Sacharidová složka nukleotidů
Heterocyklické organické báze
Fosfáty
Názvosloví nukleotidů
PRIMÁRNÍ STRUKTURA NUKLEOVÝCH KYSELIN je dána pořadím jednotlivých nukleotidů v polynukleotidovém řetězci nukleotidy jsou navzájem spojeny 3´, 5´- fosfodiesterovou vazbou –OH skupina na C3 - 3´- konec fosfátová skupina na C5 - 5´- konec
Strukturní typy nukleových kyselin lineární molekuly- mají volné konce a mohou být: jednořetězcové DNA nebo RNA dvouřetězcové DNA nebo RNA kružnicové molekuly – nemají volné konce a mohou být: tří až čtyřřetězcové molekuly DNA jednořetězcové se označují ss = single stranded dvouřetězcové ds = double stranded
Watson-Crieckovo párování bází Podle tohoto pravidla se prostřednictvím vodíkových vazeb páruje: adenin s thyminem A=T cytozin s guaninem C=G v RNA a při interakcích DNA-RNA se páruje Adenin s uracilem A=U nukleotidové sekvence, které se spojují tímto způsobem se označují jako komplementární
Obrácené Watson-Crieckovo párování bází uplatňuje se u DNA tvořené paralelními polynukleotidovými řetězci
SEKUNDÁRNÍ STRUKTURA NUKLEOVÝCH KYSELIN
základní druhy konformace DNA jsou A,B,Z
Denaturace dvoušroubovicové DNA Přechod dvoušroubovicové DNA v samostatné polynukleotidové řetězce se označuje jako denaturace DNA K denaturaci DNA dochází nejčastěji: zvýšením teploty za alkalických podmínek teplota, při které dochází k denaturaci závisí na obsahu G a C v DNA čím více párů G-C DNA obsahuje, tím větší teploty je potřeba k její denaturaci rozmezí denaturačních teplot je asi 30-100 °C
denaturaci DNA provází tzv. hyperchromní efekt tj denaturaci DNA provází tzv. hyperchromní efekt tj. dochází ke zvýšení absorbance UV- světla závislost absorbance UV-světla o vlnové délce 260 nm roztoku dvoušroubovicové DNA na teplotě má tvar sigmoidální křivky teplota, při níž zdenaturovalo 50 % dsDNA se označuje jako teplota tání Tm
Hybridizace DNA
Různé hybridizační podmínky umožňují vytvoření dvojšroubovice s některými nespárovanými nukleotidy
TERCIÁRNÍ STRUKTURA DNA má podobu nadšroubovice = superhelixu parametry charakterizující nadšroubovici jsou: změny v celkovém čísle vinutí katalyzují enzymy zvané topoizomerázy