Teoretické principy šlechtění a selekce Tomáš Kopec
Cíl šlechtění Genetický zisk - ∆G Dosahován selekcí zvířat pro tvorbu následující generace Výběr jedinců dle genetického založení - neznáme
Vlivy působící na vlastnosti Užitkovost (100%) Chovatel(60%)Zvíře(40%) náhodné prostředígenetické založení (30%) (10%)
Odhad genetického založení Kontrola užitkovosti odhad PH Využití molekulární genetiky genomické PH
Vývoj odhadu PH z KU metoda matky - dcery dánská staniční (50. léta) CC test (contemporary comparison) ICC -improved, MCC -modified BLUP - sire model (otcovský model) BLUP - animal model (model jedince) TDM – test day model (model kontrolního dne)
Konvenční PH je ODHAD genetického založení jedince pro odchylku v užitkové vlastnosti od průměru vrstevníků odhadem rozumíme proces odstranění (korekce) všech nežádoucích negenetických faktorů z naměřené užitkovosti nejdůležitější pro PH je aditivní účinek genů Zohlednění příbuznosti všech jedinců vstupujících do modelu Kvalita odhadu zavisí na kvalitě vstupních informací
Konvenční PH PH
Publikování Odhad PH pro téměř 40 vlastností PH jsou bázovány na určitý ročník narození (zohlednění genetického trendu v populaci) RPH - Všechny PH převedeny na průměr 100 se směrodatnou odchylkou 12 Dílčí selekční indexy (IMU, IML....)
Spolehlivost – PH kg bílkovin 35 kg SpolehlivostRozpětí 0,3010,2 - 59,8 0,7518,2 - 51,9 0,8521,9 - 48,1 0,9024,3 - 45,7 0,9931,6 - 38,4
Plemenné hodnoty = působení mnoha genů PH zvířete
Genomické PH
Využití genomických informací Do odhadu PH vstupují informace molekulární genetiky, konkrétně polymorfismus nukleotidů
Polymorfismus… 93 % 99,5 % 98,6 % 99,9 %
Kroky 2-krokové g-selekce Referenční soubor zvířat známé údaje o užitkovosti pokud možno všechny znaky zlepšovatelé i „mínus “ varianty Odvození efektů SNP Odhad gPH 2. Skupina zvířat s neznámými údaji o užitkovosti (kandidátní jedinci) typizace, odhad gPH selekce podle stanovených gPH
Spolehlivost genomických PH Gen. PH v porovnání s konvenčními PH Max spolehlivost PH původdG PH Mléko33% 75% Exteriér29% 69% Dlouhověkost23% 61% Plodnost24% 57% Býk KrávapůvoddG PH Mléko33% 75% Exteriér29% 69% Dlouhověkost23% 61% Plodnost24% 57%
Genomická selekce Vyžaduje pro validní předpověď genetického založení jedince dostatečně velkou populaci Populace českého strakatého skotu: krav v PK 65 býků v inseminaci Nedostatečná velikost
DAC odhad Dostatečný rozsah populace pro GS zpřesnění konvenčních PH Interakce genotyp x prostředí
Spolehlivost PH masa
cca 480 km cca 650 km Bohmanová et al 2008 cca 2300 km cca 5000 km
Korelace prostředí "Pokud hodnota genetické korelace mezi dvěma podmínkami prostředí dosahuje hodnotu vyšší než 0.8, je interakce genotyp x prostředí biologicky nevýznamná„ Robertson, A. (1959): The sampling variance of the genetic correlation coefficient. Biometrics 15: 469 – 485.
Výběr na základě více vlastností Kombinovaný skot Chovatelský cíl: mléko : maso : fitnes Kombinovaný užitkový profil charakteristický pro plemeno
Selekce na více znaků Tandemová selekce Selekce dle nezávislých výběrových úrovní Simultánní selekce - SI
Děkuji za pozornost