Stáhnout prezentaci
Prezentace se nahrává, počkejte prosím
1
Exonové, intronové, promotorové mutace
Michal Jurajda
2
Základní pojmy-opakování
Genom Geny Lokusy Alely
3
Mutace Změna v genetickém kódu (v pořadí bází) v genetické výbavě jedince. Za mutace nepovažujeme jiné změny DNA jako třeba methylace bází, které mohou být také vertikálně přenášeny.
4
Mutace – dle rozsahu Mutace Genové (bodové) Chromozomální Genomové
5
Genomové mutace/aberace
Změna počtu celé sady chromozomů např. triploidie polyploidie
6
Chromozomální mutace/aberace
Změna počtu – numerické aberace Monozomie, trizomie, nulizomie Změna struktury – strukturní aberace Intrachromozomální Interchromozomální Typy Delece, inzerce, duplikace, translokace, transpozice, inverze
7
Genové mutace Změna počtu bází v rámci genu Delece/inzerce Transice
jednonukleotidové, vícenukleotidové Transice purinpurin, pyrimidin pyrimidin Transverze purinpyrimidin, pyrimidin purin
8
Hot spots Na některých místech v genomu se objevují mutace častěji, než by odpovídalo absolutní náhodnosti s rovnoměrnou pravděpodobností po celém genomu.
9
Příčiny vzniku mutací Zevní Vnitřní
Fyzikální (UV – dimery thyminu, ionizující záření) Chemické Biologické (viry) Vnitřní Chyba při duplikaci DNA SHM (somatic hypermutation) proces diversifikace imunoglobulinových genů.
10
Typy mutací podle dědičnosti
Mutace somatické, nepřenosné na potomky (vyjímka rostliny) Mutace zárodečné
11
Somatické mutace Týkají se jedné somatické buňky
Pokud se buňka dělí může vzniknout klon buněk nesoucí danou mutaci. Vznik nádorových klonů Klonální diferenciace, selekce
12
Zárodečné mutace Přítomné ve všech buňkách postiženého organismu
Přenosné na další generace
13
Vliv mutace na „fitness“ organismu
Je relativní s ohledem na zevní podmínky Pozitivní Negativní Neutrální
14
Mutace a polymorfismy Každá nová změna sekvence DNA v populaci se objevuje ve formě mutace. Vyskytne se jen u jednoho jedince v populaci a pokud je zárodečná dostává se do dalších generací.
15
Mutace x polymorfizmy Mutace Genetické polymorfizmy
Selekce Neutrální mutace – genetický drift Genetické polymorfizmy Populační četnost vzácnější alely aspoň 1% SNP, mikrosatelity (VNTR) do 4bp, minisatelitní sekvence
16
Funkční význam mutací Promotor Exon-intron Exony
Orgánově specifické promotory Exon-intron Splice site mutations Alternativní sestřih, posun čtecího rámce Exony Změna sekvence AK
17
Genetický kód je degenerovaný
Bodové mutace tranzice A G, C T transverze A/G C/T
18
Bodové mutace v kódující oblasti genu
Silent mutations: kódují stejnou aminokyselinu Neutral mutations: kódují podobnou aminokyselinu Missense mutations: kódují jinou aminokyselinu Nonsense mutations: kódují STOP kodon a zkracují protein
19
Inzerce Delece Jedna nebo více bází
replikace repetitivních sekvencí, transpozony Změna čtecího rámce Splice site mutations Delece
20
Chromozomální aberace - strukturální
Amplifikace Delece Translokace Inverze Fúzní geny: bcr-abl
21
Mutace z hlediska Medelovské genetiky
Recesivita Jedna funkční alela stačí udržet funkci Porucha se objeví za přítomnosti dvou nefunkčních alel, recesivní homozygot nebo složený heterozygot Dominance Výskyt jedné „vadné“ alely způsobí rozvoj chorobného fenotypu Kodominance
22
Hardy-Weinberg equilibrium
p q (p+q)2=1
23
LOH Loss of heterozigosity
Ztráta heterozygotnosti – např. u nádorových bb.
24
Nomenklatura DNA Protein rs6200616T 76A>C , 76_78del , 76_77insT
M235T, ΔF508 rs T Jedinečný identifikátor mutace/polymorfismu
Podobné prezentace
© 2024 SlidePlayer.cz Inc.
All rights reserved.