P o l y p l o i d i e Polyploidie  zmnožení chromozómových sad

Slides:



Advertisements
Podobné prezentace
PLAYBOY Kalendar 2007.
Advertisements

PKML.
Stodůlky 1977 a 2007 foto Václav Vančura, 1977 foto Jan Vančura, 2007.
Města ČR – orientace na mapě
Role průtokové cytometrie v biosystematice rostlin
*Zdroj: Průzkum spotřebitelů Komise EU, ukazatel GfK. Ekonomická očekávání v Evropě Březen.
Aktuální informace o vyšetřování c-erb-2 genu v referenční laboratoři a návrh změny v indikačních kritériích Hajdúch M., Petráková K., Kolář Z., Trojanec.
Magnetohydrodynamický (MHD) generátor
Základní genetické pojmy – AZ kvíz
Principy FCM Průtoková komůrka Optická část Základní předpoklady:
Téma 3 ODM, analýza prutové soustavy, řešení nosníků
Pracovní metody v botanice: karyologie + průtoková cytometrie
Tomáš NETERDA 1961 Sportovní kariéra : plavecké třídy ZŠ Komenského gymnázium Dašická plavecká škola
Násobíme . 4 = = . 4 = = . 4 = = . 2 = 9 .
Zápis čísla v desítkové soustavě
Kdo chce být milionářem ?
Výzkumy volebních preferencí za ČR a kraje od
NÁSOBENÍ ČÍSLEM 10 ZÁVĚREČNÉ SHRNUTÍ
Téma: SČÍTÁNÍ A ODČÍTÁNÍ CELÝCH ČÍSEL 2
Vizualizace projektu větrného parku Stříbro porovnání variant 13 VTE a menšího parku.
Vzdělávací materiál / DUMVY_32_INOVACE_02B14 Příkazový řádek: obsah souborů PŘÍKLADY AutorIng. Petr Haman Období vytvořeníLeden 2013 Ročník / věková kategorie3.
Výukový matriál byl zpracován v rámci projektu OPVK 1
VY_32_INOVACE_INF_RO_12 Digitální učební materiál
Dělení se zbytkem 3 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA reg. č.: CZ.1.07/1.4.00/ Základní škola, Šlapanice, okres Brno-venkov, příspěvková organizace Masarykovo nám.
Markéta Zakouřilová ZŠ Jenišovice VY_32_INOVACE_169
VY_32_INOVACE_ 14_ sčítání a odčítání do 100 (SADA ČÍSLO 5)
Očísluj dopisy násobky čísla 2
Zábavná matematika.
Projekt PŘEDPOVĚĎ POČASÍ. projekt PŘEDPOVĚĎ POČASÍ.
V rámci všech serverů společnosti Aliaweb, spol. s r.o. oslovíte přes uživatelů Kurzy.cz finanční portál pro laiky i odborníky, tj. investice a.
Dělení se zbytkem 6 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
Dělení se zbytkem 5 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
Vlastnosti sčítání a odčítání
Letokruhy Projekt žáků Střední lesnické školy a střední odborné školy sociální ve Šluknově.
Očísluj dopisy násobky čísla 2
Stav studie „Seroprevalence VHC u injekčních uživatelů drog“ k Národní monitorovací středisko pro drogy a drogové závislosti Úřad vlády ČR tel.
Jazyk vývojových diagramů

Nejmenší společný násobek
Čtení myšlenek Je to až neuvěřitelné, ale skutečně je to tak. Dokážu číst myšlenky.Pokud mne chceš vyzkoušet – prosím.
Únorové počítání.
52_INOVACE_ZBO2_1364HO Výukový materiál v rámci projektu OPVK 1.5 Peníze středním školám Číslo projektu:CZ.1.07/1.5.00/ Název projektu:Rozvoj vzdělanosti.
EKONOMICK É INFORMACE pro jedn á n í Předsednictva RV Š
Dělení se zbytkem 8 MODERNÍ A KONKURENCESCHOPNÁ ŠKOLA
Náhoda, generátory náhodných čísel
Sexuální život u pacientů s mentálním postižením v ÚSP
Zásady pozorování a vyjednávání Soustředění – zaznamenat (podívat se) – udržet (zobrazit) v povědomí – představit si – (opakovat, pokud se nezdaří /doma/)
TRUHLÁŘ II.ročník Výrobní zařízení Střední škola stavební Teplice
Cvičná hodnotící prezentace Hodnocení vybraného projektu 1.
Nový trend ve slunolamech Radek Pelz, ALARIS Czech Republic s.r.o.
Projekt PŘEDPOVĚĎ POČASÍ. projekt PŘEDPOVĚĎ POČASÍ.
EDITOR BY: SPRESS 15. ledna ledna ledna 2015.
DĚLENÍ ČÍSLEM 7 HLAVOLAM DOPLŇOVAČKA PROCVIČOVÁNÍ
MS PowerPoint Příloha - šablony.
1 Celostátní konference ředitelů gymnázií ČR AŘG ČR P ř e r o v Mezikrajová komparace ekonomiky gymnázií.
Technické kreslení.
Úkoly nejen pro holky.
Analýza a třídění chromozomů Pavlína Kovářová
Základní škola Podbořany, Husova 276, okres Louny
Abeceda VY_32_INOVACE_122, 7. sada, ČJ2 Český jazyk, 2. ročník ANOTACE
 Co je strategie? Dlouhodobý plán č inností zam ěř ený na dosa ž ení cíle Z ř eckého „strategos“ – generál - vedení  Rozdíl mezi strategií a taktikou?
Přednost početních operací
DĚLENÍ ČÍSLEM 5 HLAVOLAM DOPLŇOVAČKA PROCVIČOVÁNÍ Zpracovala: Mgr. Jana Francová, výukový materiál EU-OP VK-III/2 ICT DUM 50.
Predikce chemických posunů
Dostupné z Metodického portálu ISSN: , financovaného z ESF a státního rozpočtu ČR. Provozováno Výzkumným ústavem pedagogickým v Praze.
KONTROLNÍ PRÁCE.
Porovnání výroby a prodejů vozidel ve světě
Aplikace průtokové cytometrie ve šlechtění rostlin
Transkript prezentace:

Mikroevoluce u polyploidů - co nám řekne průtoková cytometrie J a n S u d a

P o l y p l o i d i e Polyploidie  zmnožení chromozómových sad  násobek čísla x  auto x allopolyploidie  výhody polyploidů  polytopní vznik  nejčastěji neredukované gamety 1 z 40

R e k o r d y Haplopappus gracilis 2n = 4 Ophioglossum reticulatum 2n = 96x = 1440 Sedum suaveolens 2n = 80x = 640 Voaniola gerardii - 2n = 50x = 596 Viola modesta 2n = 4 2 z 40

R e k o r d y Somatická polyploidie  endopolyploidie  Scilla, Beta (70-80 % buněk)  často u malých genomů, zásobních pletiv antipody Triticum chromozómy Secale Pisum sativum dělohy - 64 n Scilla bifolia antipody - 1 024 n elaiosom - 4 096 n Phaseolus coccineus suspensor - 8 192 n Arum alpinum endosperm - 24 576 n 3 z 40

R e k o r d y Velikost genomu - pg DNA / Mbp Arabidopsis thaliana C = 0.1 pg Fritillaria assyriaca C = 127.4 pg Genlisea aurea C = 0.06 pg 4 z 40

R e k o r d y 5 z 40

K d e s e v y s k y t u j e ? Často:  Krytosemenné  Kapraďorosty 90 - 95 %  Řasy allopolyploidie, vysocí polyploidi  Mechorosty někdy až 80 % - x = 5-7 jen do 32n či 16n játrovky - 13 %, hlevíky - 2 % 6 z 40

K d e s e v y s k y t u j e ? Vzácně:  Nahosemenné 11 / 240 druhů - většina 4x  Houby Sequoia sempervirens 2n = 6x = 66 7 z 40

P r ů t o k o v á c y t o m e t r i e Izolované částice Optické parametry:  intenzita fluorescence  přímý a boční rozptyl 8 z 40

M e t o d i k a 9 z 40

V ý h o d y  vysoká rychlost  jednoduchá příprava vzorků  nedestruktivnost  analýza mitoticky neaktivních pletiv  detekce smíšených vzorků  nízká cena 10 z 40

V y u ž i t í Protoplasty Jádra Chromozómy  obsah DNA  obsah RNA  obsah proteinů  obsah chlorofylu  obsah alkaloidů  koncentrace Ca2+  buněčný cyklus  syntéza buněčné stěny  velikost  viabilita  sorting Jádra  obsah DNA  obsah RNA  obsah proteinů  struktura chromatinu  buněčný cyklus  poměr AT/GC  velikost  sorting Chromozómy  obsah DNA  centromerický index  poměr AT/GC  velikost sorting 11 z 40

V y u ž i t í v b o t a n i c e Determinace blízce příbuzných taxonů s různou ploidií se stejnou ploidií Determinace hybridů heteroploidní křížení homoploidní křížení Hledání vzácných cytotypů Rozšíření cytotypů na různých prostorových škálách Evoluční dynamika populací s výskytem více cytotypů Detekce aneuploidů Určení pohlaví u dvoudomých rostlin Detekce endopolyploidizace Detekce agmatopolyploidie Určení reprodukčního způsobu Složení genomu u allopolyploidů Poměr AT / GC bází Určení velikosti genomu 12 z 40

N á v a z n o s t i Morfometrika  nalezení diakritických znaků  rozložení morfologické variability uvnitř a mezi populacemi, rozložení variability na geografickém či ekologickém gradientu Molekulární biologie  odhalení evolučních linií (počet vzniků polyploidů)  tok genů mezi cytotypy Ekologie  rozdíly ve stanovištních nárocích jednotlivých cytotypů 13 z 40

R o z l i š e n í p l o i d i í 14 z 40

R o z l i š e n í p l o i d i í Empetrum Anthoxanthum 2x - E. nigrum 4x - E. hermaphroditum Anthoxanthum 2x - A. alpinum 4x - A. odoratum 160 320 480 640 800 250 500 750 1000 2x 4x Relative fluorescence Number of nuclei 15 z 40

V z á c n é c y t o t y p y Vaccinium - 3x Lythrum - 3x Campanula patula - 8x 16 z 40

H e t e r o p l o i d n í k ř í ž e n c i Oxycoccus - 5x Empetrum - 3x Galeobdolon - 3x 17 z 40

G e n e r o v á n í v a r i a b i l i t y Experimentální hybridizace: 6x (fakultativně apomiktický) x 4x (obligátně apomiktický) Hieracium subg. Pilosella Ploidie potomstva: 6x (apomixie) 3x (haploidní partenogenéze) 5x (redukované gamety) 7x (redukovaná + neredukovaná gameta) 8x (neredukovaná + redukovaná gameta) semenáčky semena 18 z 40

Z m ě n y v p l o i d i i 2n Haploidní Polyploidizace partenogenéze n Hieracium subg. Pilosella 19 z 40

M n o h o r o z m ě r n á m o r f o m e t r i k a  objektivní zhodnocení fenotypové variability  druhově a cytotypově specifické znaky  odlišení kryptických taxonů 20 z 40

H o m o p l o i d n í d r u h y Determinace fragmentů, kořenů, ... H. schultesii 2C=7.21 pg G2 H. aurantiacum 2C=7.80 pg Hieracium subg. Pilosella Reynoutria Determinace fragmentů, kořenů, ... 21 z 40

Elytrigia repens x E. intermedia H o m o p l o i d n í k ř í ž e n c i Elytrigia repens x E. intermedia Dryopteris carthusiana x D. dilatata 22 z 40

D i s t r i b u c e c y t o t y p ů Vaccinium uliginosum Empetrum 2x 23 z 40

D i s t r i b u c e c y t o t y p ů * 2x Empetrum Krkonoše 2x + 3x 3x 4x * 100 m Mumlavská hora Jeřábí louka 24 z 40

S y m p a t r i c k ý v ý s k y t  evoluční historie  demografické parametry  reprodukčně izolační mechanismy  vnitro- a mezi-cytové interakce  ekologická diferenciace  funkce ve společenstvech (interakce) 25 z 40

S y m p a t r i c k ý v ý s k y t Častý jev - významný v mikroevoluci Oxycoccus 2x + 4x + 5x + 6x Pimpinella saxifraga 2x + 4x Hieracium echioides 2x + 3x + 4x Častý jev - významný v mikroevoluci Galeobdolon 2x + 3x + 4x Campanula patula 2x + 4x 26 z 40

O h r o ž e n é d r u h y Gymnadenia conopsea - cytotypová variabilita / morfologické vymezení 27 z 40

O h r o ž e n é d r u h y Cerastium alsinifolium - hybridizace se sympatrickým C. arvense 28 z 40

I n v a z n í d r u h y Vaccinium - 3x Lythrum salicaria 29 z 40 2x 3x

I n v a z n í d r u h y Reynoutria 30 z 40

Heuchera grossulariifolia I n t e r a k c e Thompson et al. (1997, 2004) Heuchera grossulariifolia Greya politella Greya piperella Eupithecia misturata 31 z 40

S l o ž e n í g e n o m u Musa 32 z 40

P ř í b u z e n s k é v z t a h y Hieracium subg. Pilosella 33 z 40 2.05 1.98 1.97 1.88 1.73 1.81 1.95 2.02 2.03 2.14 Velikost genomu 4x Hieracium subg. Pilosella 33 z 40

R e p r o d u k č n í z p ů s o b y 34 z 40

R e p r o d u k č n í z p ů s o b y Taraxacum Hypericum sexuál apomikt velká variabilita Hypericum 35 z 40

morfologická variabilita genetická variabilita S t y l p r a c í morfologická variabilita (statistika) reprodukce (experimentální křížení) genetická variabilita (molekulára + isozymy) problém taxon určení ploidie (cytometrie, karyologie) ekologické parametry (terénní měření) geografie (GIS) sběr materiálu (terén) Co se naučíte:  cytometrické techniky (průtoková, image cytometrie)  karyologické postupy  mnohorozměrné statistiky  molekulární techniky  isozymové techniky 36 z 40

V y b a v e n í Katedra botaniky Botanický ústav Průtokový cytometr Partec PA II Image cytometr Olympus Průtokový cytometr Partec CyFlow Průtokový cytometr Partec CyFlow 37 z 40

P r o b í h a j í c í p r á c e Diplomové práce:  K. Seifertová: Nebezpečí introgresivní hybridizace u hadcového endemita Cerastium alsinifolium  J. Rauchová: Karyologická diferenciace zvonků ze skupiny Campanula rotundifolia na různých prostorových škálách  K. Mozolová: Cytogeografie a populační struktura Pimpinella saxifraga  L. Grattová: Morfologická a fytocenologická diferenciace taxonů rodu Empetrum Doktorské práce:  P. Trávníček: Mikroevoluční procesy v sympatrických populacích více cytotypů  P. Vít: Ochranářská genetika jako nástroj k účinné ochraně ohrožených druhů 38 z 40

K a m s e p ř i d a t ? Arenaria serpyllifolia agg. - rozšíření cytotypů - morfologické charakteristiky Hieracium echioides - prostorová struktura cytotypů - demografie - vztahy mezi jedinci - vliv mykorhizní symbiózy Anthoxanthum - prostorová distribuce - intenzita hybridizace - morfologické odlišení 39 z 40

K a m s e p ř i d a t ? Velikost genomu v sukcesi Polygonum aviculare agg. - morfologická diferenciace - stanovištní preference - četnost hybridizace Velikost genomu v sukcesi Interakce cytotypů s dalšími trofickými úrovněmi (opylovači, herbivoři, mykorhiza) Procesy ve smíšených populacích Chenopodium album - cytotypová variabilita - morfologická diferenciace - vztahy mezi diploidy a polyploidy 40 z 40

www.ibot.cas.cz/fcm