Dobry den, posílám výsledky MALDI MS analýz spáchaných během letošních cvičení. V dendrogramech se k sobě kvůli absenci rodově specifických signálů neřadí.

Prezentace na téma: "Dobry den, posílám výsledky MALDI MS analýz spáchaných během letošních cvičení. V dendrogramech se k sobě kvůli absenci rodově specifických signálů neřadí."— Transkript prezentace:

1 Dobry den, posílám výsledky MALDI MS analýz spáchaných během letošních cvičení. V dendrogramech se k sobě kvůli absenci rodově specifických signálů neřadí pouze zástupci rodů Bacillus a Streptococcus. Během přesunů lidí a vzorků došlo k politováníhodné události, kdy byl kmen 7444 extrahován a analyzován v úterý, poté omylem zařazen mezi nezanalyzované a opětovně extrahován a analyzován ve čtvrtek, kdy se z něj proto nepodařilo  získat kvalitní spektra (obětí omylu byla Mely, které se tímto dodatečně omlouvám). Zdravi Ondrej Sedo

2 Streptococcus oralis CCM 7412T

3 Streptococcus intermedius CCM 4044

4 Streptococcus intermedius CCM 7444T

5 Proteus mirabilis CCM 1944

6 Proteus mirabilis CCM 7188T

7 Brevundimonas vesicularis 3398T

8 Brevundimonas diminuta 2657T

9 Brevundimonas diminuta 4623

10 Pseudomonas mediterranea CCM 7691T

11 Pseudomonas koreensis CCM 7352T

12 Staphylococcus epidermidis 4418

13 Staphylococcus aureus subsp. aureus 1484

14 Staphylococcus aureus subsp. aureus 2022

15 Bacillus megaterium CCM 2007T

16 Bacillus circulans CCM 1611

17 Bacillus circulans CCM 2048T

18 Serratia marcescens subsp. marcescens 303T

19 Serratia marcescens subsp. marcescens 635
7925 4349 5381 9538 6228 2943 4767 9209 3961 2687 7273 6442 3577 5154 9960 8166 1000 2000 3000 4000 5000 Intens. [a.u.] 2823 3069 9534 2446 7209 8367 3863 2561 5122 8863 5703 6546 6000 7000 8000 9000 10000 11000 m/z

20 Corynebacterium glutamicum 2428T

21 Dendrogram 2009 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Staphylococcus aureus 1484 Staphylococcus aureus 2022 Staphylococcus epidermidis 4418 Bacillus circulans 2048 Bacillus circulans 1611 Streptococcus intermedius 4044 Streptococcus intermedius 7444 Streptococcus oralis 7412 Bacillus megaterium 2007 Corynebacterium glutamicum 2428 Brevundimonas diminuta 2657 Brevundimonas diminuta 4623 Brevundimonas vesicularis 3398 Proteus mirabilis 1944 Proteus mirabilis 7188 Serattia marcescens 303 Serratia marcescens Seratia marcescens Pseudomonas koreensis 7352 Pseudomonas mediterranea 7691 Distance Level

22 Dendrogram 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Klebsiella raoultella 3721 Klebsiella raoultella 3722 Klebsiella pneumoniae 4415 Seratia liquefaciens 2716 seratia liquefaciens 2715 Serratia grimesii 2718 Serratia grimesii 4735T Klebsiella pneumoniae 4985 Serattia marcescens 303 Serratia marcescens seratia marcescens Proteus mirabilis 1944 Proteus mirabilis 7188 Pseudomonas koreensis 7352 Pseudomonas mediterranea 7691 Salmonella enteritica 4419 Aeromonas popoffii 4708T Aeromonas popoffii 4961 Bacillus megaterium 2007 Corynabacterium pilosum 6140T Corynebacterium glutamicum 2428 Brevundimonas diminuta 2657 Brevundimonas diminuta 4623 Brevundimonas vesicularis 3398 Bacillus cereus 1992 Bacillus cereus 2010T Streptococcus mutans 7409T Bacillus circulans 1611 Streptococcus intermedius 4044 Streptococcus intermedius 7444 Streptococcus oralis 7412 Bacillus circulans 2048 Streptococcus salivarius 4046T Bacillus subtilis 2216T Bacillus subtilis 2217 Staphylococcus aureus 1484 Staphylococcus aureus 2022 Staphylococcus epidermidis 4418 Staphylococcus sciuri ssp rodentium 4657T Staphylococcus sciuri ssp sciuri 7040 Staphylococcus scuiri ssp carnaticus 4835T staphylococcus sciuri ssp sciuri 3473T Distance Level