Projekt HUGO – milníky - I

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Genetické polymorfismy v kriminalistické historii
Advertisements

Jaroslav Petr VÚŽV Uhříněves
Irena Svobodová Gymnázium Na Zatlance
GENETIKA NUKLEOVÉ KYSELINY DNA, RNA
Single Nucleotide Polymorphism
Studium lidského genomu
Mgr. Iva Martincová UBO AVČR v.v.i. Studenec Masarykova univerzita
Základní genetické pojmy – AZ kvíz
Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice
Praktikum základů genomiky, zima 2007 Základy genomiky I. Úvod do bioinformatiky Jan Hejátko Masarykova univerzita, Laboratoř funkční genomiky a proteomiky.
Transkripce (první krok genové exprese)
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Opakování 1. K čemu slouží DNA? 2. Kde jsou umístěny chromozomy?
VY_32_INOVACE_2_1_03_Chromozomy
Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,
1 Škola:Chomutovské soukromé gymnázium Číslo projektu:CZ.1.07/1.5.00/ Název projektu:Moderní škola Název materiálu:VY_32_INOVACE_BIOLOGIE 2_20 Tematická.
Genetická diverzita hospodářských zvířat
Chromozóm, gen eukaryot
Nukleové kyseliny NA = nucleic acid Reprodukce organismů
Základy molekulární taxonomie J.Flegr, Praha 2008.
Molekulární biologie v oboru šlechtitelské praxe vojtech pivnicka.
STRATEGIE MOLEKULÁRNÍ GENETIKY
Struktura lidského genu
Genomika hospodářských zvířat
Použití molekulárních znaků v systematice
Projekt lidského genomu: stručná historie a biologie
rozdělení metod využitelnost jednotlivých metod náročnost metod používání metod perspektivy.
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
Ochrana rostlinného a živočišného genofondu
Klinická cytogenetika - metody
Informační zdroje pro molekulární biologii M. Jurajda.
Polymorfismus lidské DNA.
Fyziologie reprodukce a základy dědičnosti FSS 2009 zimní semestr D. Brančíková.
EXPRESE GENETICKÉ INFORMACE Transkripce
DNA diagnostika.
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“
GENETIKA.
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
GENETIKA.
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Ildikó Németh, Marek Motola, Tomáš Merta
2014 Marek Vácha. Projekt lidského genomu  přírodní vědy dosáhly působivých poznatků ve zkoumání external Universe, vnějšího světa  seriózně se mluví.
Praktikum z genetiky rostlin JS 2014 Genetická analýza a genetické markery Genetická analýza a identifikace počtu genů odolnosti k padlí u ječmene. Určení.
Praktikum z genetiky rostlin JS Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana Genetické mapování genu odolnosti k padlí.
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
Vítězslav Kříž, Biologický ústav LF MU
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
SMAMII-8 Detekce polymorfismů v genomech. Metody molekulární diagnostiky Se zaměřují na vyhledávání rozdílů v sekvencích DNA a Identifikaci polymorfismů.
Exonové, intronové, promotorové mutace
Biotechnologie, technologie budoucnosti Aleš Eichmeier.
Genetika člověka – cytogenetické a molekulární metody Autor: Mgr. Jitka MaškováDatum: Gymnázium, Třeboň, Na Sadech 308.
Selekční postupy ve šlechtění rostlin I. Selekce = výběr Charles Darwin ( ) Darwinova evoluční teorie počítá s výběrem a rozmnožováním lépe.
Projekt HAPMAP Popis haplotypů
Nepřímá DNA diagnostika
Exonové, intronové, promotorové mutace
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu
Struktura lidského genu
NÁZEV ŠKOLY: ČÍSLO PROJEKTU: NÁZEV MATERIÁLU: TÉMA SADY: ROČNÍK:
GENETICKÁ A FENOTYPOVÁ
Jana Michalová Tereza Nováková Radka Ocásková
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
Studium lidského genomu
Praktikum z genetiky rostlin
Dominika verešová Kateřina Sapáková
Molekulární základ dědičnosti
1. Regulace genové exprese:
genetická informace jako „vstupenka“ do 21. století
NUKLEOVÉ KYSELINY Dusíkaté báze Cukry Fosfát guanin adenin tymin
Exonové, intronové, promotorové mutace
Transkript prezentace:

Projekt HUGO – milníky - I 1987 byla připravena první mapa lidského genomu získaná metodou polymorfismu délky restrikčních fragmentů (RFLP = restriction fragment length polymorphism) byly připraveny umělé kvasinkové chromozómy, tzv. YAC, které umožňují klonovat dlouhé úseky DNA

Příklad DNA fingerprintu

Hodnocení DNA fingerprintu Komu patří vzorek krve ?

Projekt HUGO – milníky - II 1989 byly nalezeny markery pro mapování lidského genomu, tzv. mikrosatelity dva až čtyři páry bazí dlouhé opakující se sekvence jejichž druh a počet je u každého lidského jedince odlišný jsou použitelné k identifikaci podobně jako otisky prstů druhá mapa lidského genomu roce 1992 byla na bázi mikrosatelitů

Projekt HUGO – milníky - III 1990 byl zahájen projekt mapování lidského genomu, zahájili jej U.S. Department of Energy (měli zájem sledovat vliv záření na lidskou populaci) a National Institute of Health U.S.A 1990 - byly připraveny umělé bakteriální chromozómy, tzv. BAC, které umožňují klonovat dlouhé úseky DNA

Projekt HUGO – milníky - IV 1996 byla zveřejněna kompletní genetická mapa myši domácí (Mus musculus) byl sekvencován kompletní genom Saccharomyces cerevisiae byl sekvencována první archaebakterie Metanococcus jannaschi

Projekt HUGO - milníky - V 1998 soukromá společnost Celera Genomics se rozhodla sekvencovat lidský genom 1999 byl sekvencován lidský chromozóm č. 22 2001 zveřejněna sekvence lidského genomu, 3 miliardy dolarů, Celera vystačila s částkou 10x nižší www.ncbi.nlm.nih.gov

Výsledky projektu HUGO - I 1) Bylo sekvencováno celkem 2,91 miliard bp 2) Celkem bylo vytvořeno 27 271 853 záznamů o sekvencování 3) Tzn., že bylo přečteno 14,8 miliard bp 4) Celý genom byl tedy přečten celkem 5,11x 5) DNA pocházela od 5 jedinců

Výsledky projektu HUGO - II 6) Analýzou bylo odhaleno celkem 26 588 protein kódujících sekvencí 7) Jen 1,1% genomu je pokryta exony, 24% tvoří introny, 75% jsou intergenové oblasti 8) Odhaleno bylo 2,1 milionu SNP 9) Jeden lidský genom se od druhého liší průměrně každých 1250 bp

První individuální genom - 2007 americký genetik Craig Venter, šéf Celera Genomics Venter Institute v marylandském Rockville Etika – osobní informace ! (sklon ke kardiovaskulárním chorobám, Alzheimerova choroba) Celkem se dvě sady Venterových chromozomů liší v 0,5% svých sekvencí. To je asi sedmkrát větší variabilita, než jaká byla odhadována Cena za přečtení lidské DNA půjde pod 1 000 USD !

Konečný cíl – pochopení biologie lidského genomu Strukturní informace přenést směrem k funkční charakterizaci Sekvencování genomu šimpanze - studium nervové činnosti - co nás dělá lidskými bytostmi Analýza genomů modelových zvířat - hledání konzervovaných homologických lokusů - studium funkce lidských genů v jednoduchých systémech