Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller Technologie DNA mikročipů aplikace v oblasti klinické genetiky.

Podobné prezentace


Prezentace na téma: "Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller Technologie DNA mikročipů aplikace v oblasti klinické genetiky."— Transkript prezentace:

1 Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller Technologie DNA mikročipů aplikace v oblasti klinické genetiky

2 Princip Hybridizace značených nukleových kyselin se sondami imobilizovanými v pravidelném uspořádání na pevné matrici. Metoda umožňuje paralelní sledování jednotlivých hybridizačních reakcí komplexního vzorku. „globální experiment“

3 Dvojí technologie cDNA mikročipy oligonukleotidové mikročipy

4 cDNA mikročipy Skleněná nebo nylonová matrice Sondy tvořeny produkty PCR Nanesení sond robotem (dispensing) Poly-L-lysinové linkery

5 Oligonukleotidové mikročipy Matrice výhradně skleněná Sondy syntetizovány „in silico“ Nanesení sond fotolitograficky Linkery-fotosenzitivní, vázané na Si-OH

6 Oligonukleotidové mikročipy Výhody: - vysoká hustota spotů - malé množství vzorku - dobrá reprodukovatelnos Nevýhody: - vysoké pořizovací náklady - nízká flexibilita ve fázi návrhu

7 cDNA mikročipy Výhody: - dostupnost vlastního návrhu - nižší výrobní náklady Nevýhody: - velké množství nanášeného vzorku - menší počet spotů - snížená reprodukovatelnost

8 Podstata techniky DNA mikročipů

9 Aplikace oligonukleotidových mikročipů Analýza expresního profilu Screening polymorfismu Specifické analýzy Analýza genotypu (Drosophila, Arabidopsis) …

10 Analýza expresního profilu DNA čip – „fotografie transkriptomu v daném okamžiku“ původ tkáně stádium ontogenetického vývoje pohlaví fáze biorytmu patofyziologický stav

11 Skrýnynk polymorfismu Možnost sledování SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) Ztráta heterozygotnosti LOH (loss of heterozigosity)

12 Sledování specifických mutací např. p53

13 Aplikace cDNA čipů Klasifikace a stanovení prognózy onkologických onemocnění –nádory plic tlustého střeva prostaty –sarkomy –melanomy –lymfomy

14


Stáhnout ppt "Radovan Horák, Romana Zaoralová, Jiří Voller Technologie DNA mikročipů aplikace v oblasti klinické genetiky."

Podobné prezentace


Reklamy Google