NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH Náhodný výběr gamet z genofondu:

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
AUTOR: Ing. Helena Zapletalová
Advertisements

metody založené na specifické kombinační návaznosti (tj
Statistické metody pro testování asociace genů a nemocí
Teorie selekce.
KINETICKÁ TEORIE STAVBY LÁTEK.
Vliv společenského altruismu na globální lidský genofond Jan Kollár SBE.
Mgr. Iva Martincová UBO AVČR v.v.i. Studenec Masarykova univerzita
Genetické algoritmy [GA]
POPULAČNÍ GENETIKA 6 faktory narušující rovnováhu populací
Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Třídění umělé selekce podle způsobů provádění;
Hardy – Weibergův zákon
Stránky o genetice Testy z genetiky
Genetika populací, rodokmen
Teoretické základy šlechtění lesních dřevin Milan Lstibůrek 2005.
Péče o biodiverzitu Jan Plesník Agentura ochrany přírody a krajiny ČR Praha
Autor: Mgr. Tomáš Hasík Určení: Septima, III.G
STRUKTURA POPULACE: SYSTÉM PÁROVÁNÍ GAMET.
Populační genetika je teoretickým základem šlechtění hospodářských zvířat; umožňuje sledování frekvencí genů a genotypů a tím i cílevědomé řízení změn.
Mikroevoluce a makroevoluce 2014
Dědičnost základní zákonitosti.
Genetická diverzita hospodářských zvířat
Genetické algoritmy [GA]. Historie:  1960: I. Rechenberg – první odborná práce na toto téma „Evolution strategies“  1975: John Holland – první genetický.
1. KINEMATIKA HMOTNÝCH BODŮ
Další spojitá rozdělení pravděpodobnosti
Genetická variabilita populací  Pacient je obrazem rodiny a následně populace, ke které patří  Distribuci genů v populaci, a to jak jsou četnosti genů.
Populační genetika.
Populační genetika.
HW – nekonečná populace  omezená velikost populace  vyšší IBD (autozygotnost)  zvyšující se rozptyl frekvencí alel mezi démy v čase  fixace/extinkce.
METAPOPULACE… Pavel Sova.
Genetika populací kvalitativních znaků
Přesnost a spolehlivost v účelových sítích Bc. Jindřich Poledňák.
Mutace.
Evoluční a koevoluční procesy
Základní evoluční mechanismy
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
 VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI = nejdůležitější mikroevoluční
Digitální výukový materiál zpracovaný v rámci projektu „EU peníze školám“ Projekt:CZ.1.07/1.5.00/ „SŠHL Frýdlant.moderní školy“ Škola:Střední škola.
Ochrana rostlinného a živočišného genofondu
Ekologie malých populací Jakub Těšitel. Malé populace # stochastická (náhodně podmíněná) dynamika # velké odchylky od Hardy-Weinbergovské rovnováhy #
HW model: jedna zcela izolovaná populace  populace často rozděleny do subpopulací genetická výměna mezi lokálními populacemi = tok genů (gene flow) A.
Genový tok a evoluční tahy
Příklady z populační genetiky
2014 Výukový materiál MB Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Populační genetika Fenotypy, genotypy RNDr Z.Polívková
Evoluce Celá biologie dává smysl jedině ve světle evoluce.
INTEGROVANÝ VĚDNÍ ZÁKLAD 2 ŽIVOT - OBECNÉ VLASTNOSTI (III.) (ROZMNOŽOVÁNÍ základy genetiky) Ing. Helena Jedličková.
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Populace a krevní skupiny Autor: Mgr. Jitka MaškováDatum: Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Vazba genů – teoretický základ Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/7 Šablona: III/2 Inovace a zkvalitnění.
Genetika populací Doc. Ing. Karel Mach, Csc.. Genetika populací Populace = každá větší skupina organismů (rostlin, zvířat,…) stejného původu (rozšířená.
Šlechtění hospodářských zvířat Doc. Ing. Karel Mach, CSc.
Druhová rozmanitost přírody Obecné principy druhové rozmanitosti a role člověka ve světle genetické, ekosystémové a druhové biodiverzity Podpořeno grantem.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – teoretický základ Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10 /13 Šablona: III/2 Inovace.
Tepelný pohyb částic VY_32_INOVACE_11_212
TOK GENŮ.
Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE 1 2  G  
NENÁHODNÉ PÁROVÁNÍ GAMET
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE.
PŘÍRODNÍ VÝBĚR (SELEKCE)
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE 1 2  G  
Evoluční hledisko v sociální psychologii
Mutace.
Názory na vznik života Kreační teorie = náboženské
DRIFT II.
PŘÍRODNÍ VÝBĚR (SELEKCE)
Transkript prezentace:

NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH Náhodný výběr gamet z genofondu:

Drift v každé generaci nový výběr  pro každý dém nové binomické rozdělení + původní hodnota p Závěr 1: DIVERGENCE původně podobných populací

107 populací D. melanogaster poč. = 16 HZ jedinců bw75/bw (brown eyes) v každé generaci náhodně 8 samců a 8 samic 19 generací Drift

Drift a velikost populace Závěr 3: Drift způsobuje ZTRÁTU PROMĚNLIVOSTI v populaci. Závěr 2: Konečným výsledkem driftu je buď FIXACE, nebo EXTINKCE alely

Drift Drift a velikost populace Závěr 4: PRAVDĚPODOBNOST FIXACE alely v generaci t je rovna její frekvenci v generaci t. Závěr 5: PRAVDĚPODOBNOST FIXACE nově vzniklé alely tím vyšší, čím je populace menší. Doba fixace = průměrně 4N generací Závěr 6: Čím menší populace, tím kratší doba fixace alely.

Drift Doba fixace: t = 4N e Efektivní velikost populace Efektivní velikost populace

Drift Drift a migrace Drift a mutace

Drift BOTTLENECK

Drift VZTAH DRIFTU A SELEKCE Adaptivní krajina TEORIE PŘESUNUJÍCÍ SE ROVNOVÁHY Shifting Balance Theory (SBT) Sewall Wright TEORIE PŘESUNUJÍCÍ SE ROVNOVÁHY Shifting Balance Theory (SBT) Sewall Wright

Drift TEORIE PŘESUNUJÍCÍ SE ROVNOVÁHY Shifting Balance Theory (SBT) TEORIE PŘESUNUJÍCÍ SE ROVNOVÁHY Shifting Balance Theory (SBT) Pojem adaptivní krajiny má 2 vzájemně nekompatibilní významy: 1.Pole kombinací alel: hodnota fitness přiřazena genotypu  N genotypů  N + 1 dimenzí  diskontinuální povrch, populace = shluk bodů 2.Pole průměrných frekvencí alel  počet dimenzí = počet sad alelových frekvencí  kontinuální povrch Pojem adaptivní krajiny má 2 vzájemně nekompatibilní významy: 1.Pole kombinací alel: hodnota fitness přiřazena genotypu  N genotypů  N + 1 dimenzí  diskontinuální povrch, populace = shluk bodů 2.Pole průměrných frekvencí alel  počet dimenzí = počet sad alelových frekvencí  kontinuální povrch Předpoklady: prostředí se mění  populace v neustálém pohybu mutace  nové rozměry, nové cesty vzhůru malé populace (drift)  možnost sestupu do adaptivního údolí Předpoklady: prostředí se mění  populace v neustálém pohybu mutace  nové rozměry, nové cesty vzhůru malé populace (drift)  možnost sestupu do adaptivního údolí

Drift 3 fáze Wrightovy SBT teorie: Fáze I.:dočasné snížení fitness vlivem driftu v lokální populaci  možnost přiblížení do oblasti atrakce vyššího vrcholu Fáze II.: intradémová selekce  „tažení“ dému směrem k novému vrcholu Fáze III.: interdémová selekce  šíření příslušníků dému na vyšším vrcholu do ostatních démů Fáze I.:dočasné snížení fitness vlivem driftu v lokální populaci  možnost přiblížení do oblasti atrakce vyššího vrcholu Fáze II.: intradémová selekce  „tažení“ dému směrem k novému vrcholu Fáze III.: interdémová selekce  šíření příslušníků dému na vyšším vrcholu do ostatních démů Celý proces viděn jako vychylování rovnováhy mezi driftem, intradémovou a interdémovou selekcí Celý proces viděn jako vychylování rovnováhy mezi driftem, intradémovou a interdémovou selekcí

Drift 2 pohledy na evoluci v populacích: Wright Fisher malé lokální populacevelké panmiktické populace kombinace selekce, driftu a migracemutace a selekce epistáze, pleiotropie,aditivní účinky genů, závislost účinků alel na kontextuúčinky alel nezávislé na kontextu speciace jako vedlejší produktdisruptivní nebo lokálně divergentní lokálních adaptací v epistatickýchselekce systémech malé lokální populacevelké panmiktické populace kombinace selekce, driftu a migracemutace a selekce epistáze, pleiotropie,aditivní účinky genů, závislost účinků alel na kontextuúčinky alel nezávislé na kontextu speciace jako vedlejší produktdisruptivní nebo lokálně divergentní lokálních adaptací v epistatickýchselekce systémech