Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Prezentace se nahrává, počkejte prosím

Bakteriální oxidace uhlovodíků Bakteriální oxidace uhlovodíků 2 e–2 e–2 e–2 e– NADH CH 4 CH 3 OH O2O2O2O2 H2OH2OH2OH2O Fe 2 S 2 FAD R Fe O H B B   

Podobné prezentace


Prezentace na téma: "Bakteriální oxidace uhlovodíků Bakteriální oxidace uhlovodíků 2 e–2 e–2 e–2 e– NADH CH 4 CH 3 OH O2O2O2O2 H2OH2OH2OH2O Fe 2 S 2 FAD R Fe O H B B   "— Transkript prezentace:

1 Bakteriální oxidace uhlovodíků Bakteriální oxidace uhlovodíků 2 e–2 e–2 e–2 e– NADH CH 4 CH 3 OH O2O2O2O2 H2OH2OH2OH2O Fe 2 S 2 FAD R Fe O H B B       Fe 2 III + O 2 H – Fe 2 IV = O H2OH2O PFe III + O 2 H – PFe V = O H2OH2O •PFe IV = O

2 Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků II Fe II hem II Fe II III Fe III II Fe II III Fe III IV Fe IV + III Fe III V Fe V – – CO + CO O2O2 e–e– e–e– H2OH2OR–HR–H H2OH2O R–OH H2OH2O 2 H+2 H+ XOH XOOH Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků

3 Ferredoxin Fe Gly 12 Fe Fe Fe Cys 11 Cys 14 Ala 13 S S S S S S

4 analoga: 4 – * 3 – * 2 – * 1 – analoga: [Fe 4 S 4 (SR) 4 ] 4 – *[Fe 4 S 4 (SR) 4 ] 3 – *[Fe 4 S 4 (SR) 4 ] 2 – *[Fe 4 S 4 (SR) 4 ] 1 – Ferredoxin Změny náboje a oxidačních stavů železa ve ferredoxinu Změny náboje a oxidačních stavů železa ve ferredoxinu: 4II3IIIII2II2IIIII3III 4 Fe(II) 3 Fe(II) + Fe(III) 2 Fe(II) + 2 Fe(III) Fe(II) + 3 Fe(III) [ 4 Fe – 4 S ] 0 [ 4 Fe – 4 S ] 1+ [ 4 Fe – 4 S ] 2+ [ 4 Fe – 4 S ] 3+ proteiny: — Fd red Fd ox / HP red HP ox + 0,1 + 0,1 až + 0,3 V – 0,3 – 0,3 až – 0,5 V Fd Fd = ferredoxin HP HP = „high-potencial“ protein * * izolováno

5 Fe – S klastry Ferredoxin Fe Fe Fe Fe S S S SRSRSRSR SRSRSRSR RSRSRSRS RSRSRSRS – 2,269 Å 2,208 Å S 2,233 Å Fe Fe Fe Fe S S S SRSRSRSR SRSRSRSR RSRSRSRS RSRSRSRS 2–2–2–2– 2,296 Å 2,263 Å S 2,267 Å Fe Fe Fe Fe S S S SRSRSRSR SRSRSRSR RSRSRSRS RSRSRSRS 3–3–3–3– 2,286 Å 2,295 Å S 2,354 Å Fe 4 S 4 (SR) 4 – Fe 4 S 4 (SR) 4 2– Fe 4 S 4 (SR) 4 3–

6 Transport elektronu přes ferredoxin A BC

7 Tvorba radikálů Methionin S-adenosyl methionin

8 Fe – S klastry I Fe – S klastry (I)

9 Fe – S klastry I I Fe – S klastry (I I)

10 Syntézy FeS klastrů [FeCl 4 ] 2– [Fe(SEt) 4 ] 2– 4 NaSEt, MeCN [Fe 3 S 4 (SEt) 4 ] 3– [Fe 3 S 4 (SR) 4 ] 3– [Fe 4 S 4 (SEt) 4 ] 2– [Fe 2 S 2 (SEt) 4 ] 2– [Fe 6 S 9 (SEt) 2 ] 4– [Fe 6 S 9 (SR) 2 ] 4– 1,4 S; Me 2 CO 4 RSH, MeCN 2 RSH, MeCN 60 ºC, MeCN 1,5 S; 85 ºC; MeCN 1 S; MeCN 80 ºC, MeCN MeCN 1 FeCl 2, 1 NaSEt

11 Chlorofyl R ’ R ’ R ’ R ’ R Mg hydrofobní řetězec a R a : R = CH 3 b R b : R = CHO

12 Chlorofyl 2 feofytiny ne-hemové 2 feofytiny ne-hemové 4 hemy 4 chlorofyly 2 chinony železo 4 hemy 4 chlorofyly 2 chinony železo Umístění atomů železa v chlorofylu

13 Fotosyntéza – „Z“-schema P 680 P 700

14 Fotosyntéza – „Z“-schema Fotosystém II Fotosystém I Tok elektronů ve fotosystémech I a II

15 P680 MnMnMn Mn Fotosyntéza 2 H2O  O2 + 4 H e– S 0  S 1  S 2  S 3  S 4 O2O2O2O2 Klastr čtyř atomů Mn

16 Fotosyntéza 2 H 2 O  O H e – S 0  S 1  S 2  S 3  S 4 O2O2O2O2 S0 (S0 )S0 (S0 ) III – H+– H+ H O H2OH2O

17 S1 (S1 )S1 (S1 ) – e– e – H+– H+ IV H O O Fotosyntéza 2 H 2 O  O H e – S 0  S 1  S 2  S 3  S 4 O2O2O2O2

18 S2 (S2 )S2 (S2 ) III – e– e IV O O O O Fotosyntéza 2 H 2 O  O H e – S 0  S 1  S 2  S 3  S 4 O2O2O2O2

19 Fotosyntéza 2 H 2 O  O H e – S 0  S 1  S 2  S 3  S 4 O2O2O2O2 S3 (S3 )S3 (S3 ) III – e– e IV O – e – 2H +

20 Fotosyntéza 2 H 2 O  O H e – S 0  S 1  S 2  S 3  S 4 O2O2O2O2 III – 2 H+– 2 H+ IV O O S4 (S4 )S4 (S4 ) S0S0S0S0 + H2O+ H2O O O O

21 Modelové sloučeniny klastrů manganu [Mn 4 O 2 ac 7 bipy 2 ] [Mn 4 O 2 ac 6 bipy 2 ] [Mn 3 O 3 Cl 4 ac 3 py 2 ]

22 Corrin N N N NH Co N N N N

23 Vitamín B-12 (kobalamin) Co + R a) R = CH 3 methylkobalamin. b) R = H 2 O aquokobalamin. c) R = – C  N – kyanokobalamin B-12 (vitamin B-12). d) R = adenosylkobalamin B-12 (koenzym B-12)

24 Koenzym B-12

25 Příklady reakcí katalyzovaných vitamínem B-12 Záměna funkčních skupin Přenos methylu Ribonukleotid reduktáza Glutamát mutáza Redukce ribonukleotid Diol dehydratáza deoxyribonukleotid + + – Methionin syntetáza

26 Obecné schema mechanismu isomerázy závislé na adenosyl-kobaltaminu

27 Methionin syntetáza

28

29 Methyl transferáza

30 K atalytický mechanismus záměny funkčních skupin


Stáhnout ppt "Bakteriální oxidace uhlovodíků Bakteriální oxidace uhlovodíků 2 e–2 e–2 e–2 e– NADH CH 4 CH 3 OH O2O2O2O2 H2OH2OH2OH2O Fe 2 S 2 FAD R Fe O H B B   "

Podobné prezentace


Reklamy Google