Sacharidová složka nukleotidů

Prezentace na téma: "Sacharidová složka nukleotidů"— Transkript prezentace:

1 Sacharidová složka nukleotidů

2 Heterocyklické organické báze

3 Fosfáty

4 Názvosloví nukleotidů

5

6 PRIMÁRNÍ STRUKTURA NUKLEOVÝCH KYSELIN
je dána pořadím jednotlivých nukleotidů v polynukleotidovém řetězci nukleotidy jsou navzájem spojeny ´, 5´- fosfodiesterovou vazbou –OH skupina na C3 - 3´- konec fosfátová skupina na C5 - 5´- konec

7

8 Strukturní typy nukleových kyselin
lineární molekuly- mají volné konce a mohou být: jednořetězcové DNA nebo RNA dvouřetězcové DNA nebo RNA kružnicové molekuly – nemají volné konce a mohou být: tří až čtyřřetězcové molekuly DNA jednořetězcové se označují ss = single stranded dvouřetězcové ds = double stranded

9 Watson-Crieckovo párování bází
Podle tohoto pravidla se prostřednictvím vodíkových vazeb páruje: adenin s thyminem A=T cytozin s guaninem C=G v RNA a při interakcích DNA-RNA se páruje Adenin s uracilem A=U nukleotidové sekvence, které se spojují tímto způsobem se označují jako komplementární

10 Obrácené Watson-Crieckovo párování bází
uplatňuje se u DNA tvořené paralelními polynukleotidovými řetězci

11 SEKUNDÁRNÍ STRUKTURA NUKLEOVÝCH KYSELIN

12 základní druhy konformace DNA jsou A,B,Z

13 Denaturace dvoušroubovicové DNA
Přechod dvoušroubovicové DNA v samostatné polynukleotidové řetězce se označuje jako denaturace DNA K denaturaci DNA dochází nejčastěji: zvýšením teploty za alkalických podmínek teplota, při které dochází k denaturaci závisí na obsahu G a C v DNA čím více párů G-C DNA obsahuje, tím větší teploty je potřeba k její denaturaci rozmezí denaturačních teplot je asi °C

14 denaturaci DNA provází tzv. hyperchromní efekt tj
denaturaci DNA provází tzv. hyperchromní efekt tj. dochází ke zvýšení absorbance UV- světla závislost absorbance UV-světla o vlnové délce 260 nm roztoku dvoušroubovicové DNA na teplotě má tvar sigmoidální křivky teplota, při níž zdenaturovalo 50 % dsDNA se označuje jako teplota tání Tm

15 Hybridizace DNA

16 Různé hybridizační podmínky umožňují vytvoření dvojšroubovice s některými nespárovanými nukleotidy

17 TERCIÁRNÍ STRUKTURA DNA
má podobu nadšroubovice = superhelixu parametry charakterizující nadšroubovici jsou: změny v celkovém čísle vinutí katalyzují enzymy zvané topoizomerázy