URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Studium lidského genomu
Advertisements

Poznámky identifikaci SNP
Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,
Detekce proteinů na preparátech Histochemie. Metody detekce – vazba cílového proteinu Imunologické; primární protilátky sekundární protilátky Imunologické;
Nově syntetizovaný řetězec DNA
Replikace DNA Milada Roštejnská Helena Klímová
Real-time PCR - princip
Fingerprinting techniky
PCR - polymerase chain reaction -polymerázová řetězová reakce
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,
Polymorfizmy detekované speciálními metodami s vysokou rozlišovací schopností Stanovení jednonukleotidových polymorfizmů (Single Nucleotide Polymorphisms.
Molekulární genetika.
Sekvencování Sangerova metoda - dideoxyterminátory O PPP H OH H OH H H 5´ 3´ NTP N N N N NH 2 O PPP H H H OH H H 5´ 3´ dNTP N N N N NH 2 O PPP H H H H.
SMAMII-6b Amplifikační metody.
RNA diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A. , Kadlecová J
Sekvenování.
F.I.S.H. hotovo.
DNA diagnostika syndromu
Milada Teplá, Helena Klímová
Polymorfismus lidské DNA.
MLPA MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION
Metoda SDA strand displacement amplification
Vývoj mikrosatelitních markerů (SSR) KBO/125 Jiří Košnar, katedra botaniky PřF JU, 2012 Kurz byl financován z projektu FRVŠ 1904/2012.
Analýza mutace C282Y v genu pro hemochromatózu
PCR Polymerase Chain Reaction
DNA diagnostika II..
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“
Cystická fibrosa.
Historie a metody genomiky
Vyšetřovací metody v molekulární biologii
Matúš Mihalčin Ayoub Amleh Khaled M. Alhibeedi
Praktikum z genetiky rostlin JS Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana Genetické mapování genu odolnosti k padlí.
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
Diagnostické amplifikační metody nevyužívající PCR
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
DNA diagnostika a principy základních metod molekulární biologie
Párováni bazí, hybridizace a denaturace DNA/RNA hraje důležitou roli v přírodě i aplikacích: - struktura DNA a duplikace genetické informace - transkripce.
Molekulární biotechnologie č.10a Využití poznatků molekulární biotechnologie. Molekulární diagnostika.
SMAMII-8 Detekce polymorfismů v genomech. Metody molekulární diagnostiky Se zaměřují na vyhledávání rozdílů v sekvencích DNA a Identifikaci polymorfismů.
Ligázová řetězová reakce
RNA savčí buňka: pg celkové RNA rRNA (28S,18S, 5S) 80-85% tRNA, snRNA 15-20% mRNA 1-5% mRNA molekul/buňku, tj rozdílných transkriptů.
Biotechnologie, technologie budoucnosti Aleš Eichmeier.
SEKVENOVÁNÍ DNA. Jedna z metod studia genů Využití v aplikovaných oblastech molekulární biologie – např. medicíně při diagnostice genetických chorob.
PRŮKAZ NUKLEOVÉ KYSELINY Lékařská mikrobiologie – cvičení, jarní semestr 2016 Mikrobiologický ústav LF MU
Environmentální aplikace molekulární biologie
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
Masivně paralelní sekvenování
Manipulace s DNA Manipulace s proteiny Analýza genové exprese
Metodologie molekulární fylogeneze a taxonomie hmyzu
Bi5130 Základy práce s lidskou aDNA
Praktikum izolace mikrosatelitů a
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
Bi5130 Základy práce s lidskou aDNA
RT – PCR: návrh primerů.
Bi5130 Základy práce s lidskou aDNA
Moderní metody analýzy genomu Čipové technologie I
SMAMII Amplifikační metody.
PŘEHLED AMINOKYSELIN Cys Gly Lys Trp Met Ala Arg Phe Asp Val His Glu
Užití fragmentové analýzy a multiplex PCR s vícebarevným fluorescenčním značením k detekci nejčastějších mutací u dědičných neuropatií (HMSN). P. Seeman,
„Next-Gen“ Sequencing
Metagenomika Úvod Petra Vídeňská, Ph.D..
Sekvencování DNA.
Polymerase chain reaction Polymerázová řetězová rekce
FRAGMENTAČNÍ ANALÝZA Eva Paděrová.
Studium lidského genomu
Dominika verešová Kateřina Sapáková
1. Regulace genové exprese:
Replikace DNA Milada Roštejnská Helena Klímová
18b-Metody studia nukleových kyselin
Transkript prezentace:

URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE Úloha č. 5 URČENÍ BAKTÉRIE RODU BORRELIA POMOCÍ DNA SEKVENACE

SEKVENACE DNA sekvenační techniky: 1977 Maxam-Gilbertova metoda 1980 Sangerova metoda automatizovaná varianta metody nové generace pyrosekvenování, SOLID, SOLEXA

SANGEROVA METODA DNA polymerasa 2‘-deoxynukleosidtrifosfáty (dNTP) primer 2‘,3‘-dideoxynukleosidtrifosfáty (ddNTP)

SANGEROVA METODA využití ddNTP

SANGEROVA METODA průběh a detekce

AUTOMATIZOVANÁ VARIANTA varianta enzymatického sekvenování DNA amplifikace DNA na termocykléru (PCR) a elektroforetická separace fragmentů na sekvenátoru syntéza DNA probíhá v jedné reakci značení a detekce: ddNTP čtyři různé fluorescenční značky produkty se liší o 1 bázi

Genetický analyzátor ABI 3130

DETEKCE PRODUKTŮ

POSTUP přečištění ExoSAP sekvenační reakce přečištění magnetickými kuličkami sekvenace vyhodnocení výsledků a určení druhu borrelie