MiRNA 1.12.2009.

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
Molekulární základy dědičnosti
Advertisements

Transkripce, translace, exony, introny
Transkripce (první krok genové exprese: Od DNA k RNA)
BIOLOGIE 1 Rostliny Biologické vědy Metody práce v biologii
GENETIKA NUKLEOVÉ KYSELINY DNA, RNA
Studium lidského genomu
Kvantitativní RT-PCR Praha
Transkripce (první krok genové exprese)
Transkripce (první krok genové exprese)
Transkripce a translace
Obecná endokrinologie
REGULACE GENOVÉ EXPRESE
PCR. Polymerase chain reaction PCR Je technika, která umožňuje v krátkém času namnožit daný kus DNA bez pomoci buněk užívá se, pokud je DNA velmi malé.
RNAi.
Nukleové kyseliny Struktura DNA a RNA Milada Roštejnská Helena Klímová
METABOLISMUS BÍLKOVIN II Anabolismus
NUKLEOVÉ KYSELINY A JEJICH METABOLISMUS
Transkriptom.
(genové mutace, otcovství, příbuznost orgánů při transplantacích) RNA
Nukleové kyseliny Nukleové kyseliny (NA) jsou makromolekulární látky a spolu s bílkovinami tvoří nejdůležitější látky v živé hmotě. Funkce: V molekulách.
Molekulární základy dědičnosti
Pro charakteristiku plazmidu platí: je kruhová DNA
Molekulární genetika.
Nukleové kyseliny RNDr. Naďa Kosová.
prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Od DNA k proteinu.
Molekulární biotechnologie č.6b Zvýšení produkce rekombinatního proteinu.
GENETICKÁ INFORMACE je informace, která je primárně obsažena v nukleotidové sekvenci v nukleotidových sekvencích jsou obsaženy následující informace: o.
Autor: Milan Blaha Konzultant: Prof. MVDr. Jan Motlík, DrSc.
Fyziologie reprodukce a základy dědičnosti FSS 2009 zimní semestr D. Brančíková.
EXPRESE GENETICKÉ INFORMACE Transkripce
RNAi. Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor) Místo silné pigmentace se objevily rostliny variegované.
Epigenetika člověka Marie Černá
Nukleové kyseliny Přírodní látky
Nekódující RNA Radim Černý Přednáška pro 14. vědecko-pedagogickou konferenci učitelů biochemických oborů lékařských fakult v ČR a SR
Analýza mutace C282Y v genu pro hemochromatózu
PCR Polymerase Chain Reaction
DNA diagnostika II..
Transkripce a translace
2014 Výukový materiál GE Tvůrce: Mgr. Šárka Vopěnková Projekt: S anglickým jazykem do dalších předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.36/
Farmakogenetika Cíl Na základě interdisciplinárního integrace znalostí farmakologie a genetiky popsat vliv dědičnosti na odpověď organismu.
Mikročipy ..
Molekulární biotechnologie č.10a Využití poznatků molekulární biotechnologie. Molekulární diagnostika.
SMAMII-8 Detekce polymorfismů v genomech. Metody molekulární diagnostiky Se zaměřují na vyhledávání rozdílů v sekvencích DNA a Identifikaci polymorfismů.
RNA savčí buňka: pg celkové RNA rRNA (28S,18S, 5S) 80-85% tRNA, snRNA 15-20% mRNA 1-5% mRNA molekul/buňku, tj rozdílných transkriptů.
Biotechnologie, technologie budoucnosti Aleš Eichmeier.
Základy molekulární genetiky. Bílkoviny Makromolekuly složené z aminokyselin jedna molekula bílkoviny tvořena obvykle stovkami aminokyselin v živých organismech.
Autor: Ing. Michal Řehulka  Přírodní makromolekulární látky (Biopolymery)  Vytvářejí dlouhé vláknité molekuly  Nesou a uchovávají genetickou informaci.
Replikace genomu Mechanismus replikace Replikace u bakterií Replikace u eukaryotnich buněk.
EU peníze středním školám Název vzdělávacího materiálu: Nukleové kyseliny II. - RNA, proteosyntéza Číslo vzdělávacího materiálu: ICT10/16 Šablona: III/2.
1. 1.Molekulární podstata dědičnosti. Čtyři hlavní skupiny organických molekul v buňkách.
Herpetické viry-úvod RNDr K.Roubalová CSc..
qRT-PCR Kryostat Mgr. Jiřina Medalová, Ph.D. Mgr. Martina Lánová RNDr. Josef Večeřa, Ph.D. Bc.
TRANSKRIPCE DNA.
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu
Metabolické děje II. – proteosyntéza
Nukleové kyseliny Charakteristika: biopolymery
RT – PCR: návrh primerů.
Mutace.
Ivana Eštočinová, Pavla Fabulová, Markéta Formánková
Studium lidského genomu
Od DNA k proteinu - v DNA informace – geny – zápis ve formě 4 písmen = nukleotidů = deoxyribóza, fosfátový zbytek, báze (A, T, C, G) - DNA = dvoušroubovice,
Molekulární základ dědičnosti
1. Regulace genové exprese:
Molekulární základy genetiky
NUKLEOVÉ KYSELINY Dusíkaté báze Cukry Fosfát guanin adenin tymin
INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ
37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
Zdvojování genetické paměti - Replikace DNA
Transkript prezentace:

miRNA 1.12.2009

miRNA Kompletace projektu Human Genome v roce 2003 potvrdila hypotézu, že velká část genomu není přeložena do bílkovin. Tato tzv. “junk” DNA se považovala za evoluční debris bez zvláštní funkce. Nyní je známo, že část této DNA je velmi relevantní v regulaci genové exprese. Zatím bylo identifikováno asi 1000 lidských sekvencí miRNA, z nichž každá má možnost stovek mRNA cílů. Zatím je význam této molekuly DNA podceněn vzhledem k tomu, že funkce miRNA se projevuje prakticky ve všech biologických procesech včetně rakovin, regulace kmenových buněk, imunitních funkcí, neurogeneze, metabolismu a mnohých jiných. Expresní vzorce miRNA se považují za novou třídu biomarkerů pro fenotypy onemocnění a tkáňové klasifikace s větším predikčním potenciálem, než mají biomarkery v kódujících sekvencích.

miRNA Zralé microRNA (miRNA) jsou malé jednořetězcové molekuly RNA, typicky s 22 nukleotidy. Poprvé byly identifikovány u organismu Caenorhabditis elegans v roce 1993, dosud identifikovány u mnoha druhů živočichů i rostlin. Tyto typy RNA jsou původně transkribovány jako větší RNA dlouhé stovky až tisíce bazí (primární miRNA- pri-miRNA). Ty jsou v jádře přeměněny na prekurzorové miRNA (pre-miRNA), exportované do cytoplasmy. RNáza III je dále mění na kratší RNA duplexy známé jako miRNA. Tato miRNA je potom rozvinuta a jeden řetězec je inkorporován do komplexu RNA-induced silencing complex (RISC). Tento komplex navádí miRNA na její cílovou messenger RNA (mRNA) pomocí nepřesné vazby na její 3’-nekódující oblast (3’-UTR). Vazba tohoto komplexu na cílovou mRNA inhibuje translaci a tedy také syntézu kódovaného proteinu, ale může způsobit také degradaci této mRNA. Nepřesný způsob párování bazí dané 7-nukletidovou “seed region” v miRNA umožňuje jednořetězcové miRNA regulovat mnoho genů s homologními sekvencemi v cílových oblastech. V lidském genomu bylo dosud identifikováno více než 700 genů pro miRNA (http://microrna.sanger.ac.uk/). Předpokládá se, že 30% lidských genů je regulováno miRNA.

A: první způsob RT real time PCR eseje pro detekci miRNA Sekvenčně specifické RT primery , navržené tak, aby se vázaly na 3´konec miRNA, pomocí kterých se konvertuje miRNA do cDNA. Pro vlastní real-time PCR detekci se používá 5´primer ( s vazbou na 5´oblast miRNA), univerzální reverzní primer a 5´nukleázová hydrolyzační sonda, která označí část sekvence miRNA a část sekvence reverzního primeru.

B: použití RNA (A) polymerázy RNA (A) polymeráza přidá na 3´konec miRNA poly(A) řetězec. Pak se přidá univerzální RT primer, který konvertuje miRNA do cDNA. miRNA specifický primer (celá sekvence mRNA) a univerzální reverzní primery jsou použity pro identifikaci miRNA pomocí SYBR Green real time PCR esej.