμQ TARλS TGGKA PRKQL AτKAA RλSA ARTKQ TARKσ TGGKA PρKQL ATKAA RKSA ARTαQ TARηS TGGKA ωRKQL ATKAA RμSA