Nová mutace v genu ATP8B1/FIC1 u nemocného s benigní rekurentní intrahepatální cholestázou Nová mutace v genu ATP8B1/FIC1 u nemocného s benigní rekurentní.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Výsledky molekulárně genetických vyšetření u CMT choroby v České republice MUDr. P. Seeman.
Advertisements

Vrozené poruchy sluchu
TROMBOFILNÍ MUTACE A RIZIKOVÉ FAKTORY U MLADÝCH DÍVEK ČESKÉ POPULACE UŽÍVAJÍCÍCH HORMONÁLNÍ ANTIKONCEPCI MUDr. Zdenka Vlčková GHC GENETICS, s.r.o. –
1.
JÁTRA.
(MNOHOČETNÝ) MYELOM.
1 2 FUNKČNÍ VARIANTA GENU ANXA11 SNIŽUJE RIZIKO ONEMOCNĚNÍ SARKOIDÓZOU: POTVRZENÍ VÝSLEDKŮ CELOGENOMOVÉ ASOCIAČNÍ STUDIE. Sťahelová A. 1, Mrázek F. 1,
IKTERUS - DIFERENCIÁLNÍ DIAGNOSTIKA as. MUDr. Lochmanová Jindra
Typická diagnostická kritéria pro chorobu Charcot-Marie-Tooth typ I
PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 G1.
Familiární hyperbilirubinémie
DIAGNOSTIKA AKUTNÍHO ZÁNĚTU V ORDINACI PRAKTICKÉHO LÉKAŘE
Celiakální sprue z pohledu praktického lékaře
Synoviální sarkom Ravčuková B1. , Kadlecová J1. , Štěrba J 2
PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 C1.
Imunologické, mikrosatelity, SSCP, SINE
Molekulární diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A., Kadlecová J., Ravčuková B., Kroupová P., Valášková I. a Gaillyová R. Odd. lékařské genetiky,
PCR. Polymerase chain reaction PCR Je technika, která umožňuje v krátkém času namnožit daný kus DNA bez pomoci buněk užívá se, pokud je DNA velmi malé.
Projekt HUGO – milníky - I
Diabetes v těhotenství
Muskulární dystrofie typu Duchenne (Becker) B. Ravčuková , J
STRATEGIE MOLEKULÁRNÍ GENETIKY
(genové mutace, otcovství, příbuznost orgánů při transplantacích) RNA
RNA diagnostika neurofibromatózy typu 1 Kratochvílová A. , Kadlecová J
PRIMÁRNÍ IMUNODEFICIENCE
PREVENCE genetických patologických stavů (GPS). Prognózování GPS a genetické poradenství Principem genetického prognózování je předpovědění vzniku určitého.
Imunodeficience Kurs Imunologie.
Inspirováno přednáškou Doc. MUDr. Ondrejčáka, CSc.
První prenatální diagnostika u choroby Charcot-Marie-Tooth typ 1A v ČR. P. Seeman 1, M. Čtvrtečková 1, A. Lipková 2 1-Klinika dětské neurologie 2. LF UK.
Zkušenosti s diagnostikou a péčí o pacienty s chorobami CMT
F.I.S.H. hotovo.
DNA diagnostika syndromu
Polymorfismus lidské DNA.
Autor: Milan Blaha Konzultant: Prof. MVDr. Jan Motlík, DrSc.
Fyziologie reprodukce a základy dědičnosti FSS 2009 zimní semestr D. Brančíková.
MLPA MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION
Cystická fibróza Autosomálně recesivní onemocnění (postiženi jsou homozygoti, heterozygoti jsou přenašeči) Frekvence přenašečů - etnická variabilita,
OŠETŘOVATELSKÁ PÉČE O NEMOCNÉHO PO OPERACI PRSU
Analýza mutace C282Y v genu pro hemochromatózu
DNA diagnostika.
Náplň praktik Izolace vlastní DNA PCR - namnožení genů CFTR a HFE
DNA diagnostika II..
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“
Cystická fibrosa.
IKTERUS.
Molekulární biotechnologie Č.3. Izolace cílového fragmentu DNA (genu) Který představuje malou část genomu (0.02% u E.coli) Umožňují genové či genomové.
OŠETŘOVÁNÍ DÍTĚTE S CYSTICKOU FIBRÓZOU
Glomerulární onemocnění (nefritický a nefrotický syndrom) typové kasuistiky morfologický obraz MUDr. Zdeňka Vernerová, CSc., MUDr. Martin Havrda.
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
Choroby jater a žlučových cest
Sekvencování DNA stanovení pořadí nukleotidů v molekule DNA (primární struktury)
SMAMII-8 Detekce polymorfismů v genomech. Metody molekulární diagnostiky Se zaměřují na vyhledávání rozdílů v sekvencích DNA a Identifikaci polymorfismů.
Exonové, intronové, promotorové mutace
Cystická fibróza Soňa Kundová, Lucie Lžičařová, Lenka Tomanová, Anna Kutíková, Lucia Macková.
Hereditární nádorové syndromy spojené s karcinomy kolorecta MUDr. Dagmar Štenglová, Genetika Plzeň s.r.o.
RNA savčí buňka: pg celkové RNA rRNA (28S,18S, 5S) 80-85% tRNA, snRNA 15-20% mRNA 1-5% mRNA molekul/buňku, tj rozdílných transkriptů.
Biotechnologie, technologie budoucnosti Aleš Eichmeier.
Wilsonova choroba AR dědičné onemocnění Cu je patologicky akumulována játra, nervový systém rohovka, ledviny další tkáně.
Detekce mutací v myelin protein zero (MPZ) genu u pacientů s dědičnými neuropatiemi – první nálezy mutací v ČR P. Seeman, P. Šušlíková, V. Beneš, M. Čtvrtečková,
Environmentální aplikace molekulární biologie
Cystická fibróza Doleželová Eva, Faltus Petr, Ďurovec Oliver, Štulrajter Marek, Ondřej Dohnal, Aleš Dvořák, Richter Jan.
Nepřímá DNA diagnostika
Exonové, intronové, promotorové mutace
Pacient č. 2.
Organizace lidského genomu, mutace a instabilita lidské DNA
Nejasný kolonoskopický nález
Molekulární biotechnologie
1. Regulace genové exprese:
Kolitida nejasné etiologie
Mgr. Martina Dohnalová Hepatitis.
Transkript prezentace:

Nová mutace v genu ATP8B1/FIC1 u nemocného s benigní rekurentní intrahepatální cholestázou Nová mutace v genu ATP8B1/FIC1 u nemocného s benigní rekurentní intrahepatální cholestázou Jirsa M., Budišová L., Taimr P., Cebecauerová D., Dvořáková L., Hřebíček M., Brodanová M., Vítek L., Wurm P., Hůlek P. Podpořeno grantem IGA MZ ČR reg.č. NM/

Benigní rekurentní intrahepatální cholestáza (BRIC, syndrom Summerskill- Walsheův) Geneticky podmíněná intrahepatální cholestáza Ataky žloutenky provázené úporným svěděním Manifestace obvykle do konce 2. dekády, trvání ataky týdny až řadu měsíců, počet atak 1 až 30 za život Laboratorně hyperbilirubinémie, zvýšená aktivita ALP a koncentrace sérových žlučových kyselin Normální S-GMT a cholesterol Prognóza většinou dobrá, asi 6% progreduje v cirhózu

Protein ATP8B1/FIC1 Exprimovaný v apikální membráně hepatocytů, cholangiocytů, enterocytů a acinárních buněk pankreatu, nízká exprese v řadě dalších tkání Funkce neznámá, hypotézy: flipáza membránových fosfolipidů transportér hydrofobních žlučových kyseli iontový kanál

Gen ATP8B1/FIC1 je lokalizovaný na 18q21, zaujímá 98kb sestává z 27 exonů kóduje ATPasu o MW 140 kDa

mutaceexondůsledekzdroj T1982C17I661TBull del920795delGNRBull 1998 Splice site24Skipped exonvan Ooteghem 2002 Mutace v genu ATP8B1/FIC1 asociované s BRIC

Pacient M.K. – anamnéza RA: negativní 1972 protrahovaná novorozenecká žloutenka 1973 žloutenka po varicele, závěr nejasný, léčba kortikoidy 1975 dvouměsíční ataka žloutenky 1976 roční ataka, chir. revize žluč. cest bez patol. nálezu 1990 po sinusitidě další ataka, vyloučena IHE, normální ERCP, závěr nejasný, opět léčen kortikoidy x jaterní biopsie 1998 další ataka, hosp. na Ústavu Klin. Imunologie LFHK OA, NO:

Pacient M.K. – laboratorní nálezy, USG a ERCP FW 50/86 KO: anémie, leuko 12 Hyperbilirubinémie, ALP 14,4  kat/l, celk. žluč. kyseliny 220  mol/l GMT a cholesterol opakovaně normální Fe, transferin, Cu, ceruloplasmin, alfa1-AT v normě Imunologická vyšetření v normě USG jater a žluč. cest bez patol. nálezu ERCP bez patol. nálezu 4. jaterní biopsie: intrahepatální cholestáza bez známek přestavby

Určení sekvence ATP8B1/FIC1 z genomové DNA Izolace genomové DNA z periferních leukocytů  PCR amplifikace jednotlivých exonů  Agarosová elektroforéza  Izolace produktů z gelu  Sekvenační PCR s univerzálními značenými primery  Sekvenování

M.K. – heterozygotní bodová mutace v 17. exonu ATP8B1 T1982T+C  M.K. kontrola...GCTACAAGGAAATTGAAGAAAAAGAATTTACA......CGATGTTCCTTTAACTTCTTTTTCTTAAATGT... Tsp509I 95 bp14 bp

M.K. – heterozygotní delece ve 24. exonu ATP8B1 Mutovaná alela: G G G G A C A T C G A T G... Normální alela : G G G G T C C T A A C A T... del3122TCCTA ...CTTGTTGCATGGGGTCCTAACATCGATGATC......GAACAACGTACCCCAGGATTGTAGCTACTAG... M.K. kontrola EcoO109I 715 bp220 bp

Vyšetření rodiny Restrikční analýza delece v 24. exonuRestrikční analýza mutace v 17. exonu MK PeKPaKPV

Ověření sekvence exonu 24 genu ATP8B1/FIC1 z klonovaného fragmentu DNA PCR amplifikace exonu 24 z genomové DNA  Agarosová elektroforéza, izolace produktu  ligace do vektoru pCR2.1-TOPO (Invitrogen)  Transformace buněk TOP10 (Invitrogen)  Kultivace transformovaných buněk, selekce klonů, izolace plasmidů  Sekvenační PCR s univerzálními značenými primery  Sekvenování

M.K. – sekvence mutované klonované alely 24. exonu genu ATP8B TGGGGTCCTAACATCGATGATCCTCTTCTTCATAC 3122  TTGATGTTAGGACATCGATG 3131 (3136 normální sekvence)  ACATCGATGTTGATGTTAGG

Potvrzení delečně - inzerční mutace metodou RFLP...CTTGTTGCATGGGGTCCTA ACATCGATGATC......GAACAACGTACCCCAGGAT TGTAGCTACTAG... EcoO109I202 bp167 bp...CTTGTTGCATGGGGACATCGATGTTGATGTTAGGACATCGATGATC......GAACAACGTACCCCTGTAGCTACAACTACAATCCTGTAGCTACTAG... Bsp143I 167 bp233 bp 16 bp

Závěr I 1. 1.Fenotyp choroby je u studovaného nemocného podmíněn dvěma různými mutacemi v genu ATP8B1/FIC Bodová mutace T1982C (I661T) je známá mutace asociovaná s BRIC bez progrese jaterního onemocnění 3. 3.Mutace v pozici 3122 je dosud neznámá delečně - inzerční mutace, jejímž důsledkem je záměna dvou hydrofobních aminokyselin 1041 Val-Leu uprostřed 7. membránové domény proteinu ATP8B1/FIC1 za Asp - -Ile-Asp - -Val-Asp - -Val-Arg + vedoucí pravděpodobně k chybnému vložení proteinu do buněčné membrány a tím k narušení jeho funkce

Závěr II 4. 4.Studovaný nemocný je prvním případem složeného heterozygota s BRIC 5. 5.Mutace nalezená v exonu 24 je novou v pořadí čtvrtou mutací nalezenou u pacienta s tímto onemocněním 6. 6.Prognóza pacienta M.K. je vzhledem k heterozygotnímu stavu pro mutaci T1982C (I661T) pravděpodobně příznivá

? Máte v péči nemocné s chronickou cholestázou či s konjugovanou hyperbilirubinémií nejasné etiologie? Nabízíme spolupráci při jejich vyšetřování. Kontakt: MUDr. Milan Jirsa, CSc. Laboratoř experimentální hepatologie IKEM