Genový tok a evoluční tahy

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Vznik diverzity živočichů: speciace a (adaptivní) radiace
Advertisements

Mgr. Iva Martincová UBO AVČR v.v.i. Studenec Masarykova univerzita
Heterogenita nádorové buněčné populace v diagnostice a léčení
Základní genetické pojmy – AZ kvíz
POPULAČNÍ GENETIKA 6 faktory narušující rovnováhu populací
Hardy – Weibergův zákon
Biologická evoluce.
Genetika populací, rodokmen
Autor: Mgr. Tomáš Hasík Určení: Septima, III.G
Evoluce sekvence DNA.
Evoluce genů.
Makroevoluce.
GENETIKA EUKARYOTICKÉ BUŇKY
Klíčové produkty evoluce Autor: Mgr. Tomáš HasíkUrčení: Septima, III.G Gymnázium a Střední odborná škola pedagogická, Čáslav, Masarykova 248 Moderní biologie.
Využití v systematické biologii
Základy genetiky Role nukleových kyselin DNA – A,T,C,G báze
Evoluce ontogeneze a životního cyklu
Genetická diverzita hospodářských zvířat
Vznik diverzity živočichů: speciace a (adaptivní) radiace
Genetická variabilita populací  Pacient je obrazem rodiny a následně populace, ke které patří  Distribuci genů v populaci, a to jak jsou četnosti genů.
Populační genetika.
Genetika.
Evoluce sekvence DNA.
- zabývají se studiem živých soustav
Test pro kvintu B 15. prosince 2006
Mutace.
Evoluční a koevoluční procesy
prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Základní evoluční mechanismy
Rychlost a směr evoluce parazita (ve srovnání se situací u jeho hostitele)
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
 VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI = nejdůležitější mikroevoluční
Ochrana rostlinného a živočišného genofondu
Definice, typy mutací, mechanizmy vzniku a oprav
Ekologie malých populací Jakub Těšitel. Malé populace # stochastická (náhodně podmíněná) dynamika # velké odchylky od Hardy-Weinbergovské rovnováhy #
NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH Náhodný výběr gamet z genofondu:
Polymorfismus lidské DNA.
Fyziologie reprodukce a základy dědičnosti FSS 2009 zimní semestr D. Brančíková.
HW model: jedna zcela izolovaná populace  populace často rozděleny do subpopulací genetická výměna mezi lokálními populacemi = tok genů (gene flow) A.
Mendelistická genetika
2014 Výukový materiál MB Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Populační genetika Fenotypy, genotypy RNDr Z.Polívková
Základní typy genetických chorob Marie Černá
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
INTEGROVANÝ VĚDNÍ ZÁKLAD 2 ŽIVOT - OBECNÉ VLASTNOSTI (III.) (ROZMNOŽOVÁNÍ základy genetiky) Ing. Helena Jedličková.
ŠkolaStřední průmyslová škola Zlín Název projektu, reg. č.Inovace výuky prostřednictvím ICT v SPŠ Zlín, CZ.1.07/1.5.00/ Vzdělávací.
Spontánní mutace Četnost: 10-5 – Příčiny:
Exonové, intronové, promotorové mutace
Genetická variabilita rostlinných populací
MUTACE náhodné nevratné změny genetické informace návrat do původního stavu je možný jen další (zpětnou) mutací jediný zdroj nových alel ostatní zdroje.
Název školy Gymnázium, střední odborná škola, střední odborné učiliště a vyšší odborná škola, Hořice Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název materiálu.
Genetika populací Doc. Ing. Karel Mach, Csc.. Genetika populací Populace = každá větší skupina organismů (rostlin, zvířat,…) stejného původu (rozšířená.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – teoretický základ Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10 /13 Šablona: III/2 Inovace.
Blok 4 Základy evoluční biologie Uvedení do biologie 2015 Mgr. Veronika Chvátalová.
Exonové, intronové, promotorové mutace
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE 1 2  G  
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
EU peníze středním školám
Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková
Vznik diverzity živočichů: speciace a (adaptivní) radiace
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
Mitóza, Meióza Test pro kvinty podzim 2006.
Mutace.
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE 1 2  G  
Mutace.
NUKLEOVÉ KYSELINY Dusíkaté báze Cukry Fosfát guanin adenin tymin
Názory na vznik života Kreační teorie = náboženské
37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
Transkript prezentace:

Genový tok a evoluční tahy

Mechanismy mikroevoluce selekce genetický posun (drift) genový tok (migrace) evoluční tahy molekulární tah meiotický tah mutační a reparační tah

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce)

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce)

Struktura metapopulace

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce)

Biologická zdatnost migrantů průměr exklusivní zdatnost průměr inklusivní zdatnost

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce)

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce)

Vliv velikosti zakladatelské populace b)

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce)

Vliv migrace na mezipopulační variabilitu 0,9 pn = (1 – m)t (p0 – P) + P 0,8 frekvence alely 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 100 200 300 400 Čas (generace) pn – frekvence alely p v n-té generaci P – frekvence alely p v metapopulaci m – migrace (podíl čerstvých imigrantů v populaci)

Udržování druhové koheze Protiváha genetického driftu velmi účinné, stačí 1-2 migranti za generaci Nezáleží na velikosti populace Málo účinné v případě selekce Diverzifikace lokálních populací – (suboptimalita) Šíření výhodných znaků v metapopulaci

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu (hranice a Rapoportovo pravidlo) směr evoluce (skupinová selekce)

Genový tok mikroevoluční význam genového toku, migrace a vigilita, struktury populací investice do migrantů, migrace v čase, mezidruhový genový tok evoluční důsledky genového toku zdroj evolučních novinek udržování polymorfismu udržování druhové koheze velikost areálů výskytu směr evoluce (skupinová selekce a překonávání údolí v adaptivní krajině)

Teorie posunující se rovnováhy Fáze II Fáze I Fáze III

Evoluční tahy Mutační tah Molekulární tah Meiotický tah

Evoluční tahy Mutační tah Molekulární tah Meiotický tah

Mutační tah mechanismy mutačního a reparačního tahu mutacionismus evoluce genomu Isochory paradox genetické komplexity

Mutační tah mechanismy mutačního a reparačního tahu mutacionismus evoluce genomu Isochory paradox genetické komplexity

Mutační tah Reparační tah X C G T A 5’ 3’ reparace deaminace met T reparace deaminace A substituce

Mutační tah mechanismy mutačního a reparačního tahu mutacionismus (evoluční trendy a zábrany) evoluce genomu Isochory paradox genetické komplexity

Mutační tah mechanismy mutačního a reparačního tahu mutacionismus evoluce genomu Isochory paradox genetické komplexity

a) b) c) d) deaminace MET-cytosinu reparace GT  GC 5’-ATxxxxCG-3’ 3’-TAxxxxGC-5’ 5’-ATxxxxTG-3’ 3’-TAxxxxGC-5’ 5’-ATxxxxCG-3’ 3’-TAxxxxGC-5’ b) substituce A  G reparace GT  GC m m m 5’-ATxxxxCG-3’ 3’-TAxxxxGC-5’ 5’-GTxxxxCG-3’ 3’-TAxxxxGC-5’ 5’-GTxxxxCG-3’ 3’-CAxxxxGC-5’ c) nízký obsah GC párů lokální dočasná denaturace DNA deaminace MET-cytosinu pokles zastoupení GC párů d) vysoký obsah GC párů absence lokální denaturace pokles deaminace MET-cytosinu vzestup zastoupení GC párů

Paradox genetické komplexity mnoho rostlin, někteří živočichové živočichové, některé rostliny houby bakterie 106 107 108 109 1010 1011 velikost genomu (počet párů bazí)

Evoluční tahy Mutační tah Molekulární tah Meiotický tah

Molekulární tah mechanismy genová konverze sklouznutí nelegitimní rekombinace retrotransposice význam pro evoluci (synchronizovaná evoluce) význam pro molekulární taxonomii (repetice, mikrosatelity)

Molekulární tah mechanismy genová konverze sklouznutí nelegitimní rekombinace retrotransposice význam pro evoluci (synchronizovaná evoluce) význam pro molekulární taxonomii (repetice, mikrosatelity)

Genová konverze

Nelegitimní rekombinace I a-b b b-a b-a

Nelegitimní rekombinace II a-b a b-a b

Sklouznutí templátu

Sklouznutí DNA polymerázy GCGCGCGCGCGCGCGC CGCGCGCGCGCGCGCG GCGCGCGCG G C GCGCGCGCGC GCGCGCGCGCGCGCGCGCGC CGCGCGCGCGCGCGCGCGCG

Molekulární tah mechanismy genová konverze sklouznutí nelegitimní rekombinace retrotransposice význam pro evoluci (synchronizovaná evoluce) význam pro molekulární taxonomii (repetice, mikrosatelity)

Molekulární tah mechanismy genová konverze sklouznutí nelegitimní rekombinace retrotransposice význam pro evoluci (synchronizovaná evoluce) význam pro molekulární taxonomii (repetice, mikrosatelity)

Molekulární tah mechanismy genová konverze sklouznutí nelegitimní rekombinace retrotransposice význam pro evoluci (synchronizovaná evoluce) význam pro molekulární taxonomii (repetice, mikrosatelity)

Role molekulárního tahu v divergenci druhů b)

Evoluční tahy Mutační tah Molekulární tah Meiotický tah

Meiotický tah v oogenezi primární oocyt sekundární oocyt c 1. pólová buňka a d b b 1. pólová buňka 2. pólová buňka ootyda

Příklady meiotického tahu Chromosomové mutace včetně translokací (Rumex acetosa: 5 z 9 translokací aktivní) Zápas gamet (t-lokus, SD systém D. melanogaster) Pohlavní chromosomy – SRD (sex ratio distorters) gen D na Y-chromosomu u Aedes aegypti B- chromosomy (kobylky druhů Melanoplus femur-rubrum a Myrmeleotettix maculatus – B-chromosom skončí v 90 % případů v oocytu)

Evoluční význam meiotického tahu Chromosomové speciace – přes 90 % sesterských druhů se liší karyotypem Crossing over a meioza jako obrana proti meiotickému tahu (sister killers, rozbíjení aliancí genů) Kompetice spermií a polygamní rozmnožovací systémy

a) b)

Evoluční význam meiotického tahu Chromosomové speciace – přes 90 % sesterských druhů se liší karyotypem Crossing over a meioza jako obrana proti meiotickému tahu (sister killers, rozbíjení aliancí genů) Kompetice spermií a polygamní rozmnožovací systémy

a) b) c)

Evoluční význam meiotického tahu Chromosomové speciace – přes 90 % sesterských druhů se liší karyotypem Crossing over a meioza jako obrana proti meiotickému tahu (sister killers, rozbíjení aliancí genů) Kompetice spermií a polygamní rozmnožovací systémy

Shrnutí Mimo selekce, driftu a mutačních procesů se v evoluci uplatňuje řada dalších mechanismů Hlavním zdrojem evolučních novinek na úrovni populace je genový tok Řada nápadných vlastností dnešních organismů je neadaptivních a vznikají působením rychlých procesů probíhajících díky působení evolučních tahů