BENG - membrány Biomembrány 4.ročník biochemie.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Elektrické vlastnosti buňky
Advertisements

John R. Helper & Alfred G. Gilman Zuzana Kauerová 2005/2006
Biofyzika Petr Wagner.
TUKY (LIPIDY).
Tato prezentace byla vytvořena
Chemismotický tok protonů
STRUKTURA BUŇKY.
BUŇKA JAKO ZÁKLAD VŠEHO ŽIVÉHO
Autor materiálu: RNDr. Pavlína Kochová Datum vytvoření: listopad 2013
Složení živých soustav
EUKARYOTA.
Nervová soustava.
LIPIDY.
Membrána. Nutnost oddělit se od vnějšího prostředí a kompartmentalizovat vnitřek pro různé biochemické a informační děje Membrány.
biomembrány a membránový transport
EUKARYOTICKÁ BUŇKA Velikost – v mikrometrech (10–100, i větší)
Základy přírodních věd
Biofyzika buňky, biomembrány
Eukaryota – buněčná stavba
Fyziologie buňky.
I. ZÁKLADNÍ POJMY.
DÝCHÁNÍ = RESPIRACE.
DÝCHACÍ ŘETĚZEC. enzymy jsou umístěny na vnitřní membráně mitochondrií získání energie (tvorba makroergických vazeb v ATP) probíhá oxidací redukovaných.
Biochemie Úvod do biochemie.
1.ročník šk.r – 2012 Obecná biologie
Dýchací řetězec a oxidativní fosforylace
Přibližný obsah prvků v lidském těle o hmotnosti 70 kg
Buňka - test Milada Roštejnská Helena Klímová Obr. 1. Různé typy buněk
Středn í zdravotnick á š kola, N á rodn í svobody P í sek, př í spěvkov á organizace Registračn í č í slo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Č.
5. Klidový potenciál.
Membrány a membránový transport
KVANTITATIVNÍ TERMODYNAMIKA
TESTTEST Úvod do bakteriologie Biologie buňky 25. října 2006 Kvinta B.
Iontové kanály Aleš Přech 9. kruh.
Cyklus kyseliny citrónové, citrátový cyklus.
aneb způsob, jakým je hormon z buňky uvolňován do krevního řečiště … V závislosti na chemické struktuře hormonů existují dva základní způsoby jejich sekrece.
Bioenergetika Pro fungování buněčného metabolismu nutný stálý přísun energie Získávání, přenos, skladování, využití energie Na co se energie spotřebovává.
Základní struktura živých organismů
Energetický metabolismus
1 DÝCHACÍ ŘETĚZEC. 2 PRINCIP -většina hetero. organismů získává hlavní podíl energie (asi 90%) procesem DÝCHÁNÍ = RESPIRACE -při tomto ději – se předávají.
Fotosyntéza Jiří Šantrůček Fyziologie rostlin_malá
BUŇKA.
Jan Zámečník, 7. kruh Obsah prezentace 1)Obecně o pumpách 2)ATPáza 3)Na + /K + ATPáza 4)Další důležité ATPdip.
Transport látek, osmóza
MITOCHONDRIÁLNÍ TRANSPORTNÍ SYSTÉMY
BUNĚČNÁ STAVBA ŽIVÝCH ORGANISMŮ
Základní struktura živých organismů
CITRÁTOVÝ CYKLUS = KREBSŮV CYKLUS= CYKLUS TRIKARBOXYLOVÝCH KYSELIN CH 3 CO-ScoA + 3H 2 O  2CO  H  + CoASH.
Semiautonomní organely a cytoskelet
Metabolismus sacharidů II. Anabolismus sacharidů Autotrofní organismy mají schopnost syntetizovat sacharidy z jednoduchých anorganických sloučenin – oxidu.
Základní pojmy ? Co je to ATOM ? ? Ze kterých částí se skládá atom? ? Co je to elektroneutrální atom ? Atomy jsou základní stavební částice všech látek.
Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Číslo materiálu
Příjem a výdej látek buňkou
Přenos látek přes membránu
BUŇKA – základ všech živých organismů
Buňka JE ZÁKLADNÍ STAVEBNÍ A FUNKČNÍ JEDNOTKOU
EKOLOGICKÝ PŘÍRODOPIS Tématický celek: GENETIKA Téma: BUŇKA
Předmět: KBB/BB1P; KBB/BUBIO
Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308
VY_52_INOVACE_24_Buňka rostlinná a živočišná
KLIDOVÝ MEMBRÁNOVÝ POTENCIÁL
11-Oxidační fosforylace, alternativní respirace FRVŠ 1647/2012
Bi1BK_ZNP2 Živá a neživá příroda II Buněčná stavba živých organismů
DÝCHÁNÍ = RESPIRACE.
4. Buňky.
Prokaryotická buňka.
23b_Oxidační fosforylace, alternativní respirace
 Biochemický ústav LF MU 2016 (E.T.)
Transkript prezentace:

BENG - membrány Biomembrány 4.ročník biochemie

BENG-membrány Membrány a buňka Obecné vlastnosti a struktura

Buněčné membrány Rostlinná buňka (lilie) Živočišná buňka (jaterní) BENG-membrány Buněčné membrány Rostlinná buňka (lilie) Živočišná buňka (jaterní)

BENG-membrány Membrány - struktura

BENG-membrány Membrána - model

Membrány přeměnující energii BENG-membrány Membrány přeměnující energii * na těchto membránách je syntetizován největší podíl ATP (něco málo i v cytoplazmě) * obsahují 2 odlišné typy protonových pump 1) PRIMÁRNÍ - velmi různorodé podle zdroje energie 2) SEKUNDÁRNÍ - vysoce konzervované - oba systémy jsou velmi těsně spřaženy TYPY: * plasmatická membrána prokaryot * vnitřní membrána mitochondrií * membrány thylakoidů v chloroplastech

BENG-membrány Přehled membrán Přehled membrán (P = positive, strana kam jsou protony čerpány)

Chemiosmotická teorie - základ BENG-membrány Chemiosmotická teorie - základ „Hypotetický“ thylakoid - chemiosmotické spřažení přenos protonů a syntézy/hydrolýzy ATP Přídavek ATP = čerpání protonů Ustavení rovnováhy Odstranění ATP = tok protonů ven a syntéza ATP (užitečná práce) pokud pracuje prim.pumpa 2) pokud spotřeba ATP a přísun ADP/P Dynamická rovnováha (reverzibilita reakcí a toků) systém nekoná užitečnou práci

Tok elektronů a protonů BENG-membrány Tok elektronů a protonů Tok protonů -analogie elektrických obvodů s tokem e- p  V JH+  I CMH+  vodivost „ATPasa - spotřebič protonového proudu“

Vlastnosti membrán Důležité vlastnosti membrán: BENG-membrány Vlastnosti membrán Důležité vlastnosti membrán: a) resistence průchodu protonů („protonový odpor“) „protonofory“ (uncouplers, rozpojovače) - pozorovány dávno před Mitchellem - způsobují „zkrat“ v obvodu protonů b) transportní systémy pro metabolity * transport negativně nabitých látek látky do MTCH * současný přenos s H+ nebo OH-

Mitochondrie 1 Mitochondriální a submitochondriální částice BENG-membrány Mitochondrie 1 Mitochondriální a submitochondriální částice Klasický „obraz“ – zmrazené preparáty a TEM

a submitochondriální částice BENG-membrány Mitochondrie 1 Mitochondriální a submitochondriální částice - dynamicky se měnící tvar v různých typek buněk podle jejich aktivity - těsný kontakt s ER (intenzivní výměna Ca2+ iontů ) - malý kontakt mezi kristami a mezimembránovým prostorem (měření HREM a 3D modely PT)

Mitochondrie - jak je neznáme ... BENG-membrány Mitochondrie - jak je neznáme ... Pohled shora: Lamelární topologie 4 segmentovaných krist mezi vnější a vnitřní membránou Boční pohled: Otvory spojů krist (černě) spojují mezimembránový prostor s intrakristálním prostorem Elektronová tomografie mitochondrií (National Center for Microscopy and Imaging Research at UCSD) http://www.sci.sdsu.edu/TFrey/MitoMovie.htm

Mitochondrie - jak je neznáme ... BENG-membrány Mitochondrie - jak je neznáme ... 3D model MTCH (krysí játra) - interkonektivita krist - tubulární tvar Normální Myopatie Nové otázky: - gradienty metabolitů (ADP) v kristách ? - izolované kulovité kristy ? vztah k patologickým vztahům ? propojení MTCH / EPR

Mitochondrie 2 Mitochondrie v různých typech buněk: NEURONY BENG-membrány Mitochondrie 2 Mitochondrie v různých typech buněk: NEURONY - diskrétní filamenta v cytoplazmě - mobilní podél axonů a dendritů difúzní koeficient ~0.8 µm2/s (2-4x pomaleji než v roztoku) SVALOVĚ BUŇKY - velké množství krist

BENG-membrány Mitochondrie - sval Mitochondrie svalových buněk

Mitochondriální membrány BENG-membrány - vnější nespecifické póry pro metabolity < 10kDa „poriny“ (VDAC, voltage dependent anion channels) x není membránový potenciál - vnitřní „energy transducing“ - dýchací řetězec a ATPasa speciální transportní mechanismus pro proteiny značení orientace membrány: N-side (negative): do matrix P-side (positive): do mezimembránového prostoru POZOR: u submitochondriálních preparátů přípravených sonikací dochází k inverzi!!

Respirující baktérie Gram-negativní bakterie (velikost cca jako MTCH) BENG-membrány Respirující baktérie Gram-negativní bakterie (velikost cca jako MTCH) * membrána oddělena od peptidoglykanové stěny periplasmem Gram-pozitivní bakterie * membrána přiléhá přímo k vnější buněčné stěně ROZDÍLY: - mnoho látek neprochází vnější membránou Gram-negativních - ADP/ATP a NAD+/NADH neprochází cytoplasmatickou membránou - obtížné „vyhladovění“ - odstranění vnitřních substrátů - studium transportu metabolitů komplikováno jejich možnou přeměnou

Membrána Gram-negativní baktérie BENG-membrány Membrána Gram-negativní baktérie

BENG-membrány Chloroplasty

Chloroplasty - thylakoid BENG-membrány Chloroplasty - thylakoid velikost: 4-10 m průměr, 1-2 m tlouštka

BENG-membrány Membrána thylakoidů - lumen tvoří oddělený prostor od mezimembránového prostoru - ATP a NADPH používány ve stroma k fixaci CO2 - „broken chloroplast“ - bez vnější membrány a stromatu

Purpurová baktérie Rhodobacter BENG-membrány Purpurová baktérie Rhodobacter Nejstudovanější skupina: a) tvorba „chromatoforů“ b) snadné studium * malá velikost * opticky jasné suspenze c) snadná izolace reakčních center

Obecné vlastnosti Lipidická dvojvrstva membrán: BENG-membrány Lipidická dvojvrstva membrán: nepropustná pro většinu iontů včetně H+ vysoký odpor (potenciál 200mV = elektrické pole 3.105 V/cm-1) B) propustná pro řadu nenabitých látek 02, CO2, NH3, octanový anion (využito pro studium pH gradientů) C) polární molekuly vody: aquaporiny = vodupropustné kanály (Peter Agre – Nobelova cena 2003)

BENG-membrány Aquaporiny

BENG-membrány Transport iontů - Transport iontů integrální součást chemi-osmotické teorie Membrány přeměňující energii mají obecně shodné vlastnosti jako všechny ostatní buněčné membrány Pro transport musí existovat hnací síla Typy transportu: Difúze lipidickou vrstvou x přenašeč (ionofor, protein) Pasivní přenos x energetické spřažení (aktivní transport) Jediný ion x spřažený přenos 2 a více iontů Dochází k výslednému přenosu náboje ?

BENG-membrány Transport iontů 1

BENG-membrány Transport iontů 2

Specifika energetických membrán 1 BENG-membrány Ad 1) difúze x přenašeč Proteinové složení Vnitřní MTCH : 50% plochy integrální proteiny!! 25% periferální proteiny, 25% lipidy - přenašeče v MTCH krysích játer x nejsou v MTCH srdce Lipidové složení * Vnitřní MTCH: 20% kardiolipin (fosfolipid) - vysoká elektrická izolace, struktura, náboj x Barthův syndrom * Thylakoid: 16% kardiolipin 40% galaktolipidy 40% fotopigmenty kardiolipin

Specifika energetických membrán 2 BENG-membrány Ad 2) pasivní x spřažený transport Pro stejný iont existují různé mechanismy ! * sarkoplasmatické retikulum – iontová pumpa Ca2+ - ATPasa * vnitřní MTCH membrána – uniport pro Ca2+/Na+ poháněný  „Aktivní“ transport – pouze přenos katalyzovaný proteiny může být přímo spřažen s metabolismem

Specifika energetických membrán 3 BENG-membrány Ad 3) uniport, symport a antiport Příklady: Bakteriální membrána: symport H+/metabolity do buňky Lipidické dvojvrstvy: antiport K+/H+ s nigericinem Obtížné experimentální rozlišení H+/OH- např. fosfátový přenašeč je P-/OH- antiport nebo P-/H+ symport ? Jeden ion se může účastnit více blízce spjatých drah: Na+ uniport (kanály aktivované membránovým potenciálem) Na + symport (ko-transport s glukosou) Na + antiport (přenašeč 3Na+/Ca2+)

Specifika energetických membrán 4 BENG-membrány Ad 3) elektroneutrální x přenos náboje Celkově elektroneutrální přenos x na molekulární úrovni dochází k neustálému přenosu náboje Jedna dráha přenosu se může podle podmínek chovat jako: elektrogenní = vytvářející elektrický potenciál na membráně elektroforetická = přenos iontů na úkor elektrického potenciálu

BENG-membrány Ionofory Funkce ionoforu = snížení aktivační energie potřebné pro zanoření polární látky do nepolární lipidické vrstvy a) Přírodní – antibiotika b) Syntetické – studium vlastností membrán a transportu iontů látky MW cca 500-2000 Da, hydrofobní povrch a hydrofilní jádro Mechanismus: mobilní přenašeče: rychlost cca 1000 iontů/s-1, vysoká specifita pro ionty, ovlivněny fluiditou membrány tvorba kanálů: nízká diskriminace mezi ionty x vysoká rychlost cca 107 iontů/s-1

Přenos náboje bez přenosu H+ BENG-membrány Přenos náboje bez přenosu H+ Valinomycin (Streptomyces) * (L-Val-D-hiVA-D-Val-D-Lac)3 * uniport Cs+, Rb+, K+, NH4+ * přenos Na+ - 104 x menší než K+ * volný Val i nabitý komplex prochází membránou * katalytická účinnost 10-9 M Gramicidine * přechodná tvorbu dimerů - kanály * nízká selektivita pro jednomocné kationty * rychlost limitována pouze difúzí (cca 107 iontů/s-1) HCO-L-Val-Gly-L-Ala-D-Leu-L-Ala-D-Val-L-Val-D-Val-L-Trp-D-Leu-L-Trp-D-Leu-L-Trp-D-Leu-L-Trp-NHCH2CH2OH

Valinomycin a gramicidin – přenos iontů BENG-membrány

Ionofory pro Ca2+ A23187 * vysoká afinta pro Ca2+ BENG-membrány A23187 * vysoká afinta pro Ca2+ Calcium ionophore IV (Sigma)

Přenos H+ bez přenosu náboje BENG-membrány Nigericin * tvorba hydrofilní kapsy O-heterocykly * při vazbě kationtu ztrácí H+ * obě formy prochází membránou Monensin * preference pro Na+

Protonofory - přenos H+ a náboje BENG-membrány Protonofory - přenos H+ a náboje FCCP = carbonylcyanide-p-trifluoromethoxyphenyl-hydrazone „rozpojovače, přenašeče H+“ průchod díky systému -elektronů zvýšení propustnosti membrány pro protony vede ke zkratu obvodu a rozpojení tvorby p od syntézy ATP zvýšení protonové vodivosti těmito látkami bylo v souladu s chemiosmotickou teorií rozpojení může být dosaženo kombinací ionoforů např. valinomycin a nigericin

Příklady funkce – nigericin a FCCP BENG-membrány Příklady funkce – nigericin a FCCP c) Elektroneutrální přenos H+ d) Cyklování protonoforu

Lipofilní kationty a anionty BENG-membrány Lipofilní kationty a anionty TPP+ = tetrafenylfosfoniový kation TPB- = tetrafenylborátový anion Využití schopnosti -elektronů „odstiňovat“ elektrický náboj při průchodu lipidickou dvojvrstvou VÝZNAM: nejsou ionofory, ale akumulují se při existenci membránového potenciálu = experimentální odhad  fluoreskující lipofilní kationty – sledování MTCH in vitro i v živých buňkách

BENG-membrány TPP a TPB TPP+ TPB-

BENG-membrány Transportní proteiny Specifika: Analogie enzymům (inhibice, stereospecifita, genetika) Individuální, orgánová a tkáňová odlišnost (např. citrátový přenašeč – pouze jaterní MTCH) Používání synonym pro transportní proteiny: „Přenašeče“ x neodpovídá funkci přenašeče definované u ionoforů „Permeasy“, „Translokasy“ - Většina transportních proteinů tvoří dimery a přenos látek se děje konformačními změnami proteinů

„Kyvadlová doprava MTCH- CYT“ BENG-membrány „Kyvadlová doprava MTCH- CYT“

Osmotické bobtnání MTCH BENG-membrány Základní princip: pouze malé odchylky od rovnovážného rozdělení iontů – vznik velkých potenciálů (1 nmol iontu =  >200mV) a) probíhá vždy, pokud nejsou MTCH v isotonickém prostředí, které navíc neobsahuje permeabilní ionty b) zahrnuje rozvinutí vnitřní membrány až do prasknutí vnější membrány c) pozoruje se jako změny optických vlastností suspenze MTCH

Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 1 BENG-membrány Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 1 1) nepropustnost Cl-

Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 2 BENG-membrány Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 2 1) nepropustnost Cl- 2) propustnost SCN-

Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 3 BENG-membrány Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 3 1) nepropustnost Cl- 2) propustnost SCN- 3) reflux H+ po FCCP

Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 4-5 BENG-membrány Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 4-5 5) srovnej s nigericinem 4) FCCP nutný pro H+ tok

Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 6-7 BENG-membrány Bobtnání MTCH – ionofory a metabolity 6-7 7) kontrakce po přídavku nigericinu a substrátu: propustnost pro NO3- 6) propustnost pro acetát

Fyziologický význam bobtnání MTCH BENG-membrány Fyziologický význam bobtnání MTCH Přídavek TNF- ke kultuře lidských hepatocytů: Tvorba ROS (změna červená – žlutá-zelená barva) Bobtnání MTCH = změny v propustnosti vnitřní membrány

Příště: Vzpomínky na fyzikální chémii