Energetický metabolismus

Rychlost metabolismu protist Měřeno spotřebou kyslíku Roste s velikostí buňky, ale ne přímo úměrně. Fenchel, Respiration in aquatic ecosystems 2005

Rychlost metabolismu protist Velmi závisí na fyziologickém stavu buňky. Hladovějící buňky se zmenší a jejich metabolismus se výrazně zpomalí.

Glykolýza (EMP dráha) – oxymonády + Trimastix pyrofosfát-fruktósa 6-fosfát fosfotransferáza PPi PPi pyruvát ortofosfát dikináza Liapounova a kol. 2006, Stechmann a kol. 2006

Glykolýza (EMP dráha) – rozsivky a oomycéty Nakayama a kol. 2012

Glykolýza – mitochondriální lokalizace Nakayama a kol. 2012

Glykolýza – mitochondriální lokalizace Některé glykolytické enzymy byly nalezeny v proteomu mitochondriální frakce tetrahymeny Smith DGS a kol. 2007, J Mol Evol

Glykolýza – mitochondriální lokalizace Kroth a kol. 2008 Glykolýza u Phaeodactylum tricornutum

Glykolýza (EMP dráha) – Kinetoplastida GLYKOSOM

Glykosom Glykosom Proč kompartmentalizace glykolýzy? Efektivnější průběh nebo lepší regulace Haanstra a kol. 2008, PNAS

Glykosom Biochemické procesy a proteinové složení glycosomu doznává určitých změn při transformaci trypanosomy brucei z krevního stadia na stadium v přenašeči. PEP se vrací do glycosomu Michels PAM 2006, BBA

Trypanosomy – autofágie glykosomů Michels PAM 2006, BBA

Diplonema – glykosomy Glykolitický enzym aldolázu se podařilo lokalizovat do peroxizomu diplonemy papilatum. Lokalizace dalších enymů není známá. Makiuchi 2011, Protist

Glykolýza (EMP dráha) – Chlamydomonas PLASTID Ve flagelárním proteomu našli také tyto enzymy Eukaryotic cilia and flagella are long, thin organelles, and diffusion from the cytoplasm may not be able to support the high ATP concentrations needed for dynein motor activity. We discovered enzyme activities in the Chlamydomonas reinhardtii flagellum that catalyze three steps of the lower half of glycolysis (phosphoglycerate mutase, enolase, and pyruvate kinase). These enzymes can generate one ATP molecule for every substrate molecule consumed. Flagellar fractionation shows that enolase is at least partially associated with the axoneme, whereas phosphoglycerate mutase and pyruvate kinase primarily reside in the detergent-soluble (membrane + matrix) compartments. We further show that axonemal enolase is a subunit of the CPC1 central pair complex and that reduced flagellar enolase levels in the cpc1 mutant correlate with the reduced flagellar ATP concentrations and reduced in vivo beat frequencies reported previously in the cpc1 strain. We conclude that in situ ATP synthesis throughout the flagellar compartment is essential for normal flagellar motility. Enoláza je strukturní součástí komplexu proteinů středového páru mikrotubulů Mitchell BF, 2005 Mol Biol Cell

Glykolýza (EMP dráha) - Toxoplasma Glykolytické enzymy (HK, ALD, GAPDH, PK a LDH) extracelulární a pronikající Toxoplasmy jsou lokalizolvány u povrchu. U intracelulárního stádia se přesouvají dovnitř buňky. The subcellular location of the myc-tagged glucose transporter GT1 in intracellular and extracellular Toxoplasma tachyzoites was determined by immunofluorescence microscopy using antibodies to the myc-epitope (green) and to the membrane skeleton protein IMC1 (red). Overlays of DIC and DAPI fluorescence images are shown on the right. Bars = 2 µm. Přesun je regulován koncentrací K+ ve vnějším prostředí parazita (vyšší uvnitř hostitelské buňky). Pokles K+ vně vyvolá růst konc. Ca2+ v buňce toxoplasmy. Pomel 2008, PLoS ONE

Energetický metabolismus http://www.youtube.com/watch?v=xbJ0nbzt5Kw&feature=related

Klasická mitochondrie

Ukradené plastidy jako zdroj kyslíku Nálevník Histiobalantium natans Esteban a kol. 2009

Alternativní akceptory e- - NO3- Kampl a kol. 2015

Alternativní akceptory e- - NO3- Kampl a kol. 2015

Distribuce anaerobních derivátů mitochondrie

PNO

PNO

PNO Mi-ichi 2015, PNAS

Oxymonády – ztráta mitochondrie Karnkowska a kol. unpublished

Trypanosomy – vektorová forma

Trypanosomy – krevní forma

Alveolata Nálevníci Obrněnky Výtrusovci Danne a kol. 2012

ATP syntáza

ATP syntáza u Tetrahymena thermophila Nina a kol. PLoS Biology 2010

Téma eseje – Metabolická flexibilita zelených řas Chlamydomonas Téma eseje – Metabolická flexibilita zelených řas

Téma eseje – Arginin dihydrolázová dráha anaerobních protist Metamonády arginine deiminase (ADI) ornithine carbamyltransferase (OTC) carbamoyl kinase (CK) Téma eseje – Arginin dihydrolázová dráha anaerobních protist

KONEC