Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Molekulárně genetická vyšetření detekce mutací vyhledávání asymptomatických přenašečů vyhledávání přenašeček X vázaných onemocnění identifikace jedinců-

Podobné prezentace


Prezentace na téma: "Molekulárně genetická vyšetření detekce mutací vyhledávání asymptomatických přenašečů vyhledávání přenašeček X vázaných onemocnění identifikace jedinců-"— Transkript prezentace:

1 Molekulárně genetická vyšetření detekce mutací vyhledávání asymptomatických přenašečů vyhledávání přenašeček X vázaných onemocnění identifikace jedinců- paternita testování predispozice k onemocnění s rodinným výskytem prenatální vyšetření onkogenetika

2 DNA diagnostika dědičných chorob Přímá mutační analýza - přímo detekuje chybnou informaci - mutaci, má diagnostickou výpovědní hodnotu. Nepřímá segregační analýza - využívá variabilních míst lidského genomu, v rodinách s jednoznačnou klinickou dg. u probanda pak může určit nositele patologické formy genu, v žádném případě nepotvrzuje diagnosu u probanda.

3 DNA analýza OLG FNB Cystická fibrosa Duchenneova/Beckerova svalová dystrofie Neurofibromatosa I Neurofibromatosa II Myotonická dystrofie Maligní hypertermie Hemofilie A Syndrom dlouhého QT intervalu Y-chromosom-SRY, DAZ, sex-test MCAD - mutace A958G Exprese T-H genu - neuroblastom Synovial sarcoma - detekce t (X,18)

4 DNA analýza ČR, EU Databáze pracovišť DNA diagnsostiky v České republice EDDNAL NCBI OMIM

5 Počty vyšetřených pacientů konzultace postnatálně karyotyp prenatálně karyotyp DNA pacienti DNA vyšetření FISH onkocytogenetika RNA vyšetření

6 Cystická fibrosa Lokalizace 7q Frekvence nemocných v ČR cca 1/2000 – 1/3000 Frekvence přenašečů v ČR cca 1/25-1/29 Gen zmapován v roce 1989 V roce 2002 známo 1002 mutace dýchací trakt játra pankreas tenké střevo reprodukce potní žlázy

7 Rozložení mutací v CFTR genu Závažnost CF závisí na lokalizaci mutace nejzávažnější v : EX 10, 11, 12, 20, 21 - kódují NBD domény EX 3, 4, 7 - kódují transmembránové domény

8 Indikační skupiny CF – podezření na cystickou fibrosu, CF v rodě Infertilita – opakované aborty, sterilita, neúspěšné IVF cykly Vyšetření dárců gamet PS -vyšetření příbuzných partnerů Jiná zátěž v rodě

9 Nejčastější mutace CFTR genu v české populaci 1. dF508 68,8% CFTRdele 2,3 (21kb) 4,64% 2, 3 3. G551D 4,03% 11 4.N1303K 3,02% G542X 2,22% G-A 2,04% intron delT 1,11% R347P 0,74% 7 9. W1282X 0,55% E92X 0,37% R1162X 0,37% 19 MUTACE ČETNOST VÝSKYTU U CF PAC. EXON V ČR

10 Strategie vyšetření Od roku 1992 nejčastější mutace dF508 Od roku 1997 dF508 + screening exonu 11 – mutace G542X, G551D a R553X Od roku 2000 základní mutační analýza – mutace dF508, G542X, G551D, R553X + od roku 2000 mutace CFTR dele 2,3(21kb) U pacientů s podezřením na CF a u partnerů heterozygotů rozšířená mutační analýza – 8 ev CFTR dele 2,321kb) - celkem 30 mutací Sekvenace celého CFTR genu Prenatální diagnostika Preimplantační genetická diagnostika - příprava

11 Základní mutační analýza Mutacelokalizace dF508ex 10 del2,3(21kb)ex 2,3 G542Xex 11 G551Dex 11 R553Xex 11 Frekvence v ČR cca 80%

12 Rozšířená analýza Inno-lipa 8 mutací Ex 10…..dF508, dl507 Ex 20…..W1282X Ex11..…G542X,G551D (GtoA), R553X Ex 21…..N1303K Frekvence cca 85% Inno-lipa 12 mutací Ex 10……dF508, dl507 In10/ex11…G542X, G-A, G551D, R553X, R560T, Q552X Ex 20……W1282X, S1251N, 3905insT Ex 21 ……N1303K + dele 2,3(21kb) Frekvence cca 85 %

13 Inno-lipa 17 mutací Ex 3…394delTT, G85E, E60X Ex/in4…621+1GtoT, R117H Ex 7…1078delT, R347P, R334W Ex 13…2143delT, 2183AAtoG, 2184delA In 5…711+5GtoA In 14b…2789+5GtoA Ex 19…R1162X 3659delC In 19… kbCtoT In 8/Ex 9…A455E, 5T, 7T, 9T CFTRdele(2,3) Frekvence cca 95%

14 Počet vyšetření IndikacePočet vyš.Heterozyg.Nemocní CF Infertilita Dárci19950 Příbuzní p Zátěž8520 Celkem

15 Záchyt heterozygotů

16 Indikace Cystická fibrosa - heterozygoti GenotypPočet dF508 / non87 G542X / non8 CFRTdele 2,3(21kb) / n7 R553X / non kb CtoT / non5 R347P / non GtoA / non2

17 Cystická fibrosa – genotyp nemocných GenotypPočetGenotypPočet dF508/dF508 8 CFTRdele2,3/ dF508/CFTRdele2,3 2 G542X/G542X 1 dF508/G542X 1 W1282X/N1303k 2 dF508/R553X 1 R347P/ dF508/R347P 1 dF508/5T 1 dF408/

18


Stáhnout ppt "Molekulárně genetická vyšetření detekce mutací vyhledávání asymptomatických přenašečů vyhledávání přenašeček X vázaných onemocnění identifikace jedinců-"

Podobné prezentace


Reklamy Google