 VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI = nejdůležitější mikroevoluční

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
AUTOR: Ing. Helena Zapletalová
Advertisements

metody založené na specifické kombinační návaznosti (tj
Statistické metody pro testování asociace genů a nemocí
Plemenářská práce v chovu prasat
POPULAČNÍ GENETIKA 6 faktory narušující rovnováhu populací
Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Hardy – Weibergův zákon
Markery asistovaná selekce
Stránky o genetice Testy z genetiky
Genetika populací, rodokmen
Teoretické základy šlechtění lesních dřevin Milan Lstibůrek 2005.
MUTACE.
Autor: Mgr. Tomáš Hasík Určení: Septima, III.G
Využití v systematické biologii
MECHANISMY MIKROEVOLUCE
STRUKTURA POPULACE: SYSTÉM PÁROVÁNÍ GAMET.
Základy genetiky Role nukleových kyselin DNA – A,T,C,G báze
Genetická diverzita hospodářských zvířat
Genetické algoritmy [GA]. Historie:  1960: I. Rechenberg – první odborná práce na toto téma „Evolution strategies“  1975: John Holland – první genetický.
1 Škola:Chomutovské soukromé gymnázium Číslo projektu:CZ.1.07/1.5.00/ Název projektu:Moderní škola Název materiálu:VY_32_INOVACE_BIOLOGIE 2_06 Tematická.
Genetická variabilita populací  Pacient je obrazem rodiny a následně populace, ke které patří  Distribuci genů v populaci, a to jak jsou četnosti genů.
Populační genetika.
Populační genetika.
HW – nekonečná populace  omezená velikost populace  vyšší IBD (autozygotnost)  zvyšující se rozptyl frekvencí alel mezi démy v čase  fixace/extinkce.
Genetika populací kvalitativních znaků
Mutace.
prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
Mutace a mutageneze FOTO Lenka Hanusová, 2013.
Příbuzenská, liniová a čistokrevná plemenitba
Digitální výukový materiál zpracovaný v rámci projektu „EU peníze školám“ Projekt:CZ.1.07/1.5.00/ „SŠHL Frýdlant.moderní školy“ Škola:Střední škola.
Ekologie malých populací Jakub Těšitel. Malé populace # stochastická (náhodně podmíněná) dynamika # velké odchylky od Hardy-Weinbergovské rovnováhy #
NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH NÁHODNÉ PROCESY V POPULACÍCH Náhodný výběr gamet z genofondu:
HW model: jedna zcela izolovaná populace  populace často rozděleny do subpopulací genetická výměna mezi lokálními populacemi = tok genů (gene flow) A.
Genový tok a evoluční tahy
Analýza populační variability a struktury
VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI
Příklady z populační genetiky
Mendelistická genetika
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Populační genetika Fenotypy, genotypy RNDr Z.Polívková
Základní typy genetických chorob Marie Černá
Spontánní mutace Četnost: 10-5 – Příčiny:
Exonové, intronové, promotorové mutace
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Genetická variabilita rostlinných populací
Genetika kvantitativních znaků charakteristika kvantitativních znaků proměnlivost a její složky základní genetické parametry.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – řešené příklady Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/14 Šablona: III/2 Inovace.
Genetika populací Doc. Ing. Karel Mach, Csc.. Genetika populací Populace = každá větší skupina organismů (rostlin, zvířat,…) stejného původu (rozšířená.
Šlechtění hospodářských zvířat Doc. Ing. Karel Mach, CSc.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Genetika populací – teoretický základ Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10 /13 Šablona: III/2 Inovace.
Projekt HAPMAP Popis haplotypů
Exonové, intronové, promotorové mutace
TOK GENŮ.
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE 1 2  G  
NENÁHODNÉ PÁROVÁNÍ GAMET
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková
VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI
VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI
VY_32_INOVACE_19_28_Genetika
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
Mutace.
MOLEKULÁRNÍ EVOLUCE 1 2  G  
Mutace.
Exonové, intronové, promotorové mutace
37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
Transkript prezentace:

 VZNIK GENETICKÉ PROMĚNLIVOSTI = nejdůležitější mikroevoluční HW princip  za daných podmínek náhodné oplození a mendelovská dědičnost stačí k udržení polymorfismu = nejdůležitější mikroevoluční mechanismy  reálné populace: omezená velikost oplození nemusí být náhodné mezi lokálními populacemi migrace vznik nových alel mutací často selekce  mutace rekombinace tok genů (migrace) příbuzenské křížení + transpozice molekulární tah přírodní výběr náhodný genetický posun

Vznik genetické proměnlivosti MUTACE spontánní  indukované v zárodečných buňkách  somatické podle škodlivosti/prospěšnosti účinku: prospěšné škodlivé neutrální podle rozsahu: genové (bodové), chromozomové, genomové bodové mutace: synonymní substituce (transice, transverze) nesynonymní (záměnové) inzerce indels  posunutí čtecího rámce } měnící smysl (missense) nesmyslné (nonsense) delece zpětné mutace, rekurentní (opakující se) mutace, mutační tlak  změna četnosti alely mutací velmi pomalá

Vznik genetické proměnlivosti MUTACE chromozomové mutace (chromozomové přestavby): inverze pericentrické paracentrické translokace fúze a disociace (robertsonské translokace), reciproké translokace celých ramen (WART) myš domácí duplikace a delece

Vznik genetické proměnlivosti MUTACE genomové mutace: -somie -ploidie (tetra-, tri-, okta-, … poly-) Adaptivní (směrované) mutace? S. Luria & M. Delbrück (1943) fluktuační test

Vznik genetické proměnlivosti REKOMBINACE  nové genotypy Evoluční důsledky rekombinace: Rekombinace a polymorfismus: absence rekombinace  vazbová nerovnováha ztráta polymorfismu: - selective sweep; hitchhiking - background selection

Vznik genetické proměnlivosti MIGRACE (TOK GENŮ) Míra toku genů, m = je podíl genových kopií, který se do populace dostal v dané generaci imigrací z jiných populací Modely: island (ostrovní model) stepping-stone - jednorozměrný, dvourozměrný isolation by distance ... neighborhood Linanthus parryi Metody odhadu: přímé (capture-mark-recapture, CMR) nepřímé: F-statistika  FST = 1/(4Nm + 1)  Nm = (1/FST - 1)/4 … Nm = počet migrantů na generaci

Vznik genetické proměnlivosti (Gonodontis bidentata) MIGRACE Důsledky toku genů: genetická homogenizace subpopulací, zabraňující jejich genetické divergenci ( u mnoha druhů migrace velmi omezená) drsnokřídlec březový (Biston betularia) Př.: výskyt melanických forem můr v Anglii Vliv struktury populace: hierarchické populace Wahlundův efekt zejkovec dvojzubý (Gonodontis bidentata)

Vznik genetické proměnlivosti PŘÍBUZENSKÉ KŘÍŽENÍ (INBREEDING) Př.: opakované samooplození (samosprašnost): výchozí generace - HW rovnováha: 1/4 AA, 1/2 Aa, 1/4 aa 1. generace samooplození: 3/8 AA, 2/8 Aa, 3/8 aa 2. generace samooplození: 7/16 AA, 2/16 Aa, 7/16 aa Inbreedingem se mění frekvence genotypů, frekvence alel se nemění Inbreeding postihuje všechny lokusy  vazebná nerovnováha Koeficient inbreedingu, F pravděpodobnost autozygotnosti snížení heterozygotnosti

Vznik genetické proměnlivosti INBREEDING 1. Pravděpodobnost autozygotnosti: autozygotnost - alely identické původem (identical by descent, IBD)  alozygotnost - buď heterozygot, nebo homozygot, ale alely ne IBD (identical by state, IBS)  inbrední populace = taková, u níž pravděpodobnost autozygotnosti v důsledku křížení mezi příbuznými  v panmiktické populaci F = (1/2)i (1 + FA)

Vznik genetické proměnlivosti INBREEDING T I S 2. Snížení heterozygotnosti: S. Wright: F-statistika FIS = (HS - HI)/HS FST = (HT - HS)/HT FIT = (HT - HI)/HT (1- FIS) (1- FST) = 1- FIT Zvýšení koeficientu inbreedingu Genetické důsledky inbreedingu: zvýšení frekvence homozygotů zvýšení rozptylu fenotypového znaku inbrední deprese vazbová nerovnováha

Vznik genetické proměnlivosti INBREEDING inbrední deprese Rudolf II. “hybrid vigour” Leavenworthia alabamica Marie Terezie