Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Ziheng Yang Bill Pearson Aidan Budd Nick Goldman.

Podobné prezentace


Prezentace na téma: "Ziheng Yang Bill Pearson Aidan Budd Nick Goldman."— Transkript prezentace:

1 Ziheng Yang Bill Pearson Aidan Budd Nick Goldman

2 Alignment nekódující DNA (Ari Loytynoja)

3 Radka Storchová Koalescenční modely divergence populací

4 Wright-Fisher model Sir Ronald Fisher Sewall Wright

5 MRCA Teorie koalescence John Kingman

6 Isolation with Migration (IM) NANA N1N1 N2N2 t m1 m2 Koalescenční modely

7 Migrate, Lamarck m1 m2 m3 m4 m5 m6 N1N1 N2N2 N3N3 Koalescenční modely

8 MCMC coal N1N1 N2N2 N3N3 NANA t1t1 t2t2 Koalescenční modely

9 Aplikace „Isolation with Migration“ modelu na dva druhy slavíků NANA N1N1 N2N2 t m1 m2

10 IM Vstupní data nukleotidové sekvence/mikrosatelity předpoklady - neutralita - žádná rekombinace v rámci lokusu - volná rekombinace mezi lokusy mutační rychlost

11 ima -i IM_input.txt -o IM_output5.out -q1 10 -m m t 4 -b l 1.0 -fg -n 15 -g g p1345 -s Příklad jak spustit IMa program: IM Odhad parametrů pomocí Markov Chain Monte Carlo (MCMC) simulací

12 Výstup 3 simulace (1) pro všechny geny, (2) pro autosomální geny, (3) pro Z-vázané geny all chrA chrZ IM Nm t


Stáhnout ppt "Ziheng Yang Bill Pearson Aidan Budd Nick Goldman."

Podobné prezentace


Reklamy Google